Abstract Morbilliviruses are amongst the most contagious viral pathogens that infect mammals. Metagenomic surveys have identified numerous morbillivirus sequences in bats, but no full-length authentic morbillivirus has been isolated or characterized from bats. Here we detail the discovery of full-length Myotis Bat Morbillivirus (MBaMV) from a bat surveillance program in Brazil. After determining that MBaMV utilizes bat CD150 but not human CD150 as an entry receptor, we generated an infectious clone of MBaMV using reverse genetics. MBaMV exhibited features consistent with other morbilliviruses, including pleomorphic virions, P-editing and the rule-of-six. MBaMV replicated well in human epithelial cell lines in a nectin-4 dependent manner. Surprisingly, MBaMV was able to infect human macrophages in a CD150-independent manner. However, MBaMV was restricted by cross-neutralizing human sera and did not evade the human innate immune system, indicating that while zoonotic spillover into humans may be possible, MBaMV replication in humans would likely be restricted.

ABSTRACT Lymph nodes are the primary site of replication for measles virus (MeV). Here, we modeled MeV infection in human tonsil explants, utilizing a clinical strain of MeV that expresses GFP. We show that MeV replicates efficiently in this tissue as measured by increasing infectious virus production and GFP + cells (>10% of tonsillar cells by day 8). Using scRNA-Seq, we identified 29 cell populations, all of which were susceptible to MeV. While T cells were the most abundant cell type in the lymphoid explants, B cells were the dominant infected population. Flow cytometry analysis revealed that the preferential infection of B cells was associated with higher CD150 expression. We found that while germinal center B cells were the largest population of infected B cells, there were no differences in susceptibility to MeV among individual B cell subsets. Among CD3 + T cells, infection in both the CD4 + and CD8 + compartments displayed bias towards antigen experienced subsets and away from naive cells, consistent with relative CD150 expression. Differential gene expression analysis revealed that the host response to MeV was dominated by the potent induction of interferon stimulated genes within both T and B cells. These data provide new insights into how MeV infection progresses in lymph nodes, a critical launching point for pathogenesis. Author Summary Measles virus (MeV) is a re-emerging pathogen that has dramatic disease outcomes in children. Immunological amnesia is a dangerous disease outcome that is caused by MeV infection of lymphocytes. Here, we infect human tonsil explants with a GFP-expressing clinical isolate of MeV to assess the immunological events that occur during infection of this critical site. Using single-cell RNA sequencing, we identified 29 distinct populations of tonsillar cells that are susceptible to MeV infection. Further immunophenotyping revealed a preferential infection of B cell lineages compared to T cell lineages, and that among T cells, memory cells are preferential targets of infection compared to naïve counterparts. Taken together, our data thoroughly characterize the infectious and immunological events that shape disease progression in lymph nodes and identify cellular susceptibilities to MeV infection which may be critical in the development of antivirals for MeV. CONFLICTS OF INTEREST The authors have declared that no conflict of interest exists.

ABSTRACT The transformative potential of gene editing technologies hinges on the development of safe and effective delivery methods. In this study, we developed a temperature-sensitive and interferon-silent Sendai virus (ts SeV) as a novel delivery vector for CRISPR-Cas9 and for efficient gene editing in sensitive human cell types without inducing IFN responses. ts SeV demonstrates unprecedented transduction efficiency in human CD34+ hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) including transduction of the CD34+/CD38-/CD45RA-/CD90+(Thy1+)/CD49f high stem cell enriched subpopulation. The frequency of CCR5 editing exceeded 90% and bi-allelic CCR5 editing exceeded 70% resulting in significant inhibition of HIV-1 infection in primary human CD14+ monocytes. These results demonstrate the potential of the ts SeV platform as a safe, efficient, and flexible addition to the current gene-editing tool delivery methods, which may help to further expand the possibilities in personalized medicine and the treatment of genetic disorders.