The 5′-cap structure is a distinct feature of eukaryotic mRNAs, and eukaryotic viruses generally modify the 5′-end of viral RNAs to mimic cellular mRNA structure, which is important for RNA stability, protein translation and viral immune escape. SARS coronavirus (SARS-CoV) encodes two S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferases (MTase) which sequentially methylate the RNA cap at guanosine-N7 and ribose 2′-O positions, catalyzed by nsp14 N7-MTase and nsp16 2′-O-MTase, respectively. A unique feature for SARS-CoV is that nsp16 requires non-structural protein nsp10 as a stimulatory factor to execute its MTase activity. Here we report the biochemical characterization of SARS-CoV 2′-O-MTase and the crystal structure of nsp16/nsp10 complex bound with methyl donor SAM. We found that SARS-CoV nsp16 MTase methylated m7GpppA-RNA but not m7GpppG-RNA, which is in contrast with nsp14 MTase that functions in a sequence-independent manner. We demonstrated that nsp10 is required for nsp16 to bind both m7GpppA-RNA substrate and SAM cofactor. Structural analysis revealed that nsp16 possesses the canonical scaffold of MTase and associates with nsp10 at 1∶1 ratio. The structure of the nsp16/nsp10 interaction interface shows that nsp10 may stabilize the SAM-binding pocket and extend the substrate RNA-binding groove of nsp16, consistent with the findings in biochemical assays. These results suggest that nsp16/nsp10 interface may represent a better drug target than the viral MTase active site for developing highly specific anti-coronavirus drugs.

Long noncoding RNAs (lncRNA) play important roles in the tumorigenesis and progression of cancers. However, the clinical significance of lncRNAs and their regulatory mechanisms in nasopharyngeal carcinogenesis (NPC) are largely unknown. Here, based on a microarray analysis, we identified 384 dysregulated lncRNAs, of which, FAM225A was one of the most upregulated lncRNAs in NPC. FAM225A significantly associated with poor survival in NPC. N(6)-Methyladenosine (m6A) was highly enriched within FAM225A and enhanced its RNA stability. FAM225A functioned as an oncogenic lncRNA that promoted NPC cell proliferation, migration, invasion, tumor growth, and metastasis. Mechanistically, FAM225A functioned as a competing endogenous RNA (ceRNA) for sponging miR-590-3p and miR-1275, leading to the upregulation of their target integrin β3 (ITGB3), and the activation of FAK/PI3K/Akt signaling to promote NPC cell proliferation and invasion. In summary, our study reveals a potential ceRNA regulatory pathway in which FAM225A modulates ITGB3 expression by binding to miR-590-3p and miR-1275, ultimately promoting tumorigenesis and metastasis in NPC. SIGNIFICANCE: These findings demonstrate the clinical significance of the lncRNA FAM225A in nasopharyngeal carcinoma (NPC) and the regulatory mechanism involved in NPC development and progression, providing a novel prognostic indicator and promising therapeutic target.

HIV-1 envelope glycoprotein (Env) conformation substantially impacts antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC). Envs from primary HIV-1 isolates adopt a prefusion closed conformation, which is targeted by broadly-neutralizing antibodies (bnAbs). CD4 binding drives Env into more open conformations, which are recognized by non-neutralizing Abs (nnAbs). To better understand Env-Ab and Env-CD4 interaction in CD4+ T cells infected with HIV-1, we simultaneously measured antibody binding and HIV-1 mRNA expression using multiparametric flow cytometry and RNA-flow fluorescent in situ hybridization (FISH) techniques. We observed that env mRNA is almost exclusively expressed by HIV-1 productively-infected cells that already downmodulated CD4. This suggest that CD4 downmodulation precedes env mRNA expression. Consequently, productively-infected cells express closed Envs on their surface, which renders them resistant to nnAbs. Cells recognized by nnAbs were all env mRNA negative, indicating Ab binding through shed gp120 or virions attached to their surface. Consistent with these findings, treatment of HIV-1 infected humanized mice with the ADCC mediating nnAb A32 failed to lower viral replication or reduce the size of the viral reservoir. These findings confirm the resistance of productively-infected CD4+ T cells to nnAbs-mediated ADCC and question the rationale of immunotherapy approaches using this strategy.

Ferroptosis represents a newly programmed cell death, and the process is usually accompanied with iron-dependent lipid peroxidation. Importantly, ferroptosis is implicated in a myriad of diseases. Recent literature suggests a potential position of ferroptosis in the pathogenesis of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease (MAFLD), the most widespread liver ailment worldwide. Intriguingly, several functional genes and metabolic pathways central to ferroptosis are regulated by nuclear factor erythroid-derived 2-like 2 (NRF2). In current work, we aim to identify protocatechuic acid (PCA), a primary metabolite of antioxidant polyphenols, as a potent NRF2 activator and ferroptosis inhibitor in the hepatic lipotoxicity and steatosis models. Herein, both NRF2+/+ and NRF2−/− cell lines and mice were used to analyze the importance of NRF2 in PCA function, and hepatic lipotoxicity and steatosis models were induced by palmitic acid and high-fat diet respectively. Our results indicated that ferroptosis was mitigated by PCA intervention in hepatic cells. Furthermore, PCA exhibited therapeutic efficacy against ferroptosis, as well as hepatic lipotoxicity and steatosis. The protective role of PCA was predominantly mediated through NRF2 activation, potentially elucidating a pivotal mechanism underlying PCA's therapeutic impact on MAFLD. Additionally, the augmented mitochondrial TCA cycle activity observed in hepatic lipotoxicity and steatosis models was ameliorated by PCA, in part via NRF2-dependent pathways, further bolstering PCA's anti-ferroptosis properties. Collectively, our findings underscore PCA's potential in alleviating hepatic ferroptosis, lipotoxicity and steatosis via inducing activation of NRF2 signaling pathway, offering a promising strategy for the therapy of MAFLD as well as related lipid metabolic disorders.

Bladder cancer (BC) is the ninth most common and “expensive” cancer in the world. Despite the availability of various treatment modalities such as chemotherapy, immunotherapy and surgery, the overall survival rate of patients with advanced bladder cancer remains low. As one of the most abundant infiltrating immune cells in bladder cancer, tumor-associated macrophages (TAMs) play an important role in the development of BC and in the standard regimen of intravesical BCG therapy. Targeting TAMs have achieved excellent results in clinical trials for a variety of other cancers, but few studies have been conducted for bladder cancer. Further exploration is still needed to develop TAM-related therapeutic strategies for BC treatment, which are expected to improve the therapeutic efficacy and life quality of patients. This review summarizes the relationship between TAMs in bladder cancer and disease staging, evolution, patient prognosis, and treatment outcome. Several potential TAM targets in BC are also pointed, which may help to inhibit tumor-promoting TAMs and provide new therapeutic approaches for advanced BC.