GN
Guiomar Niso
Author with expertise in Analysis of Brain Functional Connectivity Networks
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
40
h-index:
21
/
i10-index:
24
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

PET-BIDS, an extension to the brain imaging data structure for positron emission tomography

Martin Nørgaard et al.Mar 2, 2022
+29
H
G
M
The Brain Imaging Data Structure (BIDS) is a standard for organizing and describing neuroimaging datasets, serving not only to facilitate the process of data sharing and aggregation, but also to simplify the application and development of new methods and software for working with neuroimaging data. Here, we present an extension of BIDS to include positron emission tomography (PET) data, also known as PET-BIDS, and share several open-access datasets curated following PET-BIDS along with tools for conversion, validation and analysis of PET-BIDS datasets.
44

PET-BIDS, an extension to the brain imaging data structure for positron emission tomography

Martin Nørgaard et al.Jun 17, 2021
+30
M
G
M
ABSTRACT The Brain Imaging Data Structure (BIDS) is a standard for organizing and describing neuroimaging datasets. It serves not only to facilitate the process of data sharing and aggregation, but also to simplify the application and development of new methods and software for working with neuroimaging data. Here, we present an extension of BIDS to include positron emission tomography (PET) data (PET-BIDS). We describe the PET-BIDS standard in detail and share several open-access datasets curated following PET-BIDS. Additionally, we highlight several tools which are already available for converting, validating and analyzing PET-BIDS datasets.
0

MEG-BIDS: an extension to the Brain Imaging Data Structure for magnetoencephalography

Guiomar Niso et al.Aug 8, 2017
+13
E
K
G
We present a significant extension of the Brain Imaging Data Structure (BIDS) to support the specific aspects of magnetoencephalography (MEG) data. MEG provides direct measurement of brain activity with millisecond temporal resolution and unique source imaging capabilities. So far, BIDS has provided a solution to structure the organization of magnetic resonance imaging (MRI) data, which nature and acquisition parameters are different. Despite the lack of standard data format for MEG, MEG-BIDS is a principled solution to store, organize and share the typically-large data volumes produced. It builds on BIDS for MRI, and therefore readily yields a multimodal data organization by construction. This is particularly valuable for the anatomical and functional registration of MEG source imaging with MRI. With MEG-BIDS and a growing range of software adopting the standard, the MEG community has a solution to minimize curation overheads, reduce data handling errors and optimize usage of computational resources for analytics. The standard also includes well-defined metadata, to facilitate future data harmonization and sharing efforts.