YC
Yaping Chen
Author with expertise in Evolution and Classification of Flowering Plants
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(67% Open Access)
Cited by:
228
h-index:
30
/
i10-index:
59
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Rapid radiation of a plant lineage sheds light on the assembly of dry valley biomes

Yaping Chen et al.May 7, 2024
Southwest China is characterized by high plateaus, large mountain systems, and deeply incised dry valleys formed by major rivers and their tributaries. Despite the considerable attention given to alpine plant radiations in this region, the timing and mode of the diversification of the numerous plant lineages in the dry valley habitat remains unknown. To address this knowledge gap, we investigate the macroevolution of Isodon (Lamiaceae), a lineage commonly distributed in the dry valleys in southwest China and wetter areas of Asia and Africa. We reconstructed a robust phylogeny encompassing nearly 90% of the approximately 140 extant Isodon species using transcriptome and genome-resequencing data. Our results suggest a rapid radiation of Isodon during the Pliocene that coincided with a habit shift from herbs to shrubs and a habitat shift from humid areas to dry valleys. The shrubby growth form likely acted as a preadaptation allowing for the movement of Isodon species into these valleys. Ecological analysis highlighted aridity and precipitation as key factors influencing the niche preferences of different growth forms and species richness of Isodon. Integrating our results with insights from tectonic movements in the Tibetan Plateau and adjacent regions, we infer that the interplay between topography and the evolution of the East Asian monsoon since the middle Miocene likely contributed to the formation of the dry valley biome in southwest China. This study enhances our understanding of evolutionary dynamics and ecological drivers shaping the distinctive flora of this region.
0

Comparative study of the gut microbial community structure of Spodoptera frugiperda and  Spodoptera literal (Lepidoptera)

Yaping Chen et al.Jun 7, 2024
Background Spodoptera frugiperda , the fall armyworm is a destructive invasive pest, and S. litura the tobacco cutworm, is a native species closely related to S. frugiperda . The gut microbiota plays a vital role in insect growth, development, metabolism and immune system. Research on the competition between invasive species and closely related native species has focused on differences in the adaptability of insects to the environment. Little is known about gut symbiotic microbe composition and its role in influencing competitive differences between these two insects. Methods We used a culture-independent approach targeting the 16S rRNA gene of gut bacteria of 5th instar larvae of S. frugiperda and S. litura . Larvae were reared continuously on maize leaves for five generations. We analyzed the composition, abundance, diversity, and metabolic function of gut microbiomes of S. frugiperda and S. litura larvae. Results Firmicutes, Proteobacteria, and Bacteroidetes were the dominant bacterial phyla in both species. Enterococcus , ZOR0006 , Escherichia , Bacteroides , and Lactobacillus were the genera with the highest abundance in S. frugiperda . Enterococcus , Erysipelatoclostridium , ZOR0006 , Enterobacter , and Bacteroides had the highest abundance in S. litura . According to α -diversity analysis, the gut bacterial diversity of S. frugiperda was significantly higher than that of S. litura . KEGG analysis showed 15 significant differences in metabolic pathways between S. frugiperda and S. litura gut bacteria, including transcription, cell growth and death, excretory system and circulatory system pathways. Conclusion In the same habitat, the larvae of S. frugiperda and S. litura showed significant differences in gut bacterial diversity and community composition. Regarding the composition and function of gut bacteria, the invasive species S. frugiperda may have a competitive advantage over S. litura . This study provides a foundation for developing control strategies for S. frugiperda and S. litura .
0

Claroideoglomus etunicatum and Bacillus thuringiensis Affect the Growth of the Invasive Plant Ageratina adenophora and Its Defense Against the Specialist Herbivore Procecidochares utilis

Ewei Du et al.Nov 27, 2024
Exotic plants can selectively recruit beneficial microorganisms, such as arbuscular mycorrhizal fungi (AMFs) and Bacillus spp., during their invasion process to enhance growth and competitiveness by improving nutrient absorption and strengthening defense capabilities against herbivores. However, research in the context of invasive plants remains limited. In this study, a greenhouse pot experiment was conducted to examine the effects of different treatments on the growth and defense of Ageratina adenophora. The treatments included no inoculation, inoculation with Bacillus thuringiensis (BT), inoculation with arbuscular mycorrhizal fungus (Claroideoglomus etunicatum, CE), dual inoculation with BT and CE (BT + CE), and the presence or absence of Procecidochares utilis. The results showed that both CE and BT + CE significantly enhanced nutrient concentration and promoted the growth of A. adenophora. The aboveground biomass increased by 35.48 and 53.38% under non-parasitism and by 68.03% and 103.72% under the parasitism of P. utilis for these two treatments, respectively. In comparison to the control P. utilis-parasitized A. adenophora, the BT, CE, and BT + CE treatments significantly increased protective enzyme activity, jasmonic acid concentration, and secondary metabolites. Our study indicates that the recruitment of B. thuringiensis in the rhizosphere of A. adenophora can enhance its defense ability, while C. etunicatum improved both growth and defense ability. The interaction effects of these two microorganisms enhances the regulation of growth and defense ability of A. adenophora against P. utilis parasitism, providing insights into the feedback effects of beneficial microorganisms on the interactions between invasive plants and biological control.