Summary Memory B cells (MBCs) represent a second layer of immune protection against SARS-CoV-2. Whether MBCs elicited by mRNA vaccines can recognize the Omicron variant is of major concern. We used bio-layer interferometry to assess the affinity against the receptor-binding-domain (RBD) of Omicron spike of 313 naturally expressed monoclonal IgG that were previously tested for affinity and neutralization against VOC prior to Omicron. We report here that Omicron evades recognition from a larger fraction of these antibodies than any of the previous VOCs. Additionally, whereas 30% of these antibodies retained high affinity against Omicron-RBD, our analysis suggest that Omicron specifically evades antibodies displaying potent neutralizing activity against the D614G and Beta variant viruses. Further studies are warranted to understand the consequences of a lower memory B cell potency on the overall protection associated with current vaccines.

Summary How a previous SARS-CoV-2 infection may amplify and model the memory B cell (MBC) response elicited by mRNA vaccines was addressed by a comparative longitudinal study of two cohorts, naive individuals and disease-recovered patients, up to 2 months after vaccination. The quality of the memory response was assessed by analysis of the VDJ repertoire, affinity and neutralization against variants of concerns (VOC), using unbiased cultures of 2452 MBCs. Upon boost, the MBC pool of recovered patients selectively expanded, further matured and harbored potent neutralizers against VOC. Maturation of the MBC response in naive individuals was much less pronounced. Nevertheless, and as opposed to their weaker neutralizing serum response, half of their RBD-specific MBCs displayed high affinity towards multiple VOC and one-third retained neutralizing potency against B.1.351. Thus, repeated vaccine challenges could reduce these differences by recall of affinity-matured MBCs and allow naive vaccinees to cope efficiently with VOC.