JW
John Withington
Author with expertise in Advancements in Prostate Cancer Research
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
418
h-index:
15
/
i10-index:
19
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

COMPARISONS OF STRUCTURE AND LIFE SPAN IN ROOTS AND LEAVES AMONG TEMPERATE TREES

John Withington et al.Aug 1, 2006
Global data sets provide strong evidence of convergence for leaf structure with leaf longevity such that species having thick leaves, low specific leaf area, low mass-based nitrogen concentrations, and low photosynthetic rates typically exhibit long leaf life span. Leaf longevity and corresponding leaf structure have also been widely linked to plant potential growth rate, plant competition, and nutrient cycling. We hypothesized that selection forces leading to variation in leaf longevity and leaf structure have acted simultaneously and in similar directions on the longevity and structure of the finest root orders. Our four-year study investigated the links between root and leaf life span and root and leaf structure among 11 north-temperate tree species in a common garden in central Poland. Study species included the hardwoods Acer pseudoplatanus L., Acer platanoides L., Fagus sylvatica L., Quercus robur L., and Tilia cordata Mill.; and the conifers Abies alba Mill., Larix decidua Mill., Picea abies (L.) Karst., Pinus nigra Arnold, Pinus sylvestris L., and Pseudotsuga menziesii (Mirbel) Franco. Leaf life span, estimated by phenological observations and needle cohort measurements, ranged from 0.5 to 8 yr among species. Median fine-root life span, estimated using minirhizotron images of individual roots, ranged from 0.5 to 2.5 yr among species. Root life span was not correlated with leaf life span, but specific root length was significantly correlated with specific leaf area. Root nitrogen : carbon ratio was negatively correlated with root longevity, which corroborates previous research that has suggested a trade-off between organ life span and higher organ N concentrations. Specific traits such as thickened outer tangential walls of the exodermis were better predictors of long-lived roots than tissue density or specific root length, which have been correlated with life span in previous studies. Although theories linking organ structure and function suggest that similar root and leaf traits should be linked to life span and that root and leaf life span should be positively correlated, our results suggest that tissue structure and longevity aboveground (leaves) can contrast markedly with that belowground (roots).
0
Citation418
0
Save
0

How clinically relevant are prostate cancer cell lines? A comprehensive characterisation and multiomics comparison.

Zahra Ahmed et al.Mar 21, 2024
Abstract Cell line experiments arguably remain the most used tool in preclinical cancer research, despite their limitations. With almost 95% drugs entering human trials failing, and up to 90% preclinical research failing before even being tested in humans, we must shift the pre-clinical paradigm. A range of in silico, in vitro, in vivo and ex vivo approaches are gaining popularity, with the aim of potentially replacing cell line use. However, we cannot ignore the plethora of historical data from cell lines, nor write off their future use– especially within advanced bioengineered models. Therefore, we must question if and how cell lines hold clinical relevance. This study evaluates the clinical characteristics of 46 prostate cancer cell lines against worldwide data and investigates the biological features of seven cell lines in depth, comparing them to over 10,000 well characterised human cases from 24 studies in nine countries. Clinical features compared included age, ethnicity, Gleason grade, cancer type, treatment history and multiomics variables included mutations, copy number alterations, structural variants, microsatellite instability, mRNA and protein expression, and tumour mutational burden. We found that the most used cell lines accurately represent a minute proportion of prostate cancer patients. Furthermore, we recommend a pipeline for tailoring selection of clinically relevant cell lines with the ultimate aim of increasing the scientific methodology behind choosing a cell line.