PC
Pierce Chow
Author with expertise in Macrophage Activation and Polarization
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
25
(68% Open Access)
Cited by:
5,889
h-index:
80
/
i10-index:
315
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Whole-Genome and Epigenomic Landscapes of Etiologically Distinct Subtypes of Cholangiocarcinoma

Apinya Jusakul et al.Jul 1, 2017
Abstract Cholangiocarcinoma (CCA) is a hepatobiliary malignancy exhibiting high incidence in countries with endemic liver-fluke infection. We analyzed 489 CCAs from 10 countries, combining whole-genome (71 cases), targeted/exome, copy-number, gene expression, and DNA methylation information. Integrative clustering defined 4 CCA clusters—fluke-positive CCAs (clusters 1/2) are enriched in ERBB2 amplifications and TP53 mutations; conversely, fluke-negative CCAs (clusters 3/4) exhibit high copy-number alterations and PD-1/PD-L2 expression, or epigenetic mutations (IDH1/2, BAP1) and FGFR/PRKA-related gene rearrangements. Whole-genome analysis highlighted FGFR2 3′ untranslated region deletion as a mechanism of FGFR2 upregulation. Integration of noncoding promoter mutations with protein–DNA binding profiles demonstrates pervasive modulation of H3K27me3-associated sites in CCA. Clusters 1 and 4 exhibit distinct DNA hypermethylation patterns targeting either CpG islands or shores—mutation signature and subclonality analysis suggests that these reflect different mutational pathways. Our results exemplify how genetics, epigenetics, and environmental carcinogens can interplay across different geographies to generate distinct molecular subtypes of cancer. Significance: Integrated whole-genome and epigenomic analysis of CCA on an international scale identifies new CCA driver genes, noncoding promoter mutations, and structural variants. CCA molecular landscapes differ radically by etiology, underscoring how distinct cancer subtypes in the same organ may arise through different extrinsic and intrinsic carcinogenic processes. Cancer Discov; 7(10); 1116–35. ©2017 AACR. This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 1047
0
Citation713
0
Save
0

SIRveNIB: Selective Internal Radiation Therapy Versus Sorafenib in Asia-Pacific Patients With Hepatocellular Carcinoma

Pierce Chow et al.Mar 2, 2018
Purpose Selective internal radiation therapy or radioembolization (RE) shows efficacy in unresectable hepatocellular carcinoma (HCC) limited to the liver. This study compared the safety and efficacy of RE and sorafenib in patients with locally advanced HCC. Patients and Methods SIRveNIB (selective internal radiation therapy v sorafenib), an open-label, investigator-initiated, phase III trial, compared yttrium-90 ( 90 Y) resin microspheres RE with sorafenib 800 mg/d in patients with locally advanced HCC in a two-tailed study designed for superiority/detriment. Patients were randomly assigned 1:1 and stratified by center and presence of portal vein thrombosis. Primary end point was overall survival (OS). Efficacy analyses were performed in the intention-to-treat population and safety analyses in the treated population. Results A total of 360 patients were randomly assigned (RE, 182; sorafenib, 178) from 11 countries in the Asia-Pacific region. In the RE and sorafenib groups, 28.6% and 9.0%, respectively, failed to receive assigned therapy without significant cross-over to either group. Median OS was 8.8 and 10.0 months with RE and sorafenib, respectively (hazard ratio, 1.1; 95% CI, 0.9 to 1.4; P = .36). A total of 1,468 treatment-emergent adverse events (AEs) were reported (RE, 437; sorafenib, 1,031). Significantly fewer patients in the RE than sorafenib group had grade ≥ 3 AEs (36 of 130 [27.7%]) v 82 of 162 [50.6%]; P < .001). The most common grade ≥ 3 AEs were ascites (five of 130 [3.8%] v four of 162 [2.5%] patients), abdominal pain (three [2.3%] v two [1.2%] patients), anemia (zero v four [2.5%] patients), and radiation hepatitis (two [1.5%] v zero [0%] patients). Fewer patients in the RE group (27 of 130 [20.8%]) than in the sorafenib group (57 of 162 [35.2%]) had serious AEs. Conclusion In patients with locally advanced HCC, OS did not differ significantly between RE and sorafenib. The improved toxicity profile of RE may inform treatment choice in selected patients.
0
Citation525
0
Save
0

Tumor cells disseminate early, but immunosurveillance limits metastatic outgrowth, in a mouse model of melanoma

Jo Eyles et al.May 24, 2010
Although metastasis is the leading cause of cancer-related death, it is not clear why some patients with localized cancer develop metastatic disease after complete resection of their primary tumor. Such relapses have been attributed to tumor cells that disseminate early and remain dormant for prolonged periods of time; however, little is known about the control of these disseminated tumor cells. Here, we have used a spontaneous mouse model of melanoma to investigate tumor cell dissemination and immune control of metastatic outgrowth. Tumor cells were found to disseminate throughout the body early in development of the primary tumor, even before it became clinically detectable. The disseminated tumor cells remained dormant for varying periods of time depending on the tissue, resulting in staggered metastatic outgrowth. Dormancy in the lung was associated with reduced proliferation of the disseminated tumor cells relative to the primary tumor. This was mediated, at least in part, by cytostatic CD8+ T cells, since depletion of these cells resulted in faster outgrowth of visceral metastases. Our findings predict that immune responses favoring dormancy of disseminated tumor cells, which we propose to be the seed of subsequent macroscopic metastases, are essential for prolonging the survival of early stage cancer patients and suggest that therapeutic strategies designed to reinforce such immune responses may produce marked benefits in these patients.
0
Citation461
0
Save
0

Microvascular Invasion Is a Better Predictor of Tumor Recurrence and Overall Survival Following Surgical Resection for Hepatocellular Carcinoma Compared to the Milan Criteria

Kheng-Choon Lim et al.Apr 28, 2011
Objective: To compare microvascular invasion (McVI) with parameters defined by the Milan criteria in predicting tumor recurrence and overall survival (OS) in patients with surgical resection (SR) for hepatocellular carcinoma (HCC). Summary Background Data: Although the Milan criteria is discriminatory for selecting patients with good outcomes in liver transplantation and SR for HCC, it neither adequately predict tumor recurrence nor explain differences in survival for patients with good liver function. McVI is a strong indicator of intrahepatic metastasis in HCC, but its relative significance for predicting clinical outcomes compared to the Milan criteria is unclear. Methods: Patients undergoing SR with curative intent from January 2000 to March 2009 at the Singapore General Hospital were followed up for long-term outcomes till January 1, 2010. They were stratified first by the Milan criteria and then by the presence of McVI and compared relative to OS. Results: Altogether, 454 of the 515 patients received curative SR. There were stratified into 4 groups (Milan+, McVI−), (Milan+, McVI+), (Milan−, McVI−), and (Milan−, McVI+). All pair-wise comparisons between groups relative to OS were significant except (Milan+, McVI−) (OS, 90%, 73%, and 60% at 1, 3, and 5 years) with (Milan−, McVI−) (OS, 86%, 71%, and 61% at 1, 3, 5 years) and (Milan+, McVI+) with (Milan−, McVI+). Multivariate Cox regression analysis showed that McVI was predictive of OS, after which Milan status did not add additional discriminative information. Conclusions: McVI is a better predictor of tumor recurrence and OS than the Milan criteria after SR for HCC. Assessment of McVI should aid in patient selection for adjuvant treatments to improve outcomes after SR.
0
Citation443
0
Save
1

Onco-fetal Reprogramming of Endothelial Cells Drives Immunosuppressive Macrophages in Hepatocellular Carcinoma

Ankur Sharma et al.Sep 24, 2020
We employed scRNA sequencing to extensively characterize the cellular landscape of human liver from development to disease. Analysis of ∼212,000 cells representing human fetal, hepatocellular carcinoma (HCC), and mouse liver revealed remarkable fetal-like reprogramming of the tumor microenvironment. Specifically, the HCC ecosystem displayed features reminiscent of fetal development, including re-emergence of fetal-associated endothelial cells (PLVAP/VEGFR2) and fetal-like (FOLR2) tumor-associated macrophages. In a cross-species comparative analysis, we discovered remarkable similarity between mouse embryonic, fetal-liver, and tumor macrophages. Spatial transcriptomics further revealed a shared onco-fetal ecosystem between fetal liver and HCC. Furthermore, gene regulatory analysis, spatial transcriptomics, and in vitro functional assays implicated VEGF and NOTCH signaling in maintaining onco-fetal ecosystem. Taken together, we report a shared immunosuppressive onco-fetal ecosystem in fetal liver and HCC. Our results unravel a previously unexplored onco-fetal reprogramming of the tumor ecosystem, provide novel targets for therapeutic interventions in HCC, and open avenues for identifying similar paradigms in other cancers and disease.
1
Citation433
0
Save
0

Interaction between tumour-infiltrating B cells and T cells controls the progression of hepatocellular carcinoma

Marta Garnelo et al.Dec 15, 2015

Objective

 The nature of the tumour-infiltrating leucocytes (TILs) is known to impact clinical outcome in carcinomas, including hepatocellular carcinoma (HCC). However, the role of tumour-infiltrating B cells (TIBs) remains controversial. Here, we investigate the impact of TIBs and their interaction with T cells on HCC patient prognosis. 

Design

 Tissue samples were obtained from 112 patients with HCC from Singapore, Hong Kong and Zurich and analysed using immunohistochemistry and immunofluorescence. RNA expression of CD19, CD8A, IFNG was analysed using quantitative PCR. The phenotype of freshly isolated TILs was analysed using flow cytometry. A mouse model depleted of mature B cells was used for functional study. 

Results

 Tumour-infiltrating T cells and B cells were observed in close contact with each other and their densities are correlated with superior survival in patients with HCC. Furthermore, the density of TIBs was correlated with an enhanced expression of granzyme B and IFN-γ, as well as with reduced tumour viability defined by low expression of Ki-67, and an enhanced expression of activated caspase-3 on tumour cells. CD27 and CD40 costimulatory molecules and TILs expressing activation marker CD38 in the tumour were also correlated with patient survival. Mice depleted of mature B cells and transplanted with murine hepatoma cells showed reduced tumour control and decreased local T cell activation, further indicating the important role of B cells. 

Conclusions

 The close proximity of tumour-infiltrating T cells and B cells indicates a functional interaction between them that is linked to an enhanced local immune activation and contributes to better prognosis for patients with HCC.
0
Citation379
0
Save
0

Cross-tissue single-cell landscape of human monocytes and macrophages in health and disease

Kevin Mulder et al.Jul 30, 2021
Mononuclear phagocytes (MNPs) encompass dendritic cells, monocytes, and macrophages (MoMac), which exhibit antimicrobial, homeostatic, and immunoregulatory functions. We integrated 178,651 MNPs from 13 tissues across 41 datasets to generate a MNP single-cell RNA compendium (MNP-VERSE), a publicly available tool to map MNPs and define conserved gene signatures of MNP populations. Next, we generated a MoMac-focused compendium that revealed an array of specialized cell subsets widely distributed across multiple tissues. Specific pathological forms were expanded in cancer and inflammation. All neoplastic tissues contained conserved tumor-associated macrophage populations. In particular, we focused on IL4I1+CD274(PD-L1)+IDO1+ macrophages, which accumulated in the tumor periphery in a T cell-dependent manner via interferon-γ (IFN-γ) and CD40/CD40L-induced maturation from IFN-primed monocytes. IL4I1_Macs exhibited immunosuppressive characteristics through tryptophan degradation and promoted the entry of regulatory T cell into tumors. This integrated analysis provides a robust online-available platform for uniform annotation and dissection of specific macrophage functions in healthy and pathological states.
0
Citation339
0
Save
0

Transferrin-conjugated magnetic silica PLGA nanoparticles loaded with doxorubicin and paclitaxel for brain glioma treatment

Yanna Cui et al.Aug 6, 2013
The effective treatment of malignant brain glioma is hindered by the poor transport across the blood–brain barrier (BBB) and the low penetration across the blood-tumor barrier (BTB). In this study, transferrin-conjugated magnetic silica PLGA nanoparticles (MNP-MSN-PLGA-Tf NPs) were formulated to overcome these barriers. These NPs were loaded with doxorubicin (DOX) and paclitaxel (PTX), and their anti-proliferative effect was evaluated in vitro and in vivo. The in vitro cytotoxicity of drug-loaded NPs was evaluated in U-87 cells. The delivery and the subsequent cellular uptake of drug-loaded NPs could be enhanced by the presence of magnetic field and the usage of Tf as targeting ligand, respectively. In particular, cells treated with DOX-PTX-NPs-Tf with magnetic field showed the highest cytotoxicity as compared to those treated with DOX-PTX-NPs-Tf, DOX-PTX-NPs, DOX-PTX-NPs-Tf with free Tf. The in vivo therapeutic efficacy of drug-loaded NPs was evaluated in intracranial U-87 MG-luc2 xenograft of BALB/c nude mice. In particular, the DOX-PTX-NPs-Tf treatment exhibited the strongest anti-glioma activity as compared to the PTX-NPs-Tf, DOX-NPs-Tf or DOX-PTX-NPs treatment. Mice did not show acute toxicity after administrating with blank MNP-MSN-PLGA-Tf NPs. Overall, MNP-MSN-PLGA-Tf NPs are promising carriers for the delivery of dual drugs for effective treatment of brain glioma.
0
Citation337
0
Save
Load More