TF
Tanya Freedman
Author with expertise in Natural Killer Cells in Immunity
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(83% Open Access)
Cited by:
4
h-index:
12
/
i10-index:
13
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Allosteric coupling asymmetry mediates paradoxical activation of BRAF

Damien Rasmussen et al.Apr 19, 2023
Both first-generation αC-out and newer αC-in RAF inhibitors paradoxically activate BRAF kinase at subsaturating concentrations. Paradoxical activation by αC-in inhibitors is linked to the formation of BRAF dimers, but why activation rather than inhibition occurs remains unclear. We used biophysical methods tracking BRAF conformation and dimerization combined with thermodynamic modeling to define the allosteric coupling mechanism underlying paradoxical activation. Allosteric coupling between αC-in inhibitors and BRAF dimerization is both extremely strong and highly asymmetric, with the first inhibitor contributing the bulk of dimer promotion. This asymmetric allosteric coupling mechanism results in the induction of dimers in which only one protomer is inhibited while the other is activated. The type II class of RAF inhibitors currently in clinical trials are more asymmetrically coupled and possess greater activation potential than older type I inhibitors. 19 F NMR data demonstrate that the BRAF dimer displays dynamic conformational asymmetry, with only a subset of protomers locked in the αC-in state, explaining how the conformational effects of drug binding can efficiently drive BRAF dimerization and activation at substoichiometric concentrations.
1

SH3-domain mutations selectively disrupt Csk homodimerization or PTPN22 binding

Ben Brian et al.Jan 14, 2022
Abstract The kinase Csk is the primary negative regulator of the Src-family kinases (SFKs, e.g., Lck, Fyn, Lyn, Hck, Fgr, Blk, Yes), phosphorylating a tyrosine on the SFK C-terminal tail that mediates autoinhibition. Csk also binds phosphatases, including PTPN12 (PTP-PEST) and immune-cell PTPN22 (LYP/Pep), which dephosphorylate the SFK activation loop to promote autoinhibition. Csk-binding proteins (e.g., CBP/PAG1) oligomerize within membrane microdomains, and high local concentration promotes Csk function. Purified Csk homodimerizes in solution through an interface that overlaps the phosphatase binding footprint. Here we demonstrate that Csk can homodimerize in Jurkat T cells, in competition with PTPN22 binding. We designed SH3-domain mutations in Csk that selectively impair homodimerization (H21I) or PTPN22 binding (K43D) and verified their kinase activity in solution. Disruption of either interaction, however, decreased the negative-regulatory function of Csk in cells. Csk W47A, a substitution previously reported to block PTPN22 binding, also impairs homodimerization. Csk H21I and K43D will be useful tools for dissecting the protein-specific drivers of autoimmunity mediated by the human polymorphism PTPN22 R620W, which impairs interaction with Csk and with the E3 ubiquitin ligase TRAF3. Future investigations of Csk homodimer activity and phosphatase interactions may reveal new facets of SFK regulation in hematopoietic and non-hematopoietic cells.
13

Primary infection with Zika virus provides one-way heterologous protection against Spondweni virus infection in rhesus macaques

Anna Jaeger et al.Dec 17, 2022
Abstract Spondweni virus (SPONV) is the closest known relative of Zika virus (ZIKV). SPONV pathogenesis resembles that of ZIKV in pregnant mice, and both viruses are transmitted by Aedes aegypti mosquitoes. We aimed to develop a translational model to further understand SPONV transmission and pathogenesis. We found that cynomolgus macaques ( Macaca fascicularis ) inoculated with ZIKV or SPONV were susceptible to ZIKV, but resistant to SPONV infection. In contrast, rhesus macaques ( Macaca mulatta ) supported productive infection with both ZIKV and SPONV and developed robust neutralizing antibody responses. Crossover serial challenge in rhesus macaques revealed that SPONV immunity did not protect against ZIKV infection, whereas ZIKV immunity was fully protective against SPONV infection. These findings establish a viable model for future investigation into SPONV pathogenesis, and suggest the risk of SPONV emergence is low in areas with high ZIKV seroprevalence due to one-way cross-protection between ZIKV and SPONV. Teaser Identification of asymmetric immune interactions between Zika and Spondweni viruses in macaque monkeys.