Abstract The molecular alterations underlying the pathogenesis of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL) and peripheral T-cell lymphoma, unspecified (PTCL-u) are largely unknown. In order to characterize the ontogeny and molecular differences between both entities, a series of AITLs (n = 18) and PTCLs-u (n = 16) was analyzed using gene expression profiling. Unsupervised clustering correlated with the pathological classification and with CD30 expression in PTCL-u. The molecular profile of AITLs was characterized by a strong microenvironment imprint (overexpression of B-cell– and follicular dendritic cell–related genes, chemokines, and genes related to extracellular matrix and vascular biology), and overexpression of several genes characteristic of normal follicular helper T (TFH) cells (CXCL13, BCL6, PDCD1, CD40L, NFATC1). By gene set enrichment analysis, the AITL molecular signature was significantly enriched in published TFH-specific genes. The enrichment was higher for sorted AITL cells than for tissue samples. Overexpression of several TFH genes was validated by immunohistochemistry in AITLs. A few cases with molecular TFH-like features were identified among CD30− PTCLs-u. Our findings strongly support that TFH cells represent the normal counterpart of AITL, and suggest that the AITL spectrum may be wider than suspected, as a subset of CD30− PTCLs-u may derive from or be related to AITL.

Abstract The t(2; 5)(p23;q35) translocation, associated with anaplastic large-cell lymphoma (ALCL), results in the production of the nucleolar protein nucleophosmin-anaplastic lymphoma kinase (NPM-ALK) protein. This report describes an immunocytochemical study of the distribution of ALK and NPM-ALK proteins using a new monoclonal antibody, ALK1, that recognizes a formalin resistant epitope in both the 80-kD NPM-ALK chimeric and the 200-kD normal human ALK proteins. Cytoplasmic and nuclear labeling was seen in the t(2; 5)+ SU-DHL-1 and Karpas 299 cell lines. Normal ALK protein expression was restricted to the central nervous system (in scattered neurons, glial cells, and endothelial cells). Two hundred and thirty-nine cases of lymphoma and 80 nonhematopoietic tumors were immunostained. Antibody ALK1 labeled 53.4% (39 of 73 cases) of CD30+ ALCL. A case of ALCL with a t(1; 2) translocation was ALK1+. Three cases of CD30− ALCL with prominent nucleoli showed a unique pattern of coarse granular cytoplasmic labeling. All other tumors, including Hodgkin's disease and lymphomatoid papulosis, were ALK1−. These results indicate that reliable immunostaining of routine biopsy material for NPM-ALK and ALK proteins is feasible. Such analysis is of diagnostic importance, especially because t(2; 5)+ ALCL cases have a good prognosis with appropriate treatment.

Abstract The t(2;5)(p23;q35) translocation, associated with anaplastic large-cell lymphoma (ALCL), results in the expression of a chimeric NPM-ALK protein that can be detected by the ALK1 monoclonal antibody. This report describes the morphologic and phenotypic spectrum of 123 cases of lymphoma that all express ALK protein. The results provide strong evidence that the morphologic patterns of ALCL described in previous reports as representing possible subtypes of ALCL, eg, common type, lymphohistiocytic, or small cell patterns, are morphologic variants of the same disease entity. All of these morphologic patterns could be found within this series, and in some patients different subtypes coexisted in a single biopsy or were found in successive biopsies from a single patient. The link between these morphologic subtypes is further reinforced by the presence in all cases of a highly characteristic large cell, with an eccentric nucleus and an eosinophilic paranuclear region. We suggest that this cell can be considered as a major distinguishing feature of ALK-positive lymphomas. Another characteristic of these tumors was the perivascular pattern of neoplastic cell infiltration seen in a significant number of cases. In addition to ALK protein, all tumors expressed epithelial membrane antigen and lacked CD15, features that may be of value in differentiating ALCL from Hodgkin's disease. In the majority of cases (84%), malignant cells showed both a cytoplasmic and nuclear staining for ALK1 and thus presumably carried the 2;5 translocation, but staining was restricted to the cytoplasm in a few cases, suggesting that translocations other than t(2;5) may induce expression of ALK protein. We conclude from this study that ALK-positive neoplasms represent a distinct entity. Because their morphology is often neither anaplastic nor large cell, we suggest that they should henceforward be referred to as ALK lymphomas.

Inactivating mutations of the Ten-Eleven Translocation 2 (TET2) gene were first identified in myeloid malignancies and more recently in peripheral T-cell lymphomas (PTCLs). In the present study, we investigated the presence of TET2 coding sequence mutations and their clinical relevance in a large cohort of 190 PTCL patients. TET2 mutations were identified in 40 of 86 (47%) cases of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL) and in 22 of 58 (38%) cases of peripheral T-cell lymphoma, not otherwise specified (PTCL-NOS), but were absent in all other PTCL entities, with the exception of 2 of 10 cases of enteropathy-associated T-cell lymphoma. Among PTCL-NOS, a heterogeneous group of lymphoma-comprising cases likely to derive from Th follicular (T(FH)) cells similarly to AITL, TET2 mutations were more frequent when PTCL-NOS expressed T(FH) markers and/or had features reminiscent of AITL (58% vs 24%, P = .01). In the AITL and PTCL-NOS subgroups, TET2 mutations were associated with advanced-stage disease, thrombocytopenia, high International Prognostic Index scores, and a shorter progression-free survival.

ALK-negative anaplastic large cell lymphoma associated with breast implant (i-ALCL) has been recently recognized as a distinct entity. Among 43 830 lymphomas registered in the French Lymphopath network since 2010, 300 breast lymphomas comprising 25 peripheral T-cell lymphomas (PTCL) were reviewed. Among PTCL, ALK-negative ALCL was the most frequent and all of them were associated with breast implants.Since 2010, all i-ALCL cases were collected from different institutions through Lymphopath. Immuno-morphologic features, molecular data and clinical outcome of 19 i-ALCLs have been retrospectively analyzed.The median age of the patients was 61 years and the median length between breast implant and i-ALCL was 9 years. Most implants were silicone-filled and textured. Implant removal was performed in 17 out of 19 patients with additional treatment based on mostly CHOP or CHOP-like chemotherapy regimens (n = 10/19) or irradiation (n = 1/19). CHOP alone or ABVD following radiation without implant removal have been given in two patients. The two clinical presentations, i.e. effusion and less frequently tumor mass correlated with distinct histopathologic features: in situ i-ALCL (anaplastic cell proliferation confined to the fibrous capsule) and infiltrative i-ALCL (pleomorphic cells massively infiltrating adjacent tissue with eosinophils and sometimes Reed-Sternberg-like cells mimicking Hodgkin lymphoma). Malignant cells were CD30-positive, showed a variable staining for EMA and were ALK negative. Most cases had a cytotoxic T-cell immunophenotype with variable T-cell antigen loss and pSTAT3 nuclear expression. T-cell receptor genes were clonally rearranged in 13 out of 13 tested cases. After 18 months of median follow-up, the 2-year overall survival for in situ and infiltrative i-ALCL was 100% and 52.5%, respectively.In situ i-ALCLs have an indolent clinical course and generally remain free of disease after implant removal. However, infiltrative i-ALCLs could have a more aggressive clinical course that might require additional therapy to implant removal.

Abstract Routine clinical assays, such as conventional immunohistochemistry, often fail to resolve the regional heterogeneity of complex inflammatory skin conditions. Here we introduce MANTIS (Multiplexed Annotated Tissue Imaging System), a flexible analytic pipeline compatible with routine practice, specifically-designed for spatially-resolved immune phenotyping of the skin in experimental or clinical samples. Based on phenotype attribution matrices coupled to α-shape algorithms, MANTIS projects a representative digital immune landscape, while enabling automated detection of major inflammatory clusters and concomitant single-cell data quantification of biomarkers. We observed that severe pathological lesions from systemic lupus erythematosus, Kawasaki syndrome or COVID-19-associated skin manifestations share common quantitative immune features, while displaying a non-random distribution of cells with the formation of disease-specific dermal immune structures. Given its accuracy and flexibility, MANTIS is designed to solve the spatial organization of complex immune environments to better apprehend the pathophysiology of skin manifestations.

Among 15 patients with relapsed ALCL after the failure of brentuximab vedotin therapy, the ALK inhibitor brigatinib led to a complete response in 73%, and progression-free survival at 2 years was 73%.

ABSTRACT Aberrant DNA methylation is a well-known feature of tumours and has been associated with metastatic melanoma. However, since melanoma cells are highly heterogeneous, it has been challenging to use affected genes to predict tumour aggressiveness, metastatic evolution, and patients’ outcomes. We hypothesized that common aggressive hypermethylation signatures should emerge early in tumorigenesis and should be shared in aggressive cells, independent of the physiological context under which this trait arises. We compared paired melanoma cell lines with the following properties: (i) each pair comprises one aggressive counterpart and its parental cell line, and (ii) the aggressive cell lines were each obtained from different host and their environment (human, rat, and mouse), though starting from the same parent cell line. Next, we developed a multi-step genomic pipeline that combines the DNA methylome profile with a chromosome cluster-oriented analysis. A total of 229 differentially hypermethylated genes were commonly found in the aggressive cell lines. Genome localization analysis revealed hypermethylation peaks and clusters, identifying eight hypermethylated gene promoters for validation in tissues from melanoma patients. Five CpG identified in primary melanoma tissues were transformed into a DNA methylation score that can predict survival (Log-rank test, p =0.0008). This strategy is potentially universally applicable to other diseases involving DNA methylation alterations.

Aims Primary cutaneous marginal zone lymphoma (PCMZL) is considered a lymphoproliferative disorder (International Consensus Classification, ICC) or an overt lymphoma (WHO‐HAEM5). Seeking evidence for a reactive process or true lymphoma, we retrieved recurrent PCMZLs from the French Study Group of Cutaneous Lymphoma (GFELC) database. Methods Histology, phenotype (light‐chain restriction, immunoglobulin, and immune‐receptor translocation‐associated protein‐1 [IRTA1] expression) and B‐cell clonality at diagnosis and recurrence were compared according to recurrence site (local, locoregional, or distant) and outcomes. Results Initial lesions of the 61 patients (mean age 52) were mostly isolated on the trunk (48%) and classified T1 (70%). Times to first recurrence for local, locoregional, and distant recurrences, were 20, 29, and 37 months, respectively. Light‐chain restriction type did not differ significantly between local/locoregional recurrences and distal recurrences ( P = 0.06; n = 60). The same B‐cell clones were identified for 23/42 local/locoregional recurrences, while 5/19 distant recurrences showed different clonal profiles ( P = 0.0003). No tumour expressed IRTA1. Fifty‐eight tumours were heavy‐chain (IgG/IgG4) class‐switched PCMZLs and 3 IgM+/IgD– PCMZLs. All IgM+ tumours underwent either transformation (skin or brain) into diffuse large B‐cell lymphomas (DLBCLs) and extracutaneous spreading. Conclusion As suggested by WHO‐HAEM5, immunoglobulin phenotype assessment (IgM alongside IgD) appears to be a possible valuable tool in the initial diagnosis of PCMZL to differentiate between the indolent class‐switched PCMZL (IgM‐negative) and IgM+ (IgD–) PCMZL, which has an uncertain prognosis. The variation in B‐cell rearrangements and light chain restriction observed in distant recurrences of PCMZL may suggest different antigen‐driven stimulation processes.