We have identified a small-molecule inhibitor of tumor necrosis factor α (TNF-α) that promotes subunit disassembly of this trimeric cytokine family member. The compound inhibits TNF-α activity in biochemical and cell-based assays with median inhibitory concentrations of 22 and 4.6 micromolar, respectively. Formation of an intermediate complex between the compound and the intact trimer results in a 600-fold accelerated subunit dissociation rate that leads to trimer dissociation. A structure solved by x-ray crystallography reveals that a single compound molecule displaces a subunit of the trimer to form a complex with a dimer of TNF-α subunits.

Abstract We present avidity sequencing - a novel sequencing chemistry that separately optimizes the process of stepping along a DNA template and the process of identifying each nucleotide within the template. Nucleotide identification uses multivalent nucleotide ligands on dye-labeled cores to form polymerase-polymer nucleotide complexes bound to clonal copies of DNA targets. These polymer-nucleotide substrates, termed avidites, decrease the required concentration of reporting nucleotides from micromolar to nanomolar, and yield negligible dissociation rates. We demonstrate the use of avidites as a key component of a sequencing technology that surpasses Q40 accuracy and enables a diversity of applications that include single cell RNA-seq and whole human genome sequencing. We also show the advantages of this technology in sequencing through long homopolymers.