TK
Tanjina Kader
Author with expertise in Molecular Research on Breast Cancer
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
11
/
i10-index:
11
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Stromal lymphocytes are associated with upgrade of B3 breast lesions

Tanjina Kader et al.Jul 8, 2024
Abstract Various histopathological, clinical and imaging parameters have been evaluated to identify a subset of women diagnosed with lesions with uncertain malignant potential (B3 or BIRADS 3/4A lesions) who could safely be observed rather than being treated with surgical excision, with little impact on clinical practice. The primary reason for surgery is to rule out an upgrade to either ductal carcinoma in situ or invasive breast cancer, which occurs in up to 30% of patients. We hypothesised that the stromal immune microenvironment could indicate the presence of carcinoma associated with a ductal B3 lesion and that this could be detected in biopsies by counting lymphocytes as a predictive biomarker for upgrade. A higher number of lymphocytes in the surrounding specialised stroma was observed in upgraded ductal and papillary B3 lesions than non-upgraded ( p < 0.01, negative binomial model, n = 307). We developed a model using lymphocytes combined with age and the type of lesion, which was predictive of upgrade with an area under the curve of 0.82 [95% confidence interval 0.77–0.87]. The model can identify some patients at risk of upgrade with high sensitivity, but with limited specificity. Assessing the tumour microenvironment including stromal lymphocytes may contribute to reducing unnecessary surgeries in the clinic, but additional predictive features are needed.
0

Predictive biomarkers of breast ductal carcinomain situmay underestimate the risk of recurrence due tode novoipsilateral breast carcinoma development

Tanjina Kader et al.May 21, 2024
Abstract Purpose Development of ipsilateral breast carcinoma following a diagnosis of breast ductal carcinoma in situ (DCIS) has been assumed to represent recurrence of the primary tumour. However, this may not be the case and it is important to know how often recurrences are new primary tumours to ensure appropriate individualised therapy. Experimental Design Ipsilateral primary-recurrence pairs (n=78) were sequenced to test their clonal relatedness. Shared genetic events were identified from whole exome sequencing (n=54 pairs) using haplotype-specific copy number and phylogenetic analysis. The remaining pairs were sequenced by a targeted panel or low-coverage whole genome sequencing. We included 32 non-recurrent DCIS to compare the genetic profiles between recurrent and non-recurrent disease to develop a predictive biomarker. Results We found that 14% of DCIS recurrences were non-clonal, indicative of a new breast carcinoma. Four chromosomal changes (5q, 11q, 17q and 20q) and TP53 mutation were enriched in clonal primaries compared with non-recurrent DCIS (p<0.05, Fisher’s exact test). The prognostic value of TP53 was validated in an independent cohort using immunohistochemistry (HR=3.1; 95% CI 1.3-7.8). Non-clonal DCIS primaries had a very similar genetic profile to non-recurrent DCIS, suggesting this subset of cases would be identified as being at “low risk” of recurrence using tumour-intrinsic markers. Conclusions We have identified a substantial rate of new ipsilateral primary carcinomas after a diagnosis of DCIS. Our results suggest, as with invasive breast cancer, that if a recurrent tumour with an independent origin occurs, then the patient is at a high risk through the environment, the breast microenvironment and/or has a genetic predisposition. Importantly, the frequency of new primaries will influence the interpretation of findings in DCIS biomarker discovery studies as the true recurrence rate will be incorrect, affecting these efforts. Translational relevance Our finding that >10% of recurrent tumours are new primaries provides genetic evidence that the presence of DCIS confers a risk of a de novo breast cancer as well as recurrence. Identifying a biomarker of such risks might allow preventive actions, such as genetic testing, chemoprevention with tamoxifen or aromatase inhibitors, or bilateral mastectomy. The corollary of these findings is that de novo primaries in DCIS biomarker studies may have undermined efforts to find a biomarker of recurrence by reducing statistical power, since a tumour cell-intrinsic marker is unlikely to be predictive for a new primary. Even if a tumour molecular biomarker could stratify between non-recurrent and recurrent patients, it will under-detect patients at risk of new primaries. This issue raises concerns about utilising only a tumour cell-intrinsic biomarker in the clinical setting.
5

Utility of stromal lymphocytes in diagnosis and predicting upgrade of B3 breast lesions from core biopsies

Tanjina Kader et al.Sep 5, 2022
Abstract For more than two decades attempts have been made to identify a subset of women diagnosed with lesions with uncertain malignant potential (B3 lesions) who could safely be observed rather than being treated with surgical excision and/or chemoprevention. Various histopathological, clinical and imaging parameters for risk recommendation have been evaluated, with little impact on clinical practice. The primary reason for surgery is to rule out an upgrade lesion to either ductal carcinoma in situ (DCIS) or invasive breast cancer (IBC). While on average 30% of these patients are upgraded after diagnostic biopsy, a large number are over treated,making this an important harm of screening. Here we evaluated stromal lymphocytes from B3 biopsies (n=264) as a predictive biomarker for upgrade. A higher number of stromal lymphocytes were observed in upgraded B3 lesions than non-upgraded (p< 0.01, zero inflated binomial model) for both ductal and papillary lesions (n=174). This observation was validated in an independent cohort (p<0.001, p<0.05, zero binomial model, ductal and papillary lesions, respectively) (n=90). Our data suggested that the presence of ≥5% of lymphocytes in the surrounding specialised stroma of B3 lesions are predictive of B3 lesions being upgraded with a specificity of 93% and 87% in our discovery and validation cohorts, respectively. The area under the curve (AUC) for the discovery cohort using lymphocyte count and age as variables was 0.77 and was validated with an AUC of 0.81 in the validation cohort. In conclusion, we can identify a subset of the patients at risk of upgrade with high specificity. Assessing the tumour microenvironment including stromal lymphocytes may contribute to reducing unnecessary surgeries in the clinic.