SD
Sanjoy Dutta
Author with expertise in Epidemiology and Management of Fungal Infections
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(100% Open Access)
Cited by:
3
h-index:
23
/
i10-index:
33
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Expansion microscopy reveals characteristic ultrastructural features of pathogenic budding yeast species

Md. Reza et al.Jul 25, 2024
+3
R
S
M
Candida albicans is the most prevalent fungal pathogen associated with candidemia. Similar to other fungi, the complex life cycle of C. albicans has been challenging to study with high-resolution microscopy due to its small size. Here, we employed ultrastructure expansion microscopy (U-ExM) to directly visualise subcellular structures at high resolution in the yeast and during its transition to hyphal growth. N-hydroxysuccinimide (NHS)-ester pan-labelling in combination with immunofluorescence via snapshots of various mitotic stages provided a comprehensive map of nucleolar and mitochondrial segregation dynamics and enabled the resolution of the inner and outer plaque of spindle pole bodies (SPBs). Analyses of microtubules (MTs) and SPBs suggest that C. albicans displays a side-by-side SPB arrangement with a short mitotic spindle and longer astral MTs (aMTs) at the pre-anaphase stage. Modifications to the established U-ExM protocol enabled the expansion of six other human fungal pathogens, revealing that the side-by-side SPB configuration is a plausibly conserved feature shared by many fungal species. We highlight the power of U-ExM to investigate subcellular organisation at high resolution and low cost in poorly studied and medically relevant microbial pathogens.
0
Citation1
0
Save
0

Expansion microscopy reveals unique ultrastructural features of pathogenic budding yeast species

Md. Reza et al.Feb 21, 2024
+3
H
S
M
Abstract Candida albicans is the most prevalent fungal pathogen isolated from patients with candidemia. As is the case for many other fungi, the complex life cycle of C. albicans has been challenging to study with high-resolution microscopy techniques due to its small size. We employed ultrastructure expansion microscopy (U-ExM) to directly visualise sub-cellular structures at high resolution in the C. albicans yeast and during its transition to hyphal growth. NHS-ester pan-labelling in combination with immunofluorescence (IF) provided the first comprehensive map of nucleolar and mitochondrial dynamics through the C. albicans cell cycle. Analysis of microtubules (MTs) and spindle pole bodies (SPBs) stained with marker proteins suggests that contrary to the pole-to-pole arrangement observed in Saccharomyces cerevisiae, C. albicans yeast cells display a unique side-by-side arrangement of SPBs with a short mitotic spindle and longer astral MTs (aMTs) at the pre-anaphase stage. Modifications to the established U-ExM protocol enabled the expansion of several medically relevant human fungal pathogens, revealing that the side-by-side SPB configuration is a plausible conserved feature shared by many fungal species. We highlight the power of U-ExM to investigate sub-cellular organisation and organellar dynamics at high resolution and low cost in poorly studied, medically relevant microbial pathogens.
0
Citation1
0
Save
0

Consensus guidance for monitoring individuals with islet autoantibody-positive pre-stage 3 type 1 diabetes

Moshe Phillip et al.Jun 24, 2024
+63
A
P
M
Given the proven benefits of screening to reduce diabetic ketoacidosis (DKA) likelihood at the time of stage 3 type 1 diabetes diagnosis, and emerging availability of therapy to delay disease progression, type 1 diabetes screening programmes are being increasingly emphasised. Once broadly implemented, screening initiatives will identify significant numbers of islet autoantibody-positive (IAb
0
Citation1
0
Save
0

Cohort profile: the ‘Biomarkers of heterogeneity in type 1 diabetes’ study—a national prospective cohort study of clinical and metabolic phenotyping of individuals with long-standing type 1 diabetes in the Netherlands

Henk‐Jan Aanstoot et al.Jun 1, 2024
+21
D
R
H
Purpose The ‘Biomarkers of heterogeneity in type 1 diabetes’ study cohort was set up to identify genetic, physiological and psychosocial factors explaining the observed heterogeneity in disease progression and the development of complications in people with long-standing type 1 diabetes (T1D). Participants Data and samples were collected in two subsets. A prospective cohort of 611 participants aged ≥16 years with ≥5 years T1D duration from four Dutch Diabetes clinics between 2016 and 2021 (median age 32 years; median diabetes duration 12 years; 59% female; mean glycated haemoglobin (HbA1c) 61 mmol/mol (7.7%); 61% on insulin pump; 23% on continuous glucose monitoring (CGM)). Physical assessments were performed, blood and urine samples were collected, and participants completed questionnaires. A subgroup of participants underwent mixed-meal tolerance tests (MMTTs) at baseline (n=169) and at 1-year follow-up (n=104). Genetic data and linkage to medical and administrative records were also available. A second cross-sectional cohort included participants with ≥35 years of T1D duration (currently n=160; median age 64 years; median diabetes duration 45 years; 45% female; mean HbA1c 58 mmol/mol (7.4%); 51% on insulin pump; 83% on CGM), recruited from five centres and measurements, samples and 5-year retrospective data were collected. Findings to date Stimulated residual C-peptide was detectable in an additional 10% of individuals compared with fasting residual C-peptide secretion. MMTT measurements at 90 min and 120 min showed good concordance with the MMTT total area under the curve. An overall decrease of C-peptide at 1-year follow-up was observed. Fasting residual C-peptide secretion is associated with a decreased risk of impaired awareness of hypoglycaemia. Future plans Research groups are invited to consider the use of these data and the sample collection. Future work will include additional hormones, beta-cell-directed autoimmunity, specific immune markers, microRNAs, metabolomics and gene expression data, combined with glucometrics, anthropometric and clinical data, and additional markers of residual beta-cell function. Trial registration number NCT04977635 .