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Alamzeb Khan
Author with expertise in Age-Related Macular Degeneration Research
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An intra-tumoral niche maintains and differentiates stem-like CD8 T cells

Caroline Jansen et al.Dec 11, 2019
Tumour-infiltrating lymphocytes are associated with a survival benefit in several tumour types and with the response to immunotherapy1–8. However, the reason some tumours have high CD8 T cell infiltration while others do not remains unclear. Here we investigate the requirements for maintaining a CD8 T cell response against human cancer. We find that CD8 T cells within tumours consist of distinct populations of terminally differentiated and stem-like cells. On proliferation, stem-like CD8 T cells give rise to more terminally differentiated, effector-molecule-expressing daughter cells. For many T cells to infiltrate the tumour, it is critical that this effector differentiation process occur. In addition, we show that these stem-like T cells reside in dense antigen-presenting-cell niches within the tumour, and that tumours that fail to form these structures are not extensively infiltrated by T cells. Patients with progressive disease lack these immune niches, suggesting that niche breakdown may be a key mechanism of immune escape. The authors examine the immune cell infiltrates of human tumours and provide evidence for a population of CD8 T cells with stem-cell characteristics and proliferative capacity that reside in an antigen-presenting niche within tumours.
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Rescuing Photoreceptors in RPE Dysfunction-Driven Retinal Degeneration: The Role of Small Extracellular Vesicles Secreted from Retinal Pigment Epithelium

Dimitrios Pollalis et al.Apr 13, 2024
Dysfunction of the retinal pigment epithelium (RPE) is a common shared pathology in major degenerative retinal diseases despite variations in the primary etiologies of each disease. Due to their demanding and indispensable functional roles throughout the lifetime, RPE cells are vulnerable to genetic predisposition, external stress, and aging processes. Building upon recent advancements in stem cell technology for differentiating healthy RPE cells and recognizing the significant roles of small extracellular vesicles (sEV) in cellular paracrine and autocrine actions, we investigated the hypothesis that the RPE-secreted sEV alone can restore essential RPE functions and rescue photoreceptors in RPE dysfunction-driven retinal degeneration. Our findings support the rationale for developing intravitreal treatment of sEV. We demonstrate that intravitreally delivered sEV effectively penetrate the full thickness of the retina. Xenogenic intraocular administration of human-derived EVs did not induce acute immune reactions in rodents. sEV derived from human embryonic stem cell (hESC)-derived fully differentiated RPE cells, but not sEV-depleted conditioned cell culture media (CCM minus sEV), rescued photoreceptors and their function in a Royal College of Surgeons (RCS) rat model. This model is characterized by photoreceptor death and retinal degeneration resulting from a mutation in the
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Structural and Functional Characterization of Novel Phosphotyrosine Phosphatase Protein from Drosophila Melanogaster (Pupal Retina)

Rahila Naz et al.Feb 20, 2022
Abstract A novel pair of protein Tyrosine Phosphatases in Drosophila Melanogaster (pupal retina) has been identified. Phosphotyrosyl protein phosphatases (PTPs) are structurally diverse enzymes increasingly recognized having fundamental role in cellular processes including effects on metabolism, cell proliferation and differentiation. This study presents comparative homology modeling of low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase (PTPs) from Drosophila melanogaster (Dr-PTPs) and their complexation with potent inhibitor HEPES. The 3D structure was predicted based on sequence homology with bovine heart low molecular weight PTPs (Bh-PTPs). The sequence homology is approximately 50% identical to each other and to low molecular weight protein tyrosine phosphatases (PTPs) in other species. Comparison of the 3D structures of Bh-PTPs and Dr-PTPs (primo-2) reveals a remarkable similarity having a four stranded central parallel β sheet with flanking α helices on both sides, showing two right-handed β-α-β motifs. The inhibitor shows similar binding features as seen in other PTPs. The study also highlights the key catalytic residues important for target recognition and PTPs activation. The structure guided studies of both proteins clearly reveal a common mechanism of action, inhibitor binding at the active site and will expected to contribute towards the basic understanding of functional association of this enzyme with other molecules.