LM
Lena Maier‐Hein
Author with expertise in Biomedical Optical Imaging and Spectroscopy
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
17
(76% Open Access)
Cited by:
2,149
h-index:
50
/
i10-index:
152
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The Medical Segmentation Decathlon

Michela Antonelli et al.Jul 15, 2022
International challenges have become the de facto standard for comparative assessment of image analysis algorithms given a specific task. Segmentation is so far the most widely investigated medical image processing task, but the various segmentation challenges have typically been organized in isolation, such that algorithm development was driven by the need to tackle a single specific clinical problem. We hypothesized that a method capable of performing well on multiple tasks will generalize well to a previously unseen task and potentially outperform a custom-designed solution. To investigate the hypothesis, we organized the Medical Segmentation Decathlon (MSD) - a biomedical image analysis challenge, in which algorithms compete in a multitude of both tasks and modalities. The underlying data set was designed to explore the axis of difficulties typically encountered when dealing with medical images, such as small data sets, unbalanced labels, multi-site data and small objects. The MSD challenge confirmed that algorithms with a consistent good performance on a set of tasks preserved their good average performance on a different set of previously unseen tasks. Moreover, by monitoring the MSD winner for two years, we found that this algorithm continued generalizing well to a wide range of other clinical problems, further confirming our hypothesis. Three main conclusions can be drawn from this study: (1) state-of-the-art image segmentation algorithms are mature, accurate, and generalize well when retrained on unseen tasks; (2) consistent algorithmic performance across multiple tasks is a strong surrogate of algorithmic generalizability; (3) the training of accurate AI segmentation models is now commoditized to non AI experts.
0

Comparative Validation of Polyp Detection Methods in Video Colonoscopy: Results From the MICCAI 2015 Endoscopic Vision Challenge

Jorge Bernal et al.Feb 7, 2017
Colonoscopy is the gold standard for colon cancer screening though some polyps are still missed, thus preventing early disease detection and treatment. Several computational systems have been proposed to assist polyp detection during colonoscopy but so far without consistent evaluation. The lack of publicly available annotated databases has made it difficult to compare methods and to assess if they achieve performance levels acceptable for clinical use. The Automatic Polyp Detection sub-challenge, conducted as part of the Endoscopic Vision Challenge (http://endovis.grand-challenge.org) at the international conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI) in 2015, was an effort to address this need. In this paper, we report the results of this comparative evaluation of polyp detection methods, as well as describe additional experiments to further explore differences between methods. We define performance metrics and provide evaluation databases that allow comparison of multiple methodologies. Results show that convolutional neural networks are the state of the art. Nevertheless, it is also demonstrated that combining different methodologies can lead to an improved overall performance.
1

Optimization of anastomotic technique and gastric conduit perfusion with hyperspectral imaging in an experimental model for minimally invasive esophagectomy

Felix Nickel et al.Oct 4, 2021
Abstract Objective To optimize anastomotic technique and gastric conduit perfusion with hyperspectral imaging (HSI) for total minimally invasive esophagectomy (MIE) with linear stapled anastomosis. Summary Background Data Esophagectomy is the mainstay of esophageal cancer treatment but anastomotic insufficiency related morbidity and mortality remain challenging for patient outcome. Methods A live porcine model (n=50) for MIE was used with gastric conduit formation and linear stapled side-to-side esophagogastrostomy. Four main experimental groups differed in stapling length (3 vs. 6 cm) and anastomotic position on the conduit (cranial vs. caudal). Tissue oxygenation around the anastomotic site was evaluated using HSI and was validated with histopathology. Results The tissue oxygenation (ΔStO 2 ) after the anastomosis remained constant only for the short stapler in caudal position (−0.4± 4.4%, n.s.) while it dropped markedly in the other groups (short-cranial: -15.6± 11.5%, p=0.0002; long-cranial: -20.4± 7.6%, p=0.0126; long-caudal: -16.1± 9.4%, p<0.0001) Tissue samples from deoxygenated stomach as measured by HSI showed correspondent eosinophilic pre-necrotic changes in 35.7± 9.7% of the surface area. Conclusions Tissue oxygenation at the anastomotic site of the gastric conduit during MIE is influenced by stapling technique. Optimal oxygenation was achieved with a short stapler (3 cm) and sufficient distance of the anastomosis to the cranial end of the gastric conduit. HSI tissue deoxygenation corresponded to histopathologic necrotic tissue changes. These findings allow for optimization of gastric conduit perfusion and anastomotic technique in MIE. Level of Evidence Not applicable. Translational animal science. Original article.
3

Spectral organ fingerprints for intraoperative tissue classification with hyperspectral imaging

Alexander Studier-Fischer et al.Nov 25, 2021
Abstract Visual discrimination of tissue during surgery can be challenging since different tissues appear similar to the human eye. Hyperspectral imaging (HSI) removes this limitation by associating each pixel with high-dimensional spectral information. While previous work has shown its general potential to discriminate tissue, clinical translation has been limited due to the method’s current lack of robustness and generalizability. Specifically, it had been unknown whether variability in spectral reflectance is primarily explained by tissue type rather than the recorded individual or specific acquisition conditions. The contribution of this work is threefold: (1) Based on an annotated medical HSI data set (9,059 images from 46 pigs), we present a tissue atlas featuring spectral fingerprints of 20 different porcine organs and tissue types. (2) Using the principle of mixed model analysis, we show that the greatest source of variability related to HSI images is the organ under observation. (3) We show that HSI-based fully-automatic tissue differentiation of 20 organ classes with deep neural networks is possible with high accuracy (> 95 %). We conclude from our study that automatic tissue discrimination based on HSI data is feasible and could thus aid in intraoperative decision making and pave the way for context-aware computer-assisted surgery systems and autonomous robotics.
2

FUTURE-AI: International consensus guideline for trustworthy and deployable artificial intelligence in healthcare

Karim Lekadir et al.Jan 1, 2023
Despite major advances in artificial intelligence (AI) for medicine and healthcare, the deployment and adoption of AI technologies remain limited in real-world clinical practice. In recent years, concerns have been raised about the technical, clinical, ethical and legal risks associated with medical AI. To increase real world adoption, it is essential that medical AI tools are trusted and accepted by patients, clinicians, health organisations and authorities. This work describes the FUTURE-AI guideline as the first international consensus framework for guiding the development and deployment of trustworthy AI tools in healthcare. The FUTURE-AI consortium was founded in 2021 and currently comprises 118 inter-disciplinary experts from 51 countries representing all continents, including AI scientists, clinicians, ethicists, and social scientists. Over a two-year period, the consortium defined guiding principles and best practices for trustworthy AI through an iterative process comprising an in-depth literature review, a modified Delphi survey, and online consensus meetings. The FUTURE-AI framework was established based on 6 guiding principles for trustworthy AI in healthcare, i.e. Fairness, Universality, Traceability, Usability, Robustness and Explainability. Through consensus, a set of 28 best practices were defined, addressing technical, clinical, legal and socio-ethical dimensions. The recommendations cover the entire lifecycle of medical AI, from design, development and validation to regulation, deployment, and monitoring. FUTURE-AI is a risk-informed, assumption-free guideline which provides a structured approach for constructing medical AI tools that will be trusted, deployed and adopted in real-world practice. Researchers are encouraged to take the recommendations into account in proof-of-concept stages to facilitate future translation towards clinical practice of medical AI.
Load More