To study the effect of host genetics on gut microbiome composition, the MiBioGen consortium curated and analyzed genome-wide genotypes and 16S fecal microbiome data from 18,340 individuals (24 cohorts). Microbial composition showed high variability across cohorts: only 9 of 410 genera were detected in more than 95% of samples. A genome-wide association study of host genetic variation regarding microbial taxa identified 31 loci affecting the microbiome at a genome-wide significant (P < 5 × 10−8) threshold. One locus, the lactase (LCT) gene locus, reached study-wide significance (genome-wide association study signal: P = 1.28 × 10−20), and it showed an age-dependent association with Bifidobacterium abundance. Other associations were suggestive (1.95 × 10−10 < P < 5 × 10−8) but enriched for taxa showing high heritability and for genes expressed in the intestine and brain. A phenome-wide association study and Mendelian randomization identified enrichment of microbiome trait loci in the metabolic, nutrition and environment domains and suggested the microbiome might have causal effects in ulcerative colitis and rheumatoid arthritis. Analysis of human genotypes and 16S microbiome data of 18,473 individuals from 25 cohorts through a genome-wide association study, a phenome-wide association study and Mendelian randomization identifies host genetic and microbial trait associations.

Differences in gut microbiota composition and function were observed between patients with inflammatory bowel disease or irritable bowel syndrome.

Abstract To study the effect of host genetics on gut microbiome composition, the MiBioGen consortium curated and analyzed genome-wide genotypes and 16S fecal microbiome data from 18,340 individuals (24 cohorts). Microbial composition showed high variability across cohorts: only 9 out of 410 genera were detected in more than 95% samples. A genome-wide association study (GWAS) of host genetic variation in relation to microbial taxa identified 31 loci affecting microbiome at a genome-wide significant (P<5×10 −8 ) threshold. One locus, the lactase ( LCT ) gene locus, reached study-wide significance (GWAS signal P=1.28×10 −20 ), and it showed an age-dependent association with Bifidobacterium abundance. Other associations were suggestive (1.95×10 −10 <P<5×10 −8 ) but enriched for taxa showing high heritability and for genes expressed in the intestine and brain. A phenome-wide association study and Mendelian randomization identified enrichment of microbiome trait loci in the metabolic, nutrition and environment domains and suggested the microbiome has causal effects in ulcerative colitis and rheumatoid arthritis.

Motivation: There is marked heterogeneity in transcutaneous vagal nerve stimulation (tVNS) based on the anatomical site (cervical/auricular), and the waveform parameters (fixed/variable frequency) of the stimulation. Goal(s): To explore the functional brain differences between cervical vagal nerve stimulation and auricular vagal nerve stimulation. Approach: Ultra-high field functional neuroimaging is performed of the neural correlates of tVNS with disparate anatomical sites and electrical waveform characteristics during rest in healthy participantsResults: Auricular stimulation with a variable frequency was shown to result in a significant decrease of the BOLD response in the amygdala and insular cortex compared to sham stimulation. Impact: There exist multiple knowledge gaps in the use of tVNS, which hinders the advancement of tVNS applications. This explorative study has shown the differences in neuronal response of auricular and cervical stimulation with fixed and variable frequencies.

Endometriosis is an estrogen-dependent chronic disease characterized by the presence of endometriumlike tissue outside the uterus and is often associated with symptoms, such as dysmenorrhea, dysuria, dyschezia, chronic pelvic pain, and infertility. Moreover, women diagnosed with endometriosis can report gastrointestinal symptoms, including bloating, constipation or diarrhea, and abdominal cramping, which can be associated with irritable bowel syndrome and can result in the misdiagnosis of endometriosis as irritable bowel syndrome at first. Treatment usually involves hormonal therapy, pain management, surgery, and/or assisted reproductive techniques in case of infertility. Nonetheless, these treatment methods can be insufficient for alleviating symptoms or can have unacceptable side effects, leading to noncompliance. Therefore, women often apply self-management strategies, including dietary interventions. One of the diets frequently suggested as a tool to manage endometriosis-related symptoms on social media and patient forums is a gluten-free diet. Although a gluten-free diet has been proven effective in managing nonceliac wheat sensitivity or celiac disease, its effectiveness in endometriosis remains uncertain. The Nurses' Health Study II found it unlikely that gluten intake was a strong factor in endometriosis etiology and symptomatology. To the best of our knowledge, the most frequently cited and sole published intervention study on the efficacy of a gluten-free diet for endometriosis has several important limiting factors, including the absence of a control group. In addition, gluten consumption is highly susceptible to a placebo effect and a nocebo effect, where women might experience symptom relief after eliminating gluten and return of symptoms after they consume gluten again, solely because they believe that gluten is bad for them. Despite the inverse association between body mass index and endometriosis and between a gluten-free diet and increased body mass index, this is an association, and no causality was proven. In addition, other factors should be taken into consideration. Of note, a gluten-free diet is expensive, has limited availability, and has a significant effect on quality of life. Moreover, without proper dietary guidance, it may adversely affect the gastrointestinal microbiome. Therefore, scientifically substantiated advice regarding the use of a gluten-free diet for endometriosis-related symptoms is currently not available, and a gluten-free diet should be discouraged unless there is an additional diagnosis of nonceliac wheat sensitivity or celiac disease.

ABSTRACT Introduction Chronic nausea and vomiting are symptoms of a wide range of gastrointestinal and non‐gastrointestinal conditions. Diagnosis can be challenging and requires a systematic and well‐structured approach. If the initial investigation for structural, toxic and metabolic disorders is negative, digestive motility and gut‐brain interaction disorders should be assessed. United European Gastroenterology (UEG) and the European Society for Neurogastroenterology and Motility (ESNM) identified the need for an updated, evidence‐based clinical guideline for the management of chronic nausea and vomiting. Methods A multidisciplinary team of experts in the field, including European specialists and national societies, participated in the development of the guideline. Relevant questions were addressed through a literature review and statements were developed and voted on according to a Delphi process. Results Ninety‐eight statements were identified and voted following the Delphi process. Overall agreement was high, although the grade of scientific evidence was low in many areas. Disagreement was more evident for some pharmacological treatment options. A diagnostic algorithm was developed, focussing on the differentiating features between gastrointestinal motility and gut‐brain interaction disorders with predominant nausea and vomiting. Conclusion These guidelines provide an evidence‐based framework for the evaluation and treatment of patients with chronic nausea and vomiting.

ABSTRACT Hypermobility spectrum disorders (HSD) and hypermobility Ehlers–Danlos syndrome (hEDS) are frequently associated with gastrointestinal symptoms, although the underlying mechanisms remain unclear. This study aimed to compare antroduodenal motility in patients with and without HSD/hEDS. We included 239 patients (50 HSD/hEDS and 189 non‐HSD/hEDS) with gastrointestinal symptoms undergoing antroduodenal manometry (ADM). The prevalence of antroduodenal dysmotility was not different between both groups, but enteric dysmotility was less common in the HSD/hEDS group (13% vs. 34%, p = 0.006). Delayed gastric emptying rates were similar, suggesting that delayed gastric emptying is more relevant for patients with HSD/hEDS and gastrointestinal symptoms.

Abstract In functional magnetic resonance imaging (fMRI) of the brain the signal is dominated by (physiological) noise. Imaging at ultrahigh field strength is becoming increasingly popular as it offers increased spatial accuracy. The latter is of particular benefit in brainstem neuroimaging given the small cross-sectional area of most nuclei. Physiological noise scales with field strength in fMRI acquisitions, however. Although this problem is in part solved by decreasing voxel size, it is clear that adequate physiological denoising is of utmost importance in brainstem-focused fMRI experiments. Multi-echo sequences have been reported to facilitate highly effective denoising through TE-dependence of Blood Oxygen Level Dependent (BOLD) signals, in a denoising method referred to as multi-echo independent component analysis (ME-ICA). It has not been explored previously how ME-ICA compares to other data-driven denoising approaches at ultrahigh field strength. In the current study, we compared the efficacy of several denoising methods, including anatomical component based correction (aCompCor), Automatic Removal of Motion Artifacts (ICA-AROMA), ME-ICA, and a combination of ME-ICA and aCompCor. We assessed several data quality metrics, including temporal signal-to-noise ratio (tSNR), delta variation signal (DVARS) and spectral density of the global signal. Moreover, we looked at the ability of each method to uncouple the global signal and respiration. In line with previous reports at lower field strengths, we demonstrate that after applying ME-ICA, the data is best post-processed in order to remove spatially diffuse noise with a method such as aCompCor. Our findings indicate that ME-ICA combined with aCompCor and ICA-AROMA are highly effective denoising approaches for multi-echo data acquired at 7T. ME-ICA combined with aCompCor potentially preserves more signal-of-interest as compared to ICA-AROMA. Highlights - ME-ICA and ICA-AROMA provide effective denoising for multi-echo 7T fMRI data - High tSNR can be achieved in the brainstem with a multi-echo acquisition at 7T - After ME-ICA, the data is best post-processed to correct for spatially diffuse noise

Real-time assessment of gastrointestinal (GI) symptoms in irritable bowel syndrome (IBS) using the experience sampling method (ESM) is suggested as a more appropriate approach than currently used end-of-day or end-of-week reports. This psychometric evaluation study assesses the validity and reliability of a previously developed ESM-based patient-reported outcome measure (PROM) for real-time GI symptom assessment in IBS.