WY
Weihua Yue
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
11
(64% Open Access)
Cited by:
955
h-index:
34
/
i10-index:
127
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Comparative genetic architectures of schizophrenia in East Asian and European populations

Max Lam et al.Nov 18, 2019
+53
Z
C
M
Schizophrenia is a debilitating psychiatric disorder with approximately 1% lifetime risk globally. Large-scale schizophrenia genetic studies have reported primarily on European ancestry samples, potentially missing important biological insights. Here, we report the largest study to date of East Asian participants (22,778 schizophrenia cases and 35,362 controls), identifying 21 genome-wide-significant associations in 19 genetic loci. Common genetic variants that confer risk for schizophrenia have highly similar effects between East Asian and European ancestries (genetic correlation = 0.98 ± 0.03), indicating that the genetic basis of schizophrenia and its biology are broadly shared across populations. A fixed-effect meta-analysis including individuals from East Asian and European ancestries identified 208 significant associations in 176 genetic loci (53 novel). Trans-ancestry fine-mapping reduced the sets of candidate causal variants in 44 loci. Polygenic risk scores had reduced performance when transferred across ancestries, highlighting the importance of including sufficient samples of major ancestral groups to ensure their generalizability across populations.
1
Citation525
0
Save
0

Genome-wide association analysis identifies 30 new susceptibility loci for schizophrenia

Zhiqiang Li et al.Oct 9, 2017
+35
J
X
Z
A genome-wide association analysis using data from Chinese individuals combined with a transethnic meta-analysis of Psychiatry Genomics Consortium data identifies 30 new loci for schizophrenia. These analyses improve the fine-mapping of susceptibility loci and implicate multiple pathways in schizophrenia biology. We conducted a genome-wide association study (GWAS) with replication in 36,180 Chinese individuals and performed further transancestry meta-analyses with data from the Psychiatry Genomics Consortium (PGC2). Approximately 95% of the genome-wide significant (GWS) index alleles (or their proxies) from the PGC2 study were overrepresented in Chinese schizophrenia cases, including ∼50% that achieved nominal significance and ∼75% that continued to be GWS in the transancestry analysis. The Chinese-only analysis identified seven GWS loci; three of these also were GWS in the transancestry analyses, which identified 109 GWS loci, thus yielding a total of 113 GWS loci (30 novel) in at least one of these analyses. We observed improvements in the fine-mapping resolution at many susceptibility loci. Our results provide several lines of evidence supporting candidate genes at many loci and highlight some pathways for further research. Together, our findings provide novel insight into the genetic architecture and biological etiology of schizophrenia.
0
Citation415
0
Save
0

Comparative genetic architectures of schizophrenia in East Asian and European populations

Max Lam et al.Oct 17, 2018
+58
Z
C
M
Author summary Schizophrenia is a severe psychiatric disorder with a lifetime risk of about 1% world-wide. Most large schizophrenia genetic studies have studied people of primarily European ancestry, potentially missing important biological insights. Here we present a study of East Asian participants (22,778 schizophrenia cases and 35,362 controls), identifying 21 genome-wide significant schizophrenia associations in 19 genetic loci. Over the genome, the common genetic variants that confer risk for schizophrenia have highly similar effects in those of East Asian and European ancestry (r g =0.98), indicating for the first time that the genetic basis of schizophrenia and its biology are broadly shared across these world populations. A fixed-effect meta-analysis including individuals from East Asian and European ancestries revealed 208 genome-wide significant schizophrenia associations in 176 genetic loci (53 novel). Trans-ancestry fine-mapping more precisely isolated schizophrenia causal alleles in 70% of these loci. Despite consistent genetic effects across populations, polygenic risk models trained in one population have reduced performance in the other, highlighting the importance of including all major ancestral groups with sufficient sample size to ensure the findings have maximum relevance for all populations.
0
Citation12
0
Save
0

Childhood urbanization affects prefrontal cortical responses to trait anxiety and interacts with polygenic risk for depression

Xiao Zhang et al.Jan 12, 2018
+16
X
H
X
Abstract Global increases in urbanization have brought dramatic economic, environmental and social changes. However, less is understood about how these may influence disease-related brain mechanisms underlying epidemiological observations that urban birth and childhoods may increase the risk for neuropsychiatric disorders, including increased social stress and depression. In a genetically homogeneous Han Chinese adult population with divergent urban and rural birth and childhoods, we examined the structural and functional MRI neural correlates of childhood urbanicity, focusing on behavioral traits responding to social status threats, and polygenic risk for depression. Subjects with divergent rural and urban childhoods were similar in adult socioeconomic status and were genetically homogeneous. Urban childhoods, however, were associated with higher trait anxiety-depression. On structural MRI, urban childhoods were associated with relatively reduced medial prefrontal gray matter volumes. Functional medial prefrontal engagement under social status threat during working memory correlated with trait anxiety-depression in subjects with urban childhoods, to a significantly greater extent than in their rural counterparts, implicating an exaggerated physiological response to the threat context. Stress-associated medial prefrontal engagement also interacted with polygenic risk for depression, significantly predicting a differential response in individuals with urban but not rural childhoods. Developmental urbanicity thus differentially influenced medial prefrontal structure and function, at least in part through mechanisms associated with the neural processing of social status threat, trait anxiety, and genetic risk for depression, which may be factors in the association of urbanicity with adult psychopathology. Significance Statement Urban living has been associated with social inequalities and stress. However, less is understood about the neural underpinnings by which these stressors affect disease risk, and in particular, genetic risk for depression. Leveraging urbanization in China, we studied adults with diverse urban and rural upbringings, who were genetically homogeneous and with similar current socioeconomic status, to isolate the effects of childhood urbanicity. At medial prefrontal cortex, a region critical for processing emotional stressors and social status, genetic risk for depression resulted in more deleterious function under stress in individuals with urban, but not rural childhoods. This implicates medial prefrontal cortex’s critical role in brain development, integrating genetic mechanisms of stress and depression with the childhood environment.
0

Genome-wide association study identifies common genetic risk factors for alcohol, heroin and methamphetamine dependence

Yan Sun et al.Dec 26, 2018
+10
F
L
Y
Abstract Background Common molecular and cellular foundations underlie different types of substance dependence (SD). However direct evidence for common genetic factors of SD is lacking. Here we aimed to identify specific genetic variants that are shared between alcoholism, heroin and methamphetamine dependence. Methods We first conducted a combined case-control genome-wide association analysis (GWAS) of 521 alcoholic, 1,026 heroin and 1,749 methamphetamine patients and 2,859 healthy controls. We then replicated the significant loci using an independent cohort (146 alcoholic, 1,045 heroin, 763 methamphetamine and 1,904 controls). Second, we examined the genetic effects of these identified SNPs on gene expression, addiction characteristics and brain images (gray and white matter). Furthermore, we investigated the effects of these genetic variants on addiction behaviors using self-administration rat models. Results We identified and validated four genome-wide significant loci in the combined cohorts in the discovery stage: ADH1B rs1229984 (P=6.45×10 −10 ), ANKS1B rs2133896 (P=4.09×10 −8 ), AGBL4 rs147247472 (P=4.30×10 −8 ) and CTNNA2 rs10196867 (P=4.67×10 −8 ). Association results for each dependence group showed that ADH1B rs1229984 was only associated with alcoholism, while the other three loci were associated with heroin, methamphetamine addiction and alcoholism respectively. Variants that were strongly linked to rs2133896 affected ANKS1B gene expression, heroin use frequency and interacted with heroin dependence to affect gray matter of the left calcarine and white matter of the right superior longitudinal fasciculus. In addition, the reduced anks1b expression in the ventral tegmental area increased addiction vulnerability for heroin and methamphetamine in self-administration rat models. Conclusion Our findings revealed several novel genome-wide significant SNPs and genes that synchronously affected the vulnerability and phenotypes for alcoholism, heroin and MA dependence. These findings could shed light on the root cause and the generalized vulnerability for SD.
0
Citation1
0
Save
0

Tracing neurodiverse disruptions underlying emotional episodic memory to diagnosis-specific network of emotional regulation in psychiatric disorders

Yang Xiao et al.Jun 28, 2024
+9
X
M
Y
Objective: Emotional dysfunctions are prevalent across various psychiatric disorders, leading to diverse emotional problems. Disrupted emotional episodic memory is a prominent deficit and may underlie various affective symptoms in clinical phenotypes. However, diagnosis-specific of neurodiverse disruptions remain elusive. Methods: We used task-based functional magnetic resonance imaging (fMRI) and a normative modelling framework to establish a reference for functional activation during emotional episodic memory, drawing from a large dataset of healthy individuals (n = 409). Individualized deviations from this reference were evaluated using a clinical dataset of 328 participants, which included 168 healthy controls and patients with major depressive disorder (MDD, n = 56), bipolar disorder (BD, n = 31), and schizophrenia (SZ, n = 73). Regional deviations were mapped to four large-scale emotional regulation networks and used to predict affective symptoms across different mental disorders. Results: We constructed a verifiable normative model of functional activation during emotional episodic memory to parse clinical heterogeneity. Diagnosis-specific regional deviations were enriched in the non-overlapping large-scale emotional regulation networks: MDD showed enrichment in emotion regulation network related to emotion perception and generation, BD in cognitive appraisal and emotional reactivity, and SZ in working memory and response inhibition. Individualized deviations significantly predicted affective symptom in distinct disorder, and specific emotional regulation network showed maximum feature weight. Conclusions: These findings have potential implications for the understanding of dissociable neuropathological patterns of affective symptoms and improving individualized clinical diagnosis and treatment in psychiatric disorders.
0

Research on the Energy Dissipation Characteristics and Stress Wave Spectrum Analysis of Red Sandstone Subjected to Progressive Load Cyclic Impact

Qian Zhang et al.Aug 21, 2024
+2
Y
E
Q
0

Decision Characteristics Underlying Non-Suicidal Self-Injury in Patients with Major Depressive Disorder

Yi-Long Lu et al.Dec 12, 2023
+11
M
Y
Y
Abstract Background Non-suicidal self-injury (NSSI) behavior is significantly prevalent in both adolescents and psychiatric populations, particularly in individuals with major depressive disorder (MDD). NSSI can be considered a result of risky decision-making in response to negative emotions, where individuals choose self-harm over other less harmful alternatives, suggesting a potential decision-making deficit in those engaging in NSSI. This study delves into the complex relationship between NSSI and depression severity in decision-making and its cognitive underpinnings. Methods We assessed decision behaviors in 57 MDD patients with NSSI, 42 MDD patients without NSSI and 142 healthy controls using the Balloon Analogue Risk Task, which involves risk-taking, learning, and exploration in uncertain scenarios. Using computational modeling, we dissected the nuanced cognitive dimensions influencing decision behaviors. A novel statistical method was developed to elucidate the interaction effects between NSSI and depression severity. Results Contrary to common perceptions, we found that individuals with NSSI behaviors were typically more risk-averse. Meanwhile, there was a complex interaction between NSSI and depression severity in shaping risk-taking behaviors. As depressive symptoms intensified, these NSSI individuals began to perceive less risk and behave more randomly. Conclusions This research provides new insights into the cognitive aspects of NSSI and depression, highlighting the importance of considering the influence of comorbid mental disorders when investigating the cognitive underpinnings of such behaviors, especially in the context of prevalent cross-diagnostic phenomena like NSSI behaviors.
0

Application and Effect Evaluation of Minimally Invasive Surgery in the Treatment of Hepatobiliary Diseases

Jianfei Hu et al.May 23, 2024
Y
W
J
This article reviews the application, effect evaluation, challenges, and future prospects of minimally invasive surgery in the treatment of hepatobiliary diseases.Minimally invasive surgery, as a modern medical technology with less trauma and faster recovery, has shown significant advantages in the treatment of hepatobiliary diseases compared with traditional surgical methods.This article first introduces the background of hepatobiliary diseases and the development process of minimally invasive surgery.It emphasizes the importance of research, including improving treatment efficacy, reducing the burden on patients, and promoting progress in medical technology.Subsequently, the definition, classification, basic principles, and common techniques of minimally invasive surgery are elaborated.In this article, the minimally invasive treatment of hepatobiliary system diseases is discussed, focusing on the analysis of minimally invasive treatment methods and clinical applications for liver, gallbladder, and bile duct diseases.The evaluation of minimally invasive surgery includes assessing the surgical success rate, postoperative complication rate, patient satisfaction, and its comparison with traditional surgical methods.Finally, the challenges of minimally invasive surgery, such as technical difficulty, high cost, and uneven distribution of medical resources, are discussed.The future development trend of technological innovation, education and training, and policy support is also anticipated.Strategic suggestions for promoting minimally invasive surgery are proposed.
0

Genome-wide Associations of Flavivirus Capsid Proteins

Priscilla Boon et al.Apr 11, 2019
+7
F
A
P
Dengue virus (DENV) and Zika virus (ZIKV) are both positive sense single-stranded RNA viruses. They are packaged within the virion with a capsid (C) protein to form the nucleocapsid. Based on cryo-electron microscopy imaging, the nucleocapsid has been described as lacking symmetry, whilst there is distinguishable separation of the C proteins from the viral RNA (vRNA) genome. Here, to elucidate the architecture of the nucleocapsid of DENV serotype 2 and ZIKV, we used a nuclease digestion assay and next-generation sequencing to map the respective vRNA genome wide association with the C protein in vitro. The C protein exhibited non-uniform binding along the vRNA, and as C protein concentration increased, the normalized read counts also increased. A saturation point of 1:100 (vRNA:C protein monomers) was found, and binding regions showed variable saturation patterns. We also observed that C protein had a preference for G-rich sequences for both viruses. Taken together, we demonstrate that the DENV 2 and ZIKV C proteins bind vRNA in a non-uniform manner with distinct patterns of association.
Load More