AA
Abdul Awan
Author with expertise in Probiotics and Prebiotics
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(100% Open Access)
Cited by:
1
h-index:
2
/
i10-index:
0
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Dietary protein source strongly alters gut microbiota composition and function

J. Blakeley-Ruiz et al.Apr 5, 2024
The source of protein in a persons diet affects their total life expectancy. However, the mechanisms by which dietary protein sources differentially impact human health and life expectancy are poorly understood. Dietary choices have major impacts on the composition and function of the intestinal microbiota that ultimately mediate host health. This raises the possibility that health outcomes based on dietary protein sources might be driven by interactions between dietary protein and the gut microbiota. In this study, we determine the effects of seven different sources of dietary protein on the gut microbiota in mice. We apply an integrated metagenomics-metaproteomics approach to simultaneously investigate the effects of these dietary protein sources on the gut microbiotas composition and function. The protein abundances measured by metaproteomics can provide microbial species abundances, and evidence for the phenotype of microbiota members on the molecular level because measured proteins allow us to infer the metabolic and physiological processes used by a microbial community. We showed that dietary protein source significantly altered the species composition and overall function of the gut microbiota. Different dietary protein sources led to changes in the abundance of microbial amino acid degrading proteins and proteins involved in the degradation of glycosylations on dietary protein. In particular, brown rice and egg white protein increased the abundance of amino acid degrading enzymes and egg white protein increased the abundance of bacteria and proteins usually associated with the degradation of the intestinal mucus barrier. These results show that dietary protein source can change the gut microbiotas metabolism, which could have major implications in the context of gut microbiota mediated diseases.
0
Citation1
0
Save
0

Effective seed sterilization methods require optimization across maize genotypes

J. Parnell et al.Dec 15, 2023
Abstract Studies of plant-microbe interactions using synthetic microbial communities (SynComs) often require the removal of seed-associated microbes by seed sterilization prior to inoculation to provide gnotobiotic growth conditions. A diversity of seed sterilization protocols have been developed in the past and have been used on different plant species with various amounts of validation. From these studies it has become clear that each plant species requires its own optimized sterilization protocol. It has, however, so far not been tested if the same protocol works equally well for different varieties and seed sources of one plant species. We evaluated six seed sterilization protocols on two different varieties (Sugar Bun & B73) of maize. All unsterilized maize seeds showed fungal growth upon germination on filter paper, highlighting the need for a sterilization protocol. A short sterilization protocol with hypochlorite and ethanol was sufficient to prevent fungal growth on Sugar Bun germinants, however a longer protocol with heat treatment and germination in fungicide was needed to obtain clean B73 germinants. This difference may have arisen from the effect of either genotype or seed source. We then tested the protocol that performed best for B73 on three additional maize genotypes from four sources. Seed germination rates and fungal contamination levels varied widely by genotype and geographic source of seeds. Our study shows that consideration of both variety and seed source is important when optimizing sterilization protocols and highlights the importance of including seed source information in plant-microbe interaction studies that use sterilized seeds.
0

Efficacy and Safety of Rivaroxaban Versus Enoxaparin in Prevention of Recurrence of Venous Thrombo-Embolism Events in Cancer Patients: A Meta-Analysis

Abdul Awan et al.Jan 1, 2024
Objective To examine the effectiveness of rivaroxaban compared to enoxaparin in patients diagnosed with cancer and venous thromboembolism. Methods A search of Pub Med, Scopus, and Google Scholar, from inception through April 2023 was conducted. Articles comparing rivaroxaban with enoxaparin in patients with cancer and VTE/PE/DVT were included. Review Manager Version 5.2 was utilised for the analysis of the following outcomes; VTE, PE, DVT, major bleeding, and mortality. Results A total of 8 articles and 2276 patients were included in the final analysis. Pooled analysis showed that rivaroxaban had a statistically insignificant reduced association with VTE occurrence (RR:0.83, 95% CI:0.58–1.18, P:0.3) as well as a statically insignificant reduction in major bleeding (RR:0.79, 95% CI:0.53–1.18, P:0.25). Analysis showcased that there was an insignificant reduction of mortality rivaroxaban as compared to enoxaparin (RR:0.74, 95% CI: 0.46–1.20, P:0.23). Conclusion Rivaroxaban can serve as a viable alternative to enoxaparin, with no appreciable drawbacks, for preventing and managing VTE in patients with malignancy.
0

Generalized Fatigue: Why Post-Polio Syndrome Should Be Included as A Differential Diagnosis

Hira Saleem et al.Nov 17, 2024
Dear Editor, Post-Polio Syndrome (PPS) is a neurological condition that manifests in the form of non-specific symptoms such as fatigue, sleep dysfunction, muscle and bone pains, at least 15 years after the initial infection with polio virus. Multiple mechanisms have been suggested to describe the pathogenesis of PPS, with some studies attributing it to accommodative changes in the muscle fibers, with replacement of type II fibers by type I fibers and muscle hypertrophy. It has also been postulated that the virus may persist unknowingly or be reactivated. Additionally, inflammatory and autoimmune causes have also been hypothesized.1 Among the symptoms, fatigue, muscle weakness with atrophy and motor dysfunction are the most common ones to be reported in PPS, associated with significant morbidity in patients. 2 Owing to the non availability of diagnostic tests for this condition, PPS remains a diagnosis of exclusion with factors such as a confirmation of previous polio infection and subsequent resolution characterized by neurologic stability for more than 15 years, abrupt onset of neurologic symptoms with persistence for one year, and exclusion of other possible attributable medical conditions established as essential parts of its diagnostic criteria. 3 The management of the condition is mainly based on physical therapy, and previous researches based on the use of drugs such as pyridostigmine, steroids, and IV immunoglobulins have shown limited efficacy in the improvement of the prognosis and condition of PPS patients.2 As of today, Pakistan remains among the three countries where the transmission of polio virus is prevalent, with the majority of outcomes in the past twenty years attributed to areas in the northern transmission zone bordering eastern Afghanistan, such as Khyber Pakhtunkhwa and Federally Administered Tribal Areas, and those in the southern transmission zone including southern Punjab, northern Sindh and Karachi.4 According to the Pakistan Polio Eradication Programme, 354 cases of polio virus have been reported in Pakistan from 2015-2024, with the highest number of infections occurring in Khyber Pakhtunkhwa. This is in contrast to the 20,000 cases reported in the early 1990s prior to immunization efforts.5 Statistically, 15-20 million people across the globe still suffer from the sequelae of infection with the virus.1 Additionally, it has been postulated that about 25 to 40 percent of such survivors of poliomyelitis will experience PPS at some point in their lifetime. ---Continue