EC
Erik Cook
Author with expertise in Optogenetics in Neuroscience and Biophysics Research
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(100% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
14
/
i10-index:
17
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Impaired dendritic spike generation in the Fragile X prefrontal cortex is due to loss of dendritic sodium channels

Federico Brandalise et al.May 11, 2022
ABSTRACT Patients with Fragile X syndrome, the leading monogenetic cause of autism, suffer from impairments related to the prefrontal cortex including working memory and attention. Synaptic inputs to the distal dendrites of layer 5 pyramidal neurons in the prefrontal cortex have a weak influence on the somatic membrane potential. To overcome this filtering, distal inputs are transformed into local dendritic Na + spikes, which propagate to the soma and trigger action potential output. Layer 5 extratelencephalic (ET) PFC neurons project to the brainstem and various thalamic nuclei and are therefore well positioned to integrate task-relevant sensory signals and guide motor actions. We used current clamp and outside-out patch clamp recording to investigate dendritic spike generation in ET neurons from male wild type and Fmr1 knockout (FX) mice. The threshold for dendritic spikes was more depolarized in FX neurons compared to wild type. Analysis of voltage responses to simulated in vivo “noisy” current injections showed that a larger dendritic input stimulus was required to elicit dendritic spikes in FX ET dendrites compared wild type. Patch clamp recordings revealed that the dendritic Na + conductance was significantly smaller in FX ET dendrites. Taken together, our results suggest that input-output transformation is impaired in ET neurons of the PFC in FX mice. Considering our prior findings that somatic D-type K + and dendritic HCN-channel function is reduced in ET neurons, we suggest that the integration of information by PFC circuits is fundamentally altered in Fragile X syndrome. KEY POINTS Dendritic spike threshold is depolarized in Layer 5 PFC neurons in FX mice Simultaneous somatic and dendritic recording with white noise current injections revealed that larger dendritic stimuli were required to elicit dendritic spikes in FX ET neurons Outside-out patch clamp recording revealed that dendritic sodium conductance density was lower in FX ET neurons
1
Citation1
0
Save
2

Probing visual sensitivity and attention in mice using reverse correlation

Jonas Lehnert et al.Sep 10, 2022
Abstract Visual attention is a fundamental cognitive operation that allows the brain to evoke behaviors based on the most important stimulus features. Although mouse models offer immense potential to gain a circuit-level understanding of this phenomenon, links between visual attention and behavioral decisions in mice are not well understood. Here, we describe a new behavioral task for mice that addresses this limitation. We trained mice to detect weak vertical bars in a background of checkerboard noise while audiovisual cues manipulated their spatial attention. We then modified a reverse correlation method from human studies to link behavioral decisions to stimulus locations and features. We show that mice attended to stimulus locations just rostral of their optical axis, which was highly sensitive for vertically oriented stimulus energy whose spatial frequency matched those of the weak vertical bars. We found that the tuning of sensitivity to orientation and spatial frequency grew stronger during training, was multiplicatively scaled with attention, and approached that of an ideal observer. These results provide a new task to measure spatial- and feature-based attention in mice which can be leveraged with new recording methods to uncover attentional circuits.
0

ElecFeX is a user-friendly toolbox for efficient feature extraction from single-cell electrophysiological recordings

Xinyue Ma et al.Jun 1, 2024
Characterizing neurons by their electrophysiological phenotypes is essential for understanding the neural basis of behavioral and cognitive functions. Technological developments have enabled the collection of hundreds of neural recordings; this calls for new tools capable of performing feature extraction efficiently. To address the urgent need for a powerful and accessible tool, we developed ElecFeX, an open-source MATLAB-based toolbox that (1) has an intuitive graphical user interface, (2) provides customizable measurements for a wide range of electrophysiological features, (3) processes large-size datasets effortlessly via batch analysis, and (4) yields formatted output for further analysis. We implemented ElecFeX on a diverse set of neural recordings; demonstrated its functionality, versatility, and efficiency in capturing electrical features; and established its significance in distinguishing neuronal subgroups across brain regions and species. ElecFeX is thus presented as a user-friendly toolbox to benefit the neuroscience community by minimizing the time required for extracting features from their electrophysiological datasets.