Ocean Sampling Day was initiated by the EU-funded Micro B3 (Marine Microbial Biodiversity, Bioinformatics, Biotechnology) project to obtain a snapshot of the marine microbial biodiversity and function of the world's oceans. It is a simultaneous global mega-sequencing campaign aiming to generate the largest standardized microbial data set in a single day. This will be achievable only through the coordinated efforts of an Ocean Sampling Day Consortium, supportive partnerships and networks between sites. This commentary outlines the establishment, function and aims of the Consortium and describes our vision for a sustainable study of marine microbial communities and their embedded functional traits.

Abstract The histological changes in the liver, kidney, spleen, and gills of Syacium papillosum from the continental shelf of the Yucatan Peninsula, Gulf of Mexico, and their statistical associations with environmental conditions and pollutants were assessed in 2010, 2011, and 2012. We evaluated the extension and severity of the lesions through a degree of tissue change (DTC), and, with the sum of the number of lesion types within each of their DTC stages, we determined the histological alteration index (HAI). The liver and kidney were the most affected organs, with HAI values > 100. Fish with the most severe damage were observed on the Campeche Bank and the Caribbean Sea, contrasting with those collected from the northern Yucatan continental shelf. The presence of foci cellular alteration and abundant melanomacrophage centers indicated that these flatfishes were chronically exposed to environmental stress factors. Redundancy analyses showed strong associations between HAI values and hydrocarbon and heavy metal concentrations in muscle. Our results provide evidence for the first time of a differential health condition of the Yucatan shelf through the histopathology shown in S. papillosum , establishing the baseline for future monitoring programs in the region. Graphical abstract

Stony Coral Tissue Loss Disease (SCTLD) has caused widespread coral mortality in the Caribbean Region. However, how the disease presence alters the microbiome community, their structure, composition, and metabolic functionality is still poorly understood. In this study, we characterized the microbial communities of the tissues of apparently healthy and diseased SCTLD colonies of the species Siderastrea siderea , Orbicella faveolata , and Montastraea cavernosa to explore putative changes related to the presence of SCTLD. Gammaproteobacteria , Alphaproteobacteria , and Bacteroidia were the best represented classes in the healthy tissues of all coral species, and alpha diversity did not show significant differences among the species. The microbial community structure between coral species was significantly different (PERMANOVA: F = 3.46, p = 0.001), and enriched genera were detected for each species: Vibrio and Photobacterium in S . siderea , Spirochaeta2 and Marivivens in O . faveolata and SAR202_clade and Nitrospira in M . cavernosa . Evidence of SCTLD in the microbial communities was more substantial in S . siderea , where differences in alpha diversity, beta diversity, and functional profiles were observed. In O . faveolata , differences were detected only in the community structure, while M . cavernosa samples showed no significant difference. Several microbial groups were found to have enriched abundances in tissue from SCTLD lesions from S . siderea and O . faveolata , but no dominant bacterial group was detected. Our results contribute to understanding microbial diversity associated with three scleractinian coral species and the shifts in their microbiomes associated with SCTLD in the Mexican Caribbean.

Early-life adversity (ELA), including child abuse and other forms of early-life maltreatment, is a major predictor of negative mental health outcomes. ELA is thought to increase lifetime risk of psychopathology by epigenetically regulating genomic regions that in turn adjust different brain systems. Here, focusing on the lateral amygdala, a major brain site for emotional homeostasis, we comprehensively describe molecular cross-talk across multiple epigenetic mechanisms, including 6 histone marks, DNA methylation and the transcriptome, in subjects with a history of ELA and healthy controls. We first provide evidence for previously unknown interactions among epigenetic layers in the healthy brain. Focusing on non-CG methylation, and particularly on CAC, our results further suggest that the immune system and small GTPase signaling are the most consistently impaired pathways in the amygdala of ELA individuals. Overall, the present work provides new insight into epigenetic regulation of brain plasticity as a function of early-life experience.

Due to the dramatic reduction of sea cucumber Isostichopus badionotus populations in the Yucatan Peninsula by overfishing and poaching, aquaculture has been encouraged as an alternative to commercial catching and restoring wild populations. However, the scarcity of broodstock, the emergence of a new disease in the auricularia larvae stage, and the development of skin ulceration syndrome (SUS) in the culture have limited aquaculture development. This study presents the changes in the intestine and skin microbiota observed in early and advanced stages of SUS disease in cultured juvenile I . badionotus obtained during an outbreak in experimental culture through 16S rRNA gene sequencing and histological evidence. Our results showed inflammation in the intestines of juveniles at both stages of SUS. However, more severe tissue damage and the presence of bacterial clusters were detected only in the advanced stages of SUS. Differences in the composition and structure of the intestinal and skin bacterial community from early and advanced stages of SUS were detected, with more evident changes in the intestinal microbial communities. These findings suggest that SUS was not induced by a single pathogenic bacterium. Nevertheless, a decrease in the abundance of Vibrio and an increase in Halarcobacter (syn. Arcobacter ) was observed, suggesting that these two bacterial groups could be keystone genera involved in SUS disease.

Abstract Stony Coral Tissue Loss Disease (SCTLD) has caused widespread coral mortality in the Caribbean Region. However, how the disease presence alters the microbiome community, their structure, composition, and metabolic functionality is still poorly understood. In this study, we characterized the microbial communities of the tissues of apparently healthy and diseased SCTLD colonies of the species Siderastrea siderea , Orbicella faveolata , and Montastraea cavernosa to explore putative changes related to the presence of SCTLD. Gammaproteobacteria , Alphaproteobacteria , and Bacteroidia were the best represented classes in the healthy tissues of all coral species, and alpha diversity did not show significant differences among the species. The microbial community structure between coral species was significantly different (PERMANOVA: F=3.46, p=0.001), and enriched genera were detected for each species: Vibrio and Photobacterium in S. siderea , Spirochaeta2 and Marivivens in O. faveolata and SAR202_clade and Nitrospira in M. cavernosa . Evidence of SCTLD in the microbial communities was more substantial in S. siderea , where differences in alpha diversity, beta diversity, and functional profiles were observed. In O. faveolata , differences were detected only in the community structure, while M. cavernosa samples showed no significant difference. Several microbial groups were found to have enriched abundances in tissue from SCTLD lesions from S. siderea and O. faveolata , but no dominant bacterial group was detected. Our results contribute to understanding microbial diversity associated with three scleractinian coral species and the shifts in their microbiomes associated with SCTLD in the Mexican Caribbean.

The biodiversity of freshwater fishes is extensive in Mexico; however, knowledge of their associated myxozoan parasites is limited. This study aimed to recognize myxozoan parasites in the endemic fish Mayaheros urophthalmus. Two new species, Myxobolusmayarum n. sp. and Kudoamayarum n. sp. were described from M. urophthalmus collected in the Celestún Coastal Lagoon and Baldiosera Freshwater Spring from the Yucatán Peninsula. Myxobolusmayarum n. sp. was found in 100% of the examined fish, infecting the gills, kidney, pectoral fins, and spleen. The spores were round, 11.34 ± 0.67 μm length, 10.03 ± 0.44 μm width, and 7.22 ± 0.45 μm thickness. The polar capsules were pyriform and equal in size, 3.85 ± 0.29 μm length and 2.27 ± 0.20 μm width. The polar tubule 30.71 ± 2.10 μm long and coiled 5-6 times. Kudoamayarum n. sp. was found in 30% of fish, infecting the heart, oesophagus, and stomach. The spores were subspherical, 5.40 ± 0.40 μm length and 5.76 ± 0.37 μm width. The polar capsules were ellipsoidal and equal in size, 1.90 ± 0.27 μm length and 1.46 ± 0.20 μm width. The phylogenetic analyses based on the small and large subunits ribosomal DNA (18S rDNA and 28S rDNA) sequences demonstrated that these two species are distinct from other published myxozoans, providing evidence to support the description of two new species. This study constitutes the first record of myxozoans from the Yucatán Peninsula, contributing to increase the knowledge about the biodiversity of myxozoans in neotropical regions.

is a mosquito-borne subcutaneous parasite of raccoons, regarded as the causative agent of most human dirofilarial infections in North America. Despite the wide geographic range of raccoons in the Americas, the presence of this parasite has not been confirmed outside its known endemic areas in the Southern United States. Based on morphological and molecular data, we present the first record of