To investigate the clinical significance of preoperative systemic immune-inflammation index (SII) in patients with colorectal cancer (CRC).A retrospective analysis of 1383 cases with CRC was performed following radical surgery. SII was calculated with the formula SII = (P × N)/L, where P, N, and L refer to peripheral platelet, neutrophil, and lymphocyte counts, respectively. The clinicopathological features and follow-up data were evaluated to compare SII with other systemic inflammation-based prognostic indices such as the neutrophil-lymphocyte ratio (NLR) and platelet-lymphocyte ratio (PLR) in patients with CRC.The optimal cut-off point for SII was defined as 340. The overall survival (OS) and disease-free survival (DFS) were better in patients with low NLR, PLR, and SII (P < 0.05). The SII was an independent predictor of OS and DFS in multivariate analysis. The area under the receiver-operating characteristics (ROC) curve for SII (0.707) was larger than those for NLR (0.602) and PLR (0.566). In contrast to NLR and PLR, SII could effectively discriminate between the TNM subgroups.SII is a more powerful tool for predicting survival outcome in patients with CRC. It might assist the identification of high-risk patients among patients with the same TNM stage.

Abstract Background The treatment gap between the number of people with mental disorders and the number treated represents a major public health challenge. We examine this gap by socio-economic status (SES; indicated by family income and respondent education) and service sector in a cross-national analysis of community epidemiological survey data. Methods Data come from 16 753 respondents with 12-month DSM-IV disorders from community surveys in 25 countries in the WHO World Mental Health Survey Initiative. DSM-IV anxiety, mood, or substance disorders and treatment of these disorders were assessed with the WHO Composite International Diagnostic Interview (CIDI). Results Only 13.7% of 12-month DSM-IV/CIDI cases in lower-middle-income countries, 22.0% in upper-middle-income countries, and 36.8% in high-income countries received treatment. Highest-SES respondents were somewhat more likely to receive treatment, but this was true mostly for specialty mental health treatment, where the association was positive with education (highest treatment among respondents with the highest education and a weak association of education with treatment among other respondents) but non-monotonic with income (somewhat lower treatment rates among middle-income respondents and equivalent among those with high and low incomes). Conclusions The modest, but nonetheless stronger, an association of education than income with treatment raises questions about a financial barriers interpretation of the inverse association of SES with treatment, although future within-country analyses that consider contextual factors might document other important specifications. While beyond the scope of this report, such an expanded analysis could have important implications for designing interventions aimed at increasing mental disorder treatment among socio-economically disadvantaged people.

Abstract Cuproptosis, a newly identified form of regulated cell death that is copper‐dependent, offers great opportunities for exploring the use of copper‐based nanomaterials inducing cuproptosis for cancer treatment. Here, a glucose oxidase (GOx)‐engineered nonporous copper(I) 1,2,4‐triazolate ([Cu(tz)]) coordination polymer (CP) nanoplatform, denoted as GOx@[Cu(tz)], for starvation‐augmented cuproptosis and photodynamic synergistic therapy is developed. Importantly, the catalytic activity of GOx is shielded in the nonporous scaffold but can be “turned on” for efficient glucose depletion only upon glutathione (GSH) stimulation in cancer cells, thereby proceeding cancer starvation therapy. The depletion of glucose and GSH sensitizes cancer cells to the GOx@[Cu(tz)]‐mediated cuproptosis, producing aggregation of lipoylated mitochondrial proteins, the target of copper‐induced toxicity. The increased intracellular hydrogen peroxide (H 2 O 2 ) levels, due to the oxidation of glucose, activates the type I photodynamic therapy (PDT) efficacy of GOx@[Cu(tz)]. The in vivo experimental results indicate that GOx@[Cu(tz)] produces negligible systemic toxicity and inhibits tumor growth by 92.4% in athymic mice bearing 5637 bladder tumors. This is thought to be the first report of a cupreous nanomaterial capable of inducing cuproptosis and cuproptosis‐based synergistic therapy in bladder cancer, which should invigorate studies pursuing rational design of efficacious cancer therapy strategies based on cuproptosis.

Abstract The Warburg effect is a hallmark of cancer that refers to the preference of cancer cells to metabolize glucose anaerobically rather than aerobically 1,2 . This results in substantial accumulation of lacate, the end product of anaerobic glycolysis, in cancer cells 3 . However, how cancer metabolism affects chemotherapy response and DNA repair in general remains incompletely understood. Here we report that lactate-driven lactylation of NBS1 promotes homologous recombination (HR)-mediated DNA repair. Lactylation of NBS1 at lysine 388 (K388) is essential for MRE11–RAD50–NBS1 (MRN) complex formation and the accumulation of HR repair proteins at the sites of DNA double-strand breaks. Furthermore, we identify TIP60 as the NBS1 lysine lactyltransferase and the ‘writer’ of NBS1 K388 lactylation, and HDAC3 as the NBS1 de-lactylase. High levels of NBS1 K388 lactylation predict poor patient outcome of neoadjuvant chemotherapy, and lactate reduction using either genetic depletion of lactate dehydrogenase A (LDHA) or stiripentol, a lactate dehydrogenase A inhibitor used clinically for anti-epileptic treatment, inhibited NBS1 K388 lactylation, decreased DNA repair efficacy and overcame resistance to chemotherapy. In summary, our work identifies NBS1 lactylation as a critical mechanism for genome stability that contributes to chemotherapy resistance and identifies inhibition of lactate production as a promising therapeutic cancer strategy.

Summary Grain size is determined by the number of cells and cell size of the grain. Regulation of grain size is crucial for improving crop yield. However, the genes and underlying molecular mechanisms controlling grain size remain elusive. Here we report a member of Detoxification efflux carrier (DTX)/Multidrug and Toxic Compound Extrusion (MATE) family transporter, BI G R ICE G RAIN 1 (BIRG1), negatively regulates the grain size in rice. BIRG1 is highly expressed in reproductive organs and roots. In birg1 grain, the size of the outer parenchyma layer cells of spikelet hulls is noticeably larger but the cell number is not altered compared with that in the wild-type (WT) grain. When expressed in Xenopus oocytes, BIRG1 exhibits chloride efflux activity. In line with the role of BIRG1 in mediating chloride efflux, the birg1 mutant shows reduced tolerance to salt stress under which the chloride level is toxic. Moreover, the birg1 grains contain higher level of chloride compared to WT grains when grown under normal paddy field. The birg1 roots accumulate more chloride than those of WT under saline condition. Collectively, our findings suggest that BIRG1 functions as a chloride efflux transporter regulating grain size and salt tolerance via controlling chloride homeostasis in rice.

Abstract Background Intestinal metaplasia (IM) is classified into complete intestinal metaplasia (CIM) and incomplete intestinal metaplasia (IIM). Patients diagnosed with IIM face an elevated susceptibility to the development of gastric cancer, underscoring the critical need for early screening measures. In addition to the complexities associated with diagnosis, the exact mechanisms driving the progression of gastric cancer in IIM patients remain poorly understood. OLFM4 is overexpressed in several types of tumors, including colorectal, gastric, pancreatic, and ovarian cancers, and its expression has been associated with tumor progression. Methods In this study, we used pathological sections from two clinical centers, biopsies of IM tissues, precancerous lesions of gastric cancer (PLGC) cell models, animal models, and organoids to explore the role of OLFM4 in IIM. Results Our results show that OLFM4 expression is highly increased in IIM, with superior diagnostic accuracy of IIM when compared to CDX2 and MUC2. OLFM4, along with MYH9, was overexpressed in IM organoids and PLGC animal models. Furthermore, OLFM4, in combination with Myosin heavy chain 9 (MYH9), accelerated the ubiquitination of GSK3β and resulted in increased β-catenin levels through the Wnt signaling pathway, promoting the proliferation and invasion abilities of PLGC cells. Conclusions OLFM4 represents a novel biomarker for IIM and could be utilized as an important auxiliary means to delimit the key population for early gastric cancer screening. Finally, our study identifies cell signaling pathways involved in the progression of IM.

Abstract In this study, we generated self-assembly cardiac organoids (COs) from human pluripotent stem cells by dual-phase modulation of Wnt/β-catenin pathway, utilizing CHIR99021 and IWR-1-endo. The resulting COs exhibited a diverse array of cardiac-specific cell lineages, cardiac cavity-like structures and demonstrated the capacity of spontaneous beating and vascularization in vitro . We further employed these complex and functional COs to replicate conditions akin to human myocardial infarction and SARS-CoV-2 induced fibrosis. These models accurately captured the pathological characteristics of these diseases, in both in vitro and in vivo settings. In addition, we transplanted the COs into NOD SCID mice and observed that they survived and exhibited ongoing expansion in vivo. Impressively, over a span of 75-day transplantation, these COs not only established blood vessel-like structures but also integrated with the host mice’s vascular system. It is noteworthy that these COs developed to a size of approximately 8 mm in diameter, slightly surpassing the dimensions of the mouse heart. This innovative research highlighted the potential of our COs as a promising avenue for cardiovascular research and therapeutic exploration.

Abstract The extracellular matrix (ECM) has been demonstrated to be dysregulated and crucial for malignant progression in gastric cancer (GC), but the mechanism is not well understood. Here, that discoidin domain receptor 1 (DDR1), a principal ECM receptor, is recognized as a key driver of GC progression is reported. Mechanistically, DDR1 directly interacts with the PAS domain of hypoxia‐inducible factor‐1α (HIF‐1α), suppresses its ubiquitination and subsequently strengthens its transcriptional regulation of angiogenesis. Additionally, DDR1 upregulation in GC cells promotes actin cytoskeleton reorganization by activating HIF‐1α/ Ras Homolog Family Member A (RhoA)/Rho‐associated protein kinase 1 (ROCK1) signaling, which in turn enhances the metastatic capacity. Pharmacological inhibition of DDR1 suppresses GC progression and angiogenesis in patient‐derived xenograft (PDX) and organoid models. Taken together, this work first indicates the effects of the DDR1‐HIF‐1α axis on GC progression and reveals the related mechanisms, providing experimental evidence for DDR1 as a therapeutic target for GC.

e23515 Background: Imatinib (IM) has significantly enhanced the prognosis of patients (pts) with advanced gastrointestinal stromal tumors (GISTs). The clinical outcomes may correlate with IM exposure. However, the efficacy threshold, particularly based on different primary KIT mutant, remains undefined. This study aimed to establish the efficacy threshold of IM plasma trough concentration (C min ) at steady-state in Chinese pts with advanced GIST, additionally to define subgroup thresholds based on various primary KIT mutations. Methods: This was a single-center, prospective, observational cohort study. Pts with histologically confirmed recurrent/metastatic GIST who received regular IM treatment and had undergone at least two measurements of steady-state IM C min were enrolled from Jul 2017 to Jun 2022. Clinical outcomes including objective response rate (ORR), survival, and IM C min were assessed. Results: A total of 168 pts with a median age of 52y were enrolled. The primary lesion locations comprised stomach, small intestine, rectum and others. Metastatic lesions were found in the liver, peritoneum, both liver and peritoneum and others. Median sum of longest diameter of target lesions was 10.7cm. Of 168 pts, 117 (69.6%) harbored KIT 11, 27 (16.1%) harbored KIT 9, 5 (3.0%) harbored PDGFRA, and 9 (5.4%) were KIT/PDGFRA wild type. During IM response period, 104 pts combined with surgical treatment (surgery or interventional therapy). After a median follow-up duration was 50.6m (range, 16.3–189.8), 72 pts had disease progression and 20 died. Estimated median progression-free survival (mPFS) for all patients was 79.4m (95%CI 55.7–103.1). The median overall survival was not reached. A C min threshold of ≥738ng/ml defined by log-rank test was associated with longer PFS for the whole population (P = 0.002) irrespective of other clinical characteristics. Pts with an IM C min below 738ng/ml exhibited a shorter mPFS (25.3m, 95%CI 41.9–97.1) compared to those surpassing this threshold (96.7m, 95%CI 65.8–127.6). The ORR for the whole population was 73.0% (CR 2.2%, PR 70.8%), with no significant difference observed between pts with IM C min below and above 738ng/ml. For pts with KIT 11 and KIT 9 mutations, the efficacy thresholds for IM C min were ≥680ng/ml and ≥1877ng/ml, respectively. Multivariate Cox regression analysis revealed that IM Cmin ≥738ng/ml, primary gastric origin, liver-only metastasis, sum of target lesions diameter ≤5cm, KIT 11 mutation, and combined with surgical treatment were favorable prognostic factors. Conclusions: IM exposure significantly correlates with clinical benefits in advanced GISTs, with an IM C min above 738ng/ml associated with a longer PFS in Chinese population. Considering different primary KIT mutant, a threshold of 680 ng/ml could be considered for efficacy in KIT 11 mutations, while a higher C min of 1877 ng/ml was necessary for KIT 9 mutation.

We present the most comprehensive catalogue of cancer-associated gene alterations through characterization of tumor transcriptomes from 1,188 donors of the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes project. Using matched whole-genome sequencing data, we attributed RNA alterations to germline and somatic DNA alterations, revealing likely genetic mechanisms. We identified 444 associations of gene expression with somatic non-coding single-nucleotide variants. We found 1,872 splicing alterations associated with somatic mutation in intronic regions, including novel exonization events associated with Alu elements. Somatic copy number alterations were the major driver of total gene and allele-specific expression (ASE) variation. Additionally, 82% of gene fusions had structural variant support, including 75 of a novel class called "bridged" fusions, in which a third genomic location bridged two different genes. Globally, we observe transcriptomic alteration signatures that differ between cancer types and have associations with DNA mutational signatures. Given this unique dataset of RNA alterations, we also identified 1,012 genes significantly altered through both DNA and RNA mechanisms. Our study represents an extensive catalog of RNA alterations and reveals new insights into the heterogeneous molecular mechanisms of cancer gene alterations.