DP
Deepak Parashar
Author with expertise in Coronavirus Disease 2019 Research
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(83% Open Access)
Cited by:
18
h-index:
21
/
i10-index:
34
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Orphan nuclear receptorNR2E3and its small-molecule agonist induce cancer cell apoptosis through regulating p53, IFNα and MYC pathways

Yidan Wang et al.Dec 26, 2023
Abstract Orphan nuclear receptor NR2E3 activates p53 and induces cancer cell apoptosis. Further studies on p53-dependent and -independent functions of wild-type and mutated NR2E3 are needed. Herein, we showed that NR2E3 enhanced p53-DNA interactions in diverse cancer cells and up-regulated p53 and IFNα pathways while down-regulating MYC pathway in cervical cancer cells. Studies of “All of Us” and TCGA databases showed NR2E3 nonsynonymous mutations’ associating with four cancers. We stratified NR2E3 SNVs for their cancer implications with the p53 reporter. A cancer-associated NR2E3 R97H mutation not only lost the wild-type’s tumor-suppressing functions but also prohibited the wild-type from enhancing p53 acetylation. These observations implicated the potential for pharmaceutically activating NR2E3 to suppress cancer. Indeed, NR2E3’s small-molecule agonist 11a repressed 2-D and 3-D cultures of primary cells and cell lines of cervical cancer, in which screening FDA-approved anti-cancer drugs identified HDAC-1/2 inhibitor Romidepsin operating synergistically with 11a. The underlying molecular mechanisms included 11a’s down-regulating the transcription of Multidrug Resistance Protein ABCB1 that Romidepsin up-regulated. Transcriptomics studies revealed three synergy modes: (1) “sum-up” mode that the p53 pathway activated individually by 11a and Romidepsin got stronger by the combo; (2) “antagonism” mode that Romidepsin counteracted the activation of the Kras pathway by 11a; and (3) “de novo” mode that the combo instead of each individual drug repressed the MYC pathway. Conclusively, our experiments provide new data supporting tumor-suppressor like functions for wild-type NR2E3 , reveal roles of mutated NR2E3 in cancer, and address values of NR2E3’s agonist 11a in cancer therapy alone and combined.
6

RNA-binding protein FXR1 drives cMYC translation by mRNA circularization through eIF4F recruitment in ovarian cancer

Jasmine George et al.Jul 19, 2020
Abstract Background The RNA-binding protein FXR1 (fragile X-related protein 1) has been implicated as an important regulator of post-transcriptional changes of mRNAs. However, its role in mRNA circularization and recruitment of eukaryotic translation initiation factors for protein translation remains obscure. Here, we aimed to investigate the molecular mechanisms and potential clinical applications of FXR1 in ovarian cancer growth and progression. Methods FXR1 copy number variation, mRNA expression, protein levels, and their association with prognosis were determined in clinical datasets. An orthotopic ovarian cancer model and bioluminescence imaging were used for preclinical evaluation of FXR1 in vivo . Reverse phase protein arrays (RPPA) and qPCR arrays were performed to identify FXR1’s key targets and downstream effects. SUnSET and polysome profiling were used to determine the translational effects of FXR1. Immunoprecipitation and immunofluorescence were performed to identify the interaction between FXR1 and cMYC mRNA and eIF4F complex. RNA-immunoprecipitation (RIP), RNA electrophoretic mobility shift assays (REMSA), proximity ligation assays (PLA), and biochemical assays were used to identify the specific site on cMYC mRNA to which FXR1 binds to promote mRNA circularization and translation. Results We found that amplification and copy-gain of FXR1 increased the expression of FXR1 mRNA and FXR1 protein in ovarian cancer patients, and these events associated with poor prognosis. We demonstrated that FXR1 binds to AU-rich elements (ARE) within the 3’ untranslated region (3’UTR) of cMYC. As a consequence, FXR1 binding to cMYC 3’UTR leads to the circularization of mRNA and facilitated the recruitment of eukaryotic translation initiation factors (eIFs) to translation start site for improving protein synthesis. Conclusion We found that FXR1 upregulates a known oncogene, cMYC, by binding to AU-rich elements within the 3’UTR, leading to the recruitment of the eIF4F complex for cMYC translation. Our findings uncover a novel mechanism of action of FXR1 in tumorigenesis and provides opportunities to use FXR1 and its downstream effectors as biomarkers or therapeutic targets in ovarian and other cancers.
0

Blocking Oncostatin M receptor abrogates STAT3 mediated integrin signaling and overcomes chemoresistance in ovarian cancer

Anjali Geethadevi et al.Jun 5, 2024
Abstract Chemotherapy such as cisplatin is widely used to treat ovarian cancer either before or after surgical debulking. However, cancer relapse due to chemotherapy resistance is a major challenge in the treatment of ovarian cancer. The underlying mechanisms related to chemotherapy resistance remain largely unclear. Therefore, identification of effective therapeutic strategies is urgently needed to overcome therapy resistance. Transcriptome-based analysis, in vitro studies and functional assays identified that cisplatin-resistant ovarian cancer cells express high levels of OSMR compared to cisplatin sensitive cells. Furthermore, OSMR expression associated with a module of integrin family genes and predominantly linked with integrin αV (ITGAV) and integrin β3 (ITGB3) for cisplatin resistance. Using ectopic expression and knockdown approaches, we proved that OSMR directly regulates ITGAV and ITGB3 gene expression through STAT3 activation. Notably, targeting OSMR using anti-OSMR human antibody inhibited the growth and metastasis of ovarian cancer cells and sensitized cisplatin treatment. Taken together, our results underscore the pivotal role of OSMR as a requirement for cisplatin resistance in ovarian cancer. Notably, OSMR fostered the expression of a distinct set of integrin genes, which in turn resulted into a crosstalk between OSMR and integrins for signaling activation that is critical for cisplatin resistance. Therefore, targeting OSMR emerges as a promising and viable strategy to reverse cisplatin-resistance in ovarian cancer.