EM
Evelien Mylle
Author with expertise in Molecular Mechanisms of Pollen Development and Function
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
11
(55% Open Access)
Cited by:
4
h-index:
16
/
i10-index:
17
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Chromatin attachment to the nuclear matrix represses hypocotyl elongation inArabidopsis thaliana

Linhao Xu et al.Jul 5, 2023
Abstract The nuclear matrix is a nuclear compartment that has diverse functions in chromatin regulation and transcription. However, how this structure influences epigenetic modifications and gene expression in plants is largely unknown. In this study, we showed that a nuclear matrix binding protein, AHL22, together with the two transcriptional repressors FRS7 and FRS12, regulates hypocotyl elongation by suppressing the expression of a group of genes known as SMALL AUXIN UP RNAs ( SAURs ) in Arabidopsis thaliana . The transcriptional repression of SAURs depends on their attachment to the nuclear matrix. The AHL22 complex not only brings these SAURs, which contained matrix attachment regions (MARs), to the nuclear matrix, but it also recruits the histone deacetylase HDA15 to the SAUR loci. This leads to the removal of H3 acetylation at the SAUR loci and the suppression of hypocotyl elongation. Taken together, our results indicate that MAR-binding proteins act as a hub for chromatin and epigenetic regulators. Moreover, we present a novel mechanism by which nuclear matrix attachment to chromatin regulates histone modifications, transcription, and hypocotyl elongation.
1
Citation1
0
Save
1

Mapping the adaptor protein complex interaction network in Arabidopsis identifies P34 as a common stability regulator

Peng Wang et al.Sep 1, 2022
Abstract Adaptor protein (AP) complexes are evolutionarily conserved vesicle transport regulators that recruit coat proteins, membrane cargos and coated vesicle accessory proteins. Since in plants endocytic and post-Golgi trafficking intersect at the trans -Golgi network, unique mechanisms for sorting cargos of overlapping vesicular routes are anticipated. The plant AP complexes are part of the sorting machinery, but despite some functional information, their cargoes, accessory proteins, and regulation remain largely unknown. Here, by means of various proteomics approaches, we generated the overall interactome of the five AP and the TPLATE complexes in Arabidopsis thaliana . The interactome converged on a number of hub proteins, including the thus far unknown adaptin binding-like protein, designated P34. P34 interacted with the clathrin-associated AP complexes, controlled their stability and, subsequently, influenced clathrin-mediated endocytosis and various post-Golgi trafficking routes. Altogether, the AP interactome network offers substantial resources for further discoveries of unknown endomembrane trafficking regulators in plant cells.
1
Citation1
0
Save
0

Nanobody-dependent delocalization of endocytic machinery in Arabidopsis root cells dampens their internalization capacity

Joanna Winkler et al.Feb 28, 2020
Plant cells perceive and adapt to an ever-changing environment by modifying their plasma membrane (PM) proteome. Whereas secretion deposits new integral membrane proteins, internalization by endocytosis removes membrane proteins and associated ligands, largely with the aid of adaptor protein complexes and the scaffolding molecule clathrin. Two adaptor protein complexes function in clathrin-mediated endocytosis at the PM in plant cells, the heterotetrameric Adaptor Protein 2 (AP-2) complex and the octameric TPLATE complex (TPC). Whereas single subunit mutants in AP-2 develop into viable plants, genetic mutation of a single TPC subunit causes fully penetrant male sterility and silencing single subunits leads to seedling lethality. To address TPC function in somatic root cells, while minimizing indirect effects on plant growth, we employed nanobody-dependent delocalization of a functional, GFP-tagged TPC subunit, TML, in its respective homozygous genetic mutant background. In order to decrease the amount of functional TPC at the PM, we targeted our nanobody construct to the mitochondria and fused it to TagBFP2 to visualize it independently of its bait. We furthermore limited the effect of our delocalization to those tissues that are easily accessible for live-cell imaging by expressing it from the PIN2 promotor, which is active in root epidermal and cortex cells. With this approach, we successfully delocalized TML from the PM. Moreover, we also show co-recruitment of TML-GFP and AP2A1-TagRFP to the mitochondria, suggesting that our approach delocalized complexes, rather than individual adaptor complex subunits. In line with the specific expression domain, we only observed minor effects on root growth and gravitropic response, yet realized a clear reduction of endocytic flux in epidermal root cells. Nanobody-dependent delocalization in plants, here exemplified using a TPC subunit, has the potential to be widely applicable to achieve specific loss-of-function analysis of otherwise lethal mutants.
0

Burning glass effect of water droplets triggers an ER-derived calcium response in the chloroplast stroma of Arabidopsis thaliana leaves

Dongsheng Kuang et al.Sep 12, 2024
Plants require water and light for photosynthesis, but light, when focused by water droplets on leaves, can create high light intensity spots that are harmful to plants. As excessive light intensity can reduce growth or even induce cell death, it is vital for plants to detect and react to changes in light exposure and acclimate to high light stress. Ca2+ signaling was previously implicated in high light acclimation. However, the dynamics of free Ca2+ concentration in the chloroplast, the primary site of photosynthesis, or in the nucleus and in the cytoplasm, where transcription and translation for long term acclimation occurs, remain unknown. Here we studied the dynamics and mechanism of the Ca2+ response to high light exposure. Focusing light through a glass bead to mimic water droplets triggered an increase of the free Ca2+ concentration in the chloroplast stroma of Arabidopsis thaliana. This finding was corroborated using established and newly developed genetically encoded calcium indicators, which revealed a biphasic increase in the stromal free Ca2+ concentration when exposed to varying intensities and qualities of light. Among photosynthetic by products, reactive oxygen and lipophilic species in particular, have been implicated in high light stress acclimation. A H2O2 signature was induced, albeit with different dynamics than the Ca2+ response, while chemical inhibition of the photosynthetic electron transport points towards singlet oxygen as a potential culprit of the high light-induced increase in stromal free Ca2+ concentration. The observed dynamics differed from those of a heat shock induced Ca2+ signature, although temperature had a positive effect on the Ca2+ response. Based on Ca2+ inhibitor treatments and the free Ca2+ concentration dynamics, we suggest that the high light induced stromal Ca2+ is derived from the endoplasmic reticulum rather than from the cytoplasm. In conclusion, inspired by the burning glass effect of water droplets on leaves, we uncovered a Ca2+ response that implicates a novel mechanism for plants to acclimate to high light stress, a process that will become increasingly relevant in a changing climate.
1

TPLATE complex dependent endocytosis is required for shoot apical meristem maintenance by attenuating CLAVATA1 signaling

Jie Wang et al.Oct 18, 2022
Abstract Endocytosis regulates the turnover of cell surface localized receptors, which are crucial for plants to sense and rapidly respond to both endogenous and environmental stimuli. The evolutionarily ancient TPLATE complex (TPC) plays an essential role in clathrin-mediated endocytosis (CME) in Arabidopsis plants. Knockout or strong knockdown of single TPC subunits causes male sterility and seedling lethality phenotypes, complicating analysis of the roles of TPC during plant development. Partially functional alleles of TPC subunits however only cause very mild developmental deviations. Here, we took advantage of the recently reported partially functional TPLATE allele, WDXM2, to investigate a role for TPC-dependent endocytosis in receptor-mediated signalling. We discovered that reduced TPC-dependent endocytosis confers a hypersensitivity to very low doses of CLAVATA3 (CLV3) peptide signalling. This hypersensitivity correlated with the abundance of the CLV3 receptor protein kinase CLAVATA1 (CLV1) at the plasma membrane. Genetic analysis and live-cell imaging revealed that TPC-dependent regulation of CLV3-dependent internalization of CLV1 from the plasma membrane is required for CLV3 function in the shoot. Our findings provide evidence that clathrin-mediated endocytosis of CLV1 is a mechanism to dampen CLV3-mediated signaling during plant development.
0

Rapamycin-dependent delocalization as a novel tool to reveal protein-protein interactions in plants

Joanna Winkler et al.Mar 10, 2020
Identifying protein-protein interactions (PPI) is crucial to understand any type of biological process. Many PPI tools are available, yet only some function within the context of a plant cell. Narrowing down even further, only few PPI tools allow visualizing higher order interactions. Here, we present a novel and conditional in vivo PPI tool for plant research. Knocksideways in plants (KSP) uses the ability of rapamycin to alter the localization of a bait protein and its interactors via the heterodimerization of FKBP and FRB domains. KSP is inherently free from many limitations, which other PPI systems hold. It is an in vivo tool, it is flexible concerning the orientation of protein tagging as long as this does not interfere with the interaction and it is compatible with a broad range of fluorophores. KSP is also a conditional tool and therefore does not require additional controls. The interactions can be quantified and in high throughput by the scripts that we provide. Finally, we demonstrate that KSP can visualize higher-order interactions. It is therefore a versatile tool, complementing the PPI methods field with unique characteristics and applications.
Load More