GW
Guangyu Wan
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Rice NIN-LIKE PROTEIN 3 plays a significant role in nitrogen use efficiency and grain yield under nitrate-sufficient conditions

Zi‐Sheng Zhang et al.Feb 20, 2021
Abstract Nitrogen (N) is an essential macronutrient for crop growth and yield, but excessive application of N fertilizer has caused serious environmental pollution and greatly increased the cost of agricultural production. One of the effective and economical solutions to this dilemma is to improve the N use efficiency (NUE) of crops. Although some components involved in regulating NUE have been identified, the underlying molecular mechanism remains largely elusive in rice. Here we report that the OsNLP3 (NIN-like protein 3) is an important regulator in NUE and grain yield under nitrate-sufficient conditions. Both NUE and grain yield were significantly improved by enhanced OsNLP3 expression in the field, but reduced in osnlp3 mutants. The expression of OsNLP3 responds to both nitrate and ammonium, while OsNLP3 nuclear retention is only induced by nitrate, not by ammonium. OsNLP3 regulates the expression of a set of genes involved in N transport and assimilation by directly binding to the nitrate-responsive cis -element in the promoters of these genes. Our study demonstrates that OsNLP3 is significant for the regulation of NUE and grain yield, particularly in nitrate-rich conditions, thus providing a candidate for improving NUE and grain yield in rice.
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ERF1 inhibits lateral root emergence by promoting local auxin accumulation with altered distribution and repressingARF7expression

Ping‐Xia Zhao et al.Mar 3, 2023
Summary Lateral roots (LRs) are crucial for plants to sense environmental signals in addition to water and nutrient absorption. Auxin is key for LR formation, but the underlying mechanisms are not fully understood. Here we report that Arabidopsis ERF1 inhibits LR emergence by promoting local auxin accumulation with altered distribution and regulating auxin signaling. Loss of ERF1 increases LR density compared with the wild type, whereas ERF1 overexpression causes the opposite phenotype. ERF1 enhances auxin transport by upregulating PIN1 and AUX1 , resulting in excessive auxin accumulation in the endodermal, cortical, and epidermal cells surrounding LR primordia. Furthermore, ERF1 represses ARF7 transcription, consequently affecting the expression of cell wall remodeling genes that facilitate LR emergence. Together, our study reveals that ERF1 integrates environmental signals to promote local auxin accumulation with altered distribution and repress ARF7 , consequently inhibiting LR emergence in adaptation to fluctuating environments. Highlights ERF1 functions as a negative regulator of lateral root emergence ERF1 enhances rootward and shootward auxin transport by directly upregulating the expression of PIN1 and AUX1 , resulting in high local auxin accumulation and abnormal auxin distribution in the endodermal, cortical, and epidermal cells overlying lateral root primordia ERF1 represses the transcription of ARF7 and cell wall remodeling genes in lateral root emergence
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Rice NIN-LIKE PROTEIN 4 is a master regulator of nitrogen use efficiency

Jie Wu et al.Jan 17, 2020
Nitrogen (N) is one of the key essential macronutrients that affects rice growth and yield. Inorganic N fertilizers are excessively used to boost yield and generate serious collateral environmental pollution. Therefore, improving crop N use efficiency (NUE) is highly desirable and has been a major endeavor in crop improvement. However, only a few regulators have been identified that can be used to improve NUE in rice to date. Here we show that the NIN-like protein OsNLP4 significantly improves the rice NUE and yield. Field trials consistently showed that loss-of-OsNLP4 dramatically reduced yield and NUE compared with wild type under different N regimes. In contrast, the OsNLP4 overexpression lines remarkably increased yield by 30% and NUE by 47% under moderate N level compared with wild type. Transcriptomic analyses revealed that OsNLP4 orchestrates the expression of a majority of known N uptake, assimilation and signaling genes by directly binding to the nitrate-responsive cis-element in their promoters to regulate their expression. Moreover, overexpression of OsNLP4 can recover the phenotype of Arabidopsis nlp7 mutant and enhance its biomass. Our results demonstrate that OsNLP4 is a master regulator of NUE in rice and sheds light on crop NUE improvement.