The β-chemokine receptor CCR5 is considered to be an attractive target for inhibition of macrophage-tropic (CCR5-using or R5) HIV-1 replication because individuals having a nonfunctional receptor (a homozygous 32-bp deletion in the CCR5 coding region) are apparently normal but resistant to infection with R5 HIV-1. In this study, we found that TAK-779, a nonpeptide compound with a small molecular weight ( M r 531.13), antagonized the binding of RANTES (regulated on activation, normal T cell expressed and secreted) to CCR5-expressing Chinese hamster ovary cells and blocked CCR5-mediated Ca 2+ signaling at nanomolar concentrations. The inhibition of β-chemokine receptors by TAK-779 appeared to be specific to CCR5 because the compound antagonized CCR2b to a lesser extent but did not affect CCR1, CCR3, or CCR4. Consequently, TAK-779 displayed highly potent and selective inhibition of R5 HIV-1 replication without showing any cytotoxicity to the host cells. The compound inhibited the replication of R5 HIV-1 clinical isolates as well as a laboratory strain at a concentration of 1.6–3.7 nM in peripheral blood mononuclear cells, though it was totally inactive against T-cell line-tropic (CXCR4-using or X4) HIV-1.

We report a new web server, aLeaves (http://aleaves.cdb.riken.jp/), for homologue collection from diverse animal genomes. In molecular comparative studies involving multiple species, orthology identification is the basis on which most subsequent biological analyses rely. It can be achieved most accurately by explicit phylogenetic inference. More and more species are subjected to large-scale sequencing, but the resultant resources are scattered in independent project-based, and multi-species, but separate, web sites. This complicates data access and is becoming a serious barrier to the comprehensiveness of molecular phylogenetic analysis. aLeaves, launched to overcome this difficulty, collects sequences similar to an input query sequence from various data sources. The collected sequences can be passed on to the MAFFT sequence alignment server (http://mafft.cbrc.jp/alignment/server/), which has been significantly improved in interactivity. This update enables to switch between (i) sequence selection using the Archaeopteryx tree viewer, (ii) multiple sequence alignment and (iii) tree inference. This can be performed as a loop until one reaches a sensible data set, which minimizes redundancy for better visibility and handling in phylogenetic inference while covering relevant taxa. The work flow achieved by the seamless link between aLeaves and MAFFT provides a convenient online platform to address various questions in zoology and evolutionary biology.