Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
LC
Luisa Cochella
Author with expertise in Molecular Mechanisms of Aging and Longevity
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(57% Open Access)
Cited by:
8
h-index:
21
/
i10-index:
28
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

A deeply conserved miR-1 dependent regulon supports muscle cell physiology

Paula Gutiérrez‐Pérez et al.Sep 1, 2020
Muscles are not only essential for force generation but are also key regulators of systemic energy homeostasis 1 . Both these roles rely heavily on mitochondria and lysosome function as providers of energy and building blocks, but also as metabolic sensors 2-4 . Perturbations in these organelles or their crosstalk lead to a wide range of pathologies 5 . Here, we uncover a deeply conserved regulon of mitochondria and lysosome homeostasis under control of the muscle-specific microRNA miR-1. Animals lacking miR-1 display a diverse range of muscle cell defects that have been attributed to numerous different targets 6 . Guided by the striking conservation of miR-1 and some of its predicted targets, we identified a set of direct targets that can explain the pleiotropic function of miR-1. miR-1-mediated repression of multiple subunits of the vacuolar ATPase (V-ATPase) complex, a key player in the acidification of internal compartments and a hub for metabolic signaling 7,8 , and of DCT-1/BNIP3, a mitochondrial protein involved in mitophagy and apoptosis 9,10 , accounts for the function of this miRNA in C. elegans . Surprisingly, although multiple V-ATPase subunits are upregulated in the absence of miR-1, this causes a loss-of-function of V-ATPase due to altered levels or stoichiometry, which negatively impact complex assembly. Finally, we demonstrate the conservation of the functional relationship between miR-1 and the V-ATPase complex in Drosophila .
1
Citation5
0
Save
0

Olfaction regulates organismal proteostasis and longevity via microRNA-dependent signaling

Fabian Finger et al.Sep 18, 2018
The maintenance of proteostasis is crucial for any organism to survive and reproduce in an ever changing environment, but its efficiency declines with age. Posttranscriptional regulators such as microRNAs control protein translation of target mRNAs with major consequences for development, physiology, and longevity. However, the precise function of lifespan-determining microRNAs remains poorly understood. Here we show that the microRNA mir-71 controls organismal proteostasis and aging in Caenorhabditis elegans by regulating its conserved target tir-1 in AWC olfactory neurons. We screened a collection of microRNAs that control aging4 to identify regulators of organismal proteostasis and discovered that the lifespan promoting mir-71 affects ubiquitin-dependent protein turnover, particularly in the intestine. We show that mir-71 directly inhibits the toll receptor domain protein TIR-1 in AWC olfactory neurons. Neuronal signaling is required for mir-71/tir-1-dependent and diet-dependent regulation of organismal proteostasis. Disruption of mir-71/tir-1 or loss of AWC olfactory neurons eliminates the influence of food source on proteostasis. Mir-71-mediated regulation of TIR-1 controls chemotactic behavior and is regulated by odor. Our findings support a model whereby odor promotes mir-71-mediated inhibition of TIR-1 in AWC neurons to stimulate organismal protein turnover. Thus, odor perception influences cell-type specific miRNA-target interaction to regulate organismal proteostasis and longevity. We anticipate that the proposed mechanism of food perception will stimulate further research on neuroendocrine brain-to-gut communication and may open the possibility for therapeutic interventions to improve proteostasis and organismal health via the sense of smell, with potential implication for obesity, diabetes and aging.
0

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 evolution by a centralised pipeline and weekly focused sequencing, Austria, January 2021 to March 2023

Olga Frank et al.Jun 6, 2024
Background The COVID-19 pandemic was largely driven by genetic mutations of SARS-CoV-2, leading in some instances to enhanced infectiousness of the virus or its capacity to evade the host immune system. To closely monitor SARS-CoV-2 evolution and resulting variants at genomic-level, an innovative pipeline termed SARSeq was developed in Austria. Aim We discuss technical aspects of the SARSeq pipeline, describe its performance and present noteworthy results it enabled during the pandemic in Austria. Methods The SARSeq pipeline was set up as a collaboration between private and public clinical diagnostic laboratories, a public health agency, and an academic institution. Representative SARS-CoV-2 positive specimens from each of the nine Austrian provinces were obtained from SARS-CoV-2 testing laboratories and processed centrally in an academic setting for S-gene sequencing and analysis. Results SARS-CoV-2 sequences from up to 2,880 cases weekly resulted in 222,784 characterised case samples in January 2021–March 2023. Consequently, Austria delivered the fourth densest genomic surveillance worldwide in a very resource-efficient manner. While most SARS-CoV-2 variants during the study showed comparable kinetic behaviour in all of Austria, some, like Beta, had a more focused spread. This highlighted multifaceted aspects of local population-level acquired immunity. The nationwide surveillance system enabled reliable nowcasting. Measured early growth kinetics of variants were predictive of later incidence peaks. Conclusion With low automation, labour, and cost requirements, SARSeq is adaptable to monitor other pathogens and advantageous even for resource-limited countries. This multiplexed genomic surveillance system has potential as a rapid response tool for future emerging threats.