Abstract Tropical and subtropical trees provide key ecosystem services but are facing global population decline due to logging, habitat degradation, land conversion, and climate change. Vatica guangxiensis used to be a characteristic timber species of China's tropical forests but is now terminally endangered (280 individuals) and fragmented into three relictual populations in southwest China. Generating genome‐wide DNA for ∼82% of all living tree individuals of this species complex, we found evidence for a late Pliocene division into two species‐level lineages that have not had gene flow for approximately 3 million years. All three relictual populations exhibited a loss of genetic diversity and recent bottlenecks. In addition, forward simulations indicated a likely population collapse in all three populations within the next century. Our study generates a model framework for the integration of genomic evidence—including evolutionary history, current genetic variation, and future projections—into conservation planning.

Abstract Cold waves restrict the distribution of mangroves. This study examined the contribution of PSII heterogeneity and stomatal functioning to sustaining photochemistry and photoprotection in mangroves during a cold wave. We exposed eight populations of Kandelia obovata (cold-tolerant) and, Bruguiera gymnorhiza (cold-susceptible) from different latitudes to 27/20°C (favorable) and 10/3°C (chilling; simulated cold wave) day and night temperatures. Multiple trait responses imply that cold waves affected K. obovata the least. Significant changes in chlorophyll fluorescence transients (photosystem II [PSII]) with a slight decrease in the redox status of P700 (photosystem I [PSI]) imply a greater impact of a cold wave on PSII. During the cold wave, photochemical efficiency of PSII, efficiency of the water-splitting complex, light absorptance, stomatal pore area, cyclic electron flow, nonphotochemical quenching, and number of active PSIIα and PSII QB reducing centers decreased, while light transmittance, night respiration, and inactive PSII QB nonreducing, PSIIβ, and γ centers increased in both species. The population of K. obovata from the coldest latitudinal site (Fujian, China) was least affected by cold wave due to local evolutionary adaptations. Modulation of PSII heterogeneity and stomatal functioning is important to sustaining photochemistry and photoprotection in mangroves to cope with cold waves. Highlights PSII heterogeneity and stomatal functioning support mangroves to cope with cold waves. Local evolutionary adaptations promote the cold tolerance of mangrove populations.

Summary Differences in demographic and environmental niches facilitate plant species coexistence in tropical forests. However, the adaptations that enable species to achieve higher demographic rates (e.g. growth or survival) or occupy unique environmental niches (e.g. waterlogged conditions) remain poorly understood. Anatomical traits may better predict plant environmental and demographic strategies because they are direct measurements of structures involved in these adaptations. We collected 18 leaf and twig traits from 29 tree species in a tropical freshwater swamp forest in Singapore. We estimated demographic parameters of the 29 species from growth and survival models, and degree of association toward swamp habitats. We examined pairwise trait–trait, trait–demography and trait–environment links while controlling for phylogeny. Leaf and twig anatomical traits were better predictors of all demographic parameters than other commonly measured leaf and wood traits. Plants with wider vessels had faster growth rates but lower survival rates. Leaf and spongy mesophyll thickness predicted swamp association. These findings demonstrate the utility of anatomical traits as indicators of plant hydraulic strategies and their links to growth–mortality trade‐offs and waterlogging stress tolerance that underlie species coexistence mechanisms in tropical forest trees.