JT
John Taylor
Author with expertise in Hepatitis B Infection and Treatment
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
10
(70% Open Access)
Cited by:
3,915
h-index:
86
/
i10-index:
256
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Apolipoprotein E associated with astrocytic glia of the central nervous system and with nonmyelinating glia of the peripheral nervous system.

J Boyles et al.Oct 1, 1985
+2
E
R
J
The plasma protein apolipoprotein (apo) E is an important determinant of lipid transport and metabolism in mammals. In the present study, immunocytochemistry has been used to identify apo E in specific cells of the central and peripheral nervous systems of the rat. Light microscopic examination revealed that all astrocytes, including specialized astrocytic cells (Bergmann glia of the cerebellum, tanycytes of the third ventricle, pituicytes of the neurohypophysis, and Müller cells of the retina), possessed significant concentrations of apo E. In all of the major subdivisions of the central nervous system, the perinuclear region of astrocytic cells, as well as their cell processes that end on basement membranes at either the pial surface or along blood vessels, were found to be rich in apo E. Extracellular apo E was present along many of these same surfaces. The impression that apo E is secreted by astrocytic cells was confirmed by electron microscopic immunocytochemical studies, which demonstrated the presence of apo E in the Golgi apparatus. Apo E was not present in neurons, oligodendroglia, microglia, ependymal cells, and choroidal cells. In the peripheral nervous system, apo E was present within the glia surrounding sensory and motor neurons; satellite cells of the dorsal root ganglia and superior cervical sympathetic ganglion as well as the enteric glia of the intestinal ganglia were reactive. Apo E was also present within the non-myelinating Schwann cells but not within the myelinating Schwann cells of peripheral nerves. These results suggest that apo E has an important, previously unsuspected role in the physiology of nervous tissue.
0
Citation780
0
Save
0

miR-122, a Mammalian Liver-Specific microRNA, is Processed from hcr mRNA and MayDownregulate the High Affinity Cationic Amino Acid Transporter CAT-1

Jinhong Chang et al.Jul 1, 2004
+9
D
É
J
These studies show that miR-122, a 22-nucleotide microRNA, is derived from a liver-specificnon-coding polyadenylated RNA transcribed from the gene hcr. The exact sequence of miR-122as well as the adjacent secondary structure within the hcr mRNA are conserved from mammalianspecies back to fish. Levels of miR-122 in the mouse liver increase to half maximal valuesaround day 17 of embryogenesis, and reach near maximal levels of 50,000 copies per averagecell before birth. Lewis et al (2003) predicted the cationic amino acid transporter (CAT-1 orSLC7A1) as a miR-122 target. CAT-1 protein and its mRNA are expressed in all mammaliantissues but with lower levels in adult liver. Furthermore, during mouse liver development CAT-1mRNA decreases in an almost inverse correlation with miR-122. Eight potential miR-122 targetsites were predicted within the human CAT-1 mRNA, with six in the 3’-untranslated region.Using a reporter construct it was found that just three of the predicted sites, linked in a 400-nucleotide sequence from human CAT-1, acted with synergy and were sufficient to stronglyinhibit protein synthesis and reduce mRNA levels. In summary, these studies followed theaccumulation during development of miR-122 from its mRNA precursor, hcr, through toidentification of what may be a specific mRNA target, CAT-1. Link to supplemental material:http://www.landesbioscience.com/supplement/changRNA1-2-sup.pdf
0
Citation776
0
Save
0

Efficient transcription of RNA into DNA by avian sarcoma virus polymerase

John Taylor et al.Sep 1, 1976
J
R
J
The DNAase digestion end-product of calf thymus DNA contains oligonucleotides that will function as primers for the efficient transcription into DNA of many naturally-occurring RNA's by purified avian sarcoma virus RNA-directed DNA polymerase. The labeled DNA transcripts so obtained are valuable as probes for molecular hybridization studies. Typical applications of the method include the efficient transcription into DNA of 18 and 28 S rRNA as well as the RNA's of avian sarcoma virus, polio virus, influenza virus, satellite tobacco necrosis virus and tobacco mosaic virus. In addition, when these primers are added to avian sarcoma virus particles that have been partially-disrupted with non-ionic detergent there is a 6-fold stimulation of the endogenous RNA-directed DNA synthesis.
0
Citation687
0
Save
0

Apolipoprotein E mRNA is abundant in the brain and adrenals, as well as in the liver, and is present in other peripheral tissues of rats and marmosets.

Nabil Elshourbagy et al.Jan 1, 1985
J
R
W
N
The relative amount of apolipoprotein (apo-) E mRNA in 12 different tissues of the rat and marmoset was examined by dot blot hybridization using cloned cDNA probes. As expected, it was found to be most abundant in the liver. However, substantial amounts of apo-E mRNA were found in the brain and adrenals at relative levels about one-third of that found in the liver. Significant quantities of apo-E mRNA were detected in all of the other peripheral tissues as well. The apo-E mRNA levels in these tissues were 2-10% of that found in the liver of the rat and 10-30% of that found in the liver of the marmoset. Apo-E mRNA was also abundant in human brain and in each species examined; it was distributed throughout all major areas of this organ. In contrast, apo-A-I mRNA was detected in abundant amounts only in the small intestine and in the liver. Extrahepatic apo-E mRNA appears to be functional, generating a translation product similar or identical to that generated by the liver. During fetal and neonatal development, apo-E mRNA is rapidly induced from low levels to approximately equal to 60% of adult levels in liver at parturition. The fetal yolk sac contains more apo-E mRNA than the fetal liver, suggesting a significant role for the yolk sac as a source of apo-E during gestation.
0
Citation500
0
Save
0

Initiation of replication of the human hepatitis delta virus genome from cloned DNA: role of delta antigen

Mark Kuo et al.May 1, 1989
J
M
M
Beginning with three partial cDNA clones of the RNA genome of human hepatitis delta virus (HDV), we assembled the complete 1,679-base sequence on a single molecule and then inserted a trimer of this into plasmid pSLV, a simian virus 40-based eucaryotic expression vector. This construct was used to transfect both monkey kidney (COS7) and human hepatocellular carcinoma (HuH7) cell lines. In this way we obtained replication of the HDV RNA genome and the appearance, in the nucleoli, of the delta antigen, the only known virus-coded protein. This proved both that the HDV genome could replicate in nonliver as well as liver cells and that there was no requirement for the presence of hepatitis B virus sequences or proteins. When the pSVL construct was made with a dimer of an HDV sequence with a 2-base-pair deletion in the open reading frame, genome replication was reduced at least 40-fold. However, when we cotransfected with a plasmid that expressed the correct delta antigen, the mutated dimer achieved a level of genome replication comparable to that of the nonmutated sequence. We thus conclude that the delta antigen can act in trans and is essential for replication of the HDV genome.
0
Citation450
0
Save
0

Antigenomic RNA of human hepatitis delta virus can undergo self-cleavage

L Sharmeen et al.Aug 1, 1988
J
G
M
L
The structure and replication of the single-stranded circular RNA genome of hepatitis delta virus (HDV) are unique relative to those of known animal viruses, and yet there are real similarities between HDV and certain infectious RNAs of plants. Therefore, since some of the latter RNAs have been shown to undergo in vitro site-specific cleavage and even ligation, we tested the hypothesis that similar events might also occur for HDV RNA. In partial confirmation of this hypothesis, we found that in vitro the RNA complementary to the HDV genome, the antigenomic RNA, could undergo a self-cleavage that was not only more than 90% efficient but also occurred only at a single location. This cleavage was found to produce junction fragments consistent with a 5'-hydroxyl and a cyclic 2',3'-monophosphate. Since the observed cleavage was both site-specific and occurred only once per genome length, we propose that the site may be relevant to the normal intracellular replication of the HDV genome. Because the site is located almost adjacent to the 3' end of the delta antigen-coding region, the only known functional open reading frame of HDV, we suggest that the cleavage may have a role not only in genome replication but also in RNA processing, helping to produce a functional mRNA for the translation of delta antigen.
0
Citation386
0
Save
0

Structure and replication of the genome of the hepatitis delta virus.

Pei‐Jer Chen et al.Nov 1, 1986
+4
J
G
P
The hepatitis delta virus can be found in the serum and liver of some hepatitis B virus patients. We now report that the RNA genome of serum-derived delta virus is single-stranded and circular. Livers of infected chimpanzees or woodchucks contained as many as 300,000 copies of genomic strand RNA per average cell, and at least some of this RNA had a circular conformation. Also present in the livers were RNA species complementary to the virion RNA. The genomic RNA was 5-22 times more abundant than this antigenomic strand. Some of the antigenomic RNA was complexed with genomic RNA, as evidenced by the fact that at least 34% of the antigenomic RNA was resistant to digestion with either RNase A in 0.3 M NaCl or S1 nuclease. Some of the antigenomic RNA was in a circular conformation. These and other findings showed that the structure and replication of hepatitis delta virus are in many ways similar to those of the previously described plant viroids, virusoids, and satellite RNAs.
0
Citation336
0
Save
1

Neuropathy target esterase activity predicts retinopathy amongPNPLA6disorders

James Liu et al.Jun 11, 2023
+42
M
C
J
Abstract Biallelic pathogenic variants in the PNPLA6 gene cause a broad spectrum of disorders leading to gait disturbance, visual impairment, anterior hypopituitarism, and hair anomalies. PNPLA6 encodes Neuropathy target esterase (NTE), yet the role of NTE dysfunction on affected tissues in the large spectrum of associated disease remains unclear. We present a clinical meta-analysis of a novel cohort of 23 new patients along with 95 reported individuals with PNPLA6 variants that implicate missense variants as a driver of disease pathogenesis. Measuring esterase activity of 46 disease-associated and 20 common variants observed across PNPLA6 -associated clinical diagnoses unambiguously reclassified 10 variants as likely pathogenic and 36 variants as pathogenic, establishing a robust functional assay for classifying PNPLA6 variants of unknown significance. Estimating the overall NTE activity of affected individuals revealed a striking inverse relationship between NTE activity and the presence of retinopathy and endocrinopathy. This phenomenon was recaptured in vivo in an allelic mouse series, where a similar NTE threshold for retinopathy exists. Thus, PNPLA6 disorders, previously considered allelic, are a continuous spectrum of pleiotropic phenotypes defined by an NTE genotype:activity:phenotype relationship. This relationship and the generation of a preclinical animal model pave the way for therapeutic trials, using NTE as a biomarker.
0

Adopting Optimal Statistical Practices: Applied Researchers

John TaylorJul 1, 2024
J
In keeping with this year's focus on how we might foster a culture of research that values and consistently adopts optimal statistical practices, this column entry highlights practices our applied researchers can take up that may help remedy the gap between recommended statistical practices and implementation. This installment specifically encourages increasing the transparency of analyses, teaming up with colleagues with quantitative expertise, and disseminating resources that highlight optimal practices. [ J Nurs Educ . 2024;63(7):490–491.]
0

Chronic Mcm10 deficiency causes defects in telomere maintenance in human cells

Ryan Baxley et al.Nov 16, 2019
+23
C
J
R
Minichromosome maintenance protein 10 (Mcm10) is essential for eukaryotic DNA replication initiation and fork stability. Recently, a compound heterozygous MCM10 mutation was identified in a patient who presented with natural killer (NK) cell deficiency. To understand the mechanism of disease, we modeled this mutation in human cell lines. We demonstrate that Mcm10 deficiency causes chronic replication stress that reduces cell viability due to increased genomic instability and telomere maintenance defects. Our data suggests that Mcm10 deficiency constrains telomerase-dependent telomere extension. This limitation can be overcome by increasing telomerase activity, although defects in telomere replication persist. We propose that stalled replication forks in Mcm10-deficient cells arrest terminally, especially within hard-to-replicate regions, and require nuclease processing involving Mus81, as MCM10:MUS81 double mutants displayed decreased viability and accelerated telomere erosion. Our results reveal that Mcm10 is critical for telomere replication and provide insights into how MCM10 mutations cause NK cell deficiency.