YX
Ye Xu
Author with expertise in Molecular Characterization of Colorectal Cancer
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
11
(55% Open Access)
Cited by:
1,426
h-index:
43
/
i10-index:
109
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Tumor-derived exosomal miR-934 induces macrophage M2 polarization to promote liver metastasis of colorectal cancer

Senlin Zhao et al.Nov 19, 2020
Mounting evidence has demonstrated the vital importance of tumor-associated macrophages (TAMs) and exosomes in the formation of the premetastatic niche. However, the molecular mechanisms by which tumor-derived exosomal miRNAs interact with TAMs underlying premetastatic niche formation and colorectal cancer liver metastasis (CRLM) remain largely unknown.Transmission electron microscopy and differential ultracentrifugation were used to verify the existence of exosomes. In vivo and in vitro assays were used to identify roles of exosomal miR-934. RNA pull-down assay, dual-luciferase reporter assay, etc. were applied to clarify the mechanism of exosomal miR-934 regulated the crosstalk between CRC cells and M2 macrophages.In the present study, we first demonstrated the aberrant overexpression of miR-934 in colorectal cancer (CRC), especially in CRLM, and its correlation with the poor prognosis of CRC patients. Then, we verified that CRC cell-derived exosomal miR-934 induced M2 macrophage polarization by downregulating PTEN expression and activating the PI3K/AKT signaling pathway. Moreover, we revealed that hnRNPA2B1 mediated miR-934 packaging into exosomes of CRC cells and then transferred exosomal miR-934 into macrophages. Interestingly, polarized M2 macrophages could induce premetastatic niche formation and promote CRLM by secreting CXCL13, which activated a CXCL13/CXCR5/NFκB/p65/miR-934 positive feedback loop in CRC cells.These findings indicate that tumor-derived exosomal miR-934 can promote CRLM by regulating the crosstalk between CRC cells and TAMs. These findings reveal a tumor and TAM interaction in the metastatic microenvironment mediated by tumor-derived exosomes that affects CRLM. The present study also provides a theoretical basis for secondary liver cancer.
0

Serum Metabolite Profiling of Human Colorectal Cancer Using GC−TOFMS and UPLC−QTOFMS

Yunping Qiu et al.Aug 13, 2009
Colorectal carcinogenesis involves the overexpression of many immediate-early response genes associated with growth and inflammation, which significantly alters downstream protein synthesis and small-molecule metabolite production. We have performed a serum metabolic analysis to test the hypothesis that the distinct metabolite profiles of malignant tumors are reflected in biofluids. In this study, we have analyzed the serum metabolites from 64 colorectal cancer (CRC) patients and 65 healthy controls using gas chromatography time-of-flight mass spectrometry (GC−TOFMS) and Acquity ultraperformance liquid chromatography-quadrupole time-of-flight mass spectrometry (Acquity UPLC−QTOFMS). Orthogonal partial least-squares discriminate analysis (OPLS-DA) models generated from GC−TOFMS and UPLC−QTOFMS metabolic profile data showed robust discrimination from CRC patients and healthy controls. A total of 33 differential metabolites were identified using these two analytical platforms, five of which were detected in both instruments. These metabolites potentially reveal perturbation of glycolysis, arginine and proline metabolism, fatty acid metabolism and oleamide metabolism, associated with CRC morbidity. These results suggest that serum metabolic profiling has great potential in detecting CRC and helping to understand its underlying mechanisms.
0

Emerging views of mitophagy in immunity and autoimmune diseases

Ye Xu et al.Apr 5, 2019
Mitophagy is a vital form of autophagy for selective removal of dysfunctional or redundant mitochondria. Accumulating evidence implicates elimination of dysfunctional mitochondria as a powerful means employed by autophagy to keep the immune system in check. The process of mitophagy may restrict inflammatory cytokine secretion and directly regulate mitochondrial antigen presentation and immune cell homeostasis. In this review, we describe distinctive pathways of mammalian mitophagy and highlight recent advances relevant to its function in immunity. In addition, we further discuss the direct and indirect evidence linking mitophagy to inflammation and autoimmunity underlying the pathogenesis of autoimmune diseases including inflammatory bowel diseases (IBD), systemic lupus erythematosus (SLE) and primary biliary cirrhosis (PBC).Abbreviations: AICD: activation induced cell death; AIM2: absent in melanoma 2; ALPL/HOPS: alkaline phosphatase, biomineralization associated; AMA: anti-mitochondrial antibodies; AMFR: autocrine motility factor receptor; ATG: autophagy-related; BCL2L13: BCL2 like 13; BNIP3: BCL2 interacting protein 3; BNIP3L/NIX: BCL2 interacting protein 3 like; CALCOCO2/NDP52: calcium binding and coiled-coil domain 2; CARD: caspase recruitment domain containing; CASP1: caspase 1; CD: Crohn disease; CGAS: cyclic GMP-AMP synthase; CXCL1: C-X-C motif chemokine ligand 1; DEN: diethylnitrosamine; DLAT/PDC-E2: dihydrolipoamide S-acetyltransferase; DNM1L/Drp1: dynamin 1 like; ESCRT: endosomal sorting complexes required for transport; FKBP8: FKBP prolyl isomerase 8; FUNDC1: Fun14 domain containing 1; GABARAP: GABA type A receptor-associated protein; HMGB1: high mobility group box 1; HPIV3: human parainfluenza virus type 3; IBD: inflammatory bowel diseases; IEC: intestinal epithelial cell; IFN: interferon; IL1B/IL-1β: interleukin 1 beta; iNK: invariant natural killer; IRGM: immunity related GTPase M; LIR: LC3-interacting region; LPS: lipopolysaccharide; LRRK2: leucine rich repeat kinase 2; MAP1LC3/LC3: microtubule associated protein 1 light chain 3; MARCH5: membrane associated ring-CH-type finger 5; MAVS: mitochondrial antiviral signaling protein; MDV: mitochondria-derived vesicle; MFN1: mitofusin 1; MHC: major histocompatibility complex; MIF: macrophage migration inhibitory factor; mtAP: mitochondrial antigen presentation; mtDNA: mitochondrial DNA; MTOR: mechanistic target of rapamycin kinase; mtROS: mitochondrial ROS; MUL1: mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1; NBR1: NBR1 autophagy cargo receptor; NFKB/NF-ĸB: nuclear factor kappa B subunit; NK: natural killer; NLR: NOD-like receptor; NLRC4: NLR family CARD domain containing 4; NLRP3: NLR family pyrin domain containing 3; OGDH: oxoglutarate dehydrogenase; OMM: outer mitochondrial membrane; OPTN: optineurin; ox: oxidized; PARK7: Parkinsonism associated deglycase; PBC: primary biliary cirrhosis; PEX13: peroxisomal biogenesis factor 13; PHB/PHB1: prohibitin; PHB2: prohibitin 2; PIK3C3/VPS34: phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3; PINK1: PTEN induced kinase 1; PLEKHM1: pleckstrin homology and RUN domain containing M1; PRKN/PARK2: parkin RBR E3 ubiquitin protein ligase; RAB: member RAS oncogene family; RHEB: Ras homolog: mTORC1 binding; RIPK2: receptor interacting serine/threonine kinase 2; RLR: DDX58/RIG-I like receptor; ROS: reactive oxygen species; SBD: small bile ducts; SLC2A1/GLUT1: solute carrier family 2 member 1; SLE: systemic lupus erythematosus; SMURF1: SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1; SQSTM1/p62: sequestosome 1; TAX1BP1: Tax1 binding protein 1; TCR: T cell receptor; TFAM: transcription factor A: mitochondrial; Th17: T helper 17; TLR9: toll like receptor 9; TMEM173/STING: transmembrane protein 173; TNF/TNF-α: tumor necrosis factor; Ub: ubiquitin; UC: ulcerative colitis; ULK1: unc-51 like autophagy activating kinase 1; WIPI: WD repeat domain: phosphoinositide interacting; ZFYVE1/DFCP1: zinc finger FYVE-type containing 1.
0

Prognostic impact of programed cell death-1 (PD-1) and PD-ligand 1 (PD-L1) expression in cancer cells and tumor infiltrating lymphocytes in colorectal cancer

Yaqi Li et al.Aug 24, 2016
Colorectal cancer (CRC) is 3rd most commonly diagnosed cancer in males and the second in females. PD-1/PD-L1 axis, as an immune checkpoint, is up-regulated in many tumors and their microenvironment. However, the prognostic value of PD-1/PD-L1 in CRC remains unclear.The Cancer Genome Atlas (TCGA) database (N = 356) and Fudan University Shanghai Cancer Center (FUSCC) cohort of patients (N = 276) were adopted to analyze the prognostic value of PD-L1 in colorectal tumor cells (TCs) and of PD-1 in tumor infiltrating cells (TILs) for CRC. Subgroup analyses were conducted in FUSCC cohort according to patients' status of mismatch repair.In TCGA cohort, the cut-off values of PD-1 and PD-L1 expression were determined by X-tile program, which were 4.40 and 2.92, respectively. Kaplan-Meier analysis indicated that higher PD-1 and PD-L1 expressions correlated with better OS (P = 0.032 and P = 0.002, respectively). In FUSCC cohort, expressions of PD-1 on TILs and PD-L1 on TCs were analyzed separately by immunohistochemistry (IHC) staining based on a TMA sample (N = 276) and revealed that both TILs-PD-1 and TCs-PD-L1 were associated with OS (P = 0.006 and P = 0.002, respectively) and DFS (P = 0.025 and P = 0.004, respectively) of CRC patients. Multivariate Cox regression analysis indicated TILs-PD-1 was an independent prognostic factor both for OS and DFS of CRC patients (P < 0.05). Subgroup analyses showed that TILs-PD-1 was an independent prognostic factor for both OS and DFS in CRC patients in MSS-proficient subgroup (P < 0.05), while neither of them correlated with OS or DFS in MSS-deficient subgroup (P > 0.05).Higher expressions of PD-1 and PD-L1 correlates with better prognosis of CRC patients. TILs-PD-1 is an independent prognostic factor for OS and DFS of CRC patients, especially for MMR-proficient subgroup.
1

Long-read Transcriptome Landscapes of Primary and Metastatic Liver Cancers at Transcript Resolution

Zhiao Chen et al.Jul 12, 2023
Abstract Background The liver is the sixth most common site of primary cancer in humans and is frequently colonized by metastases from cancers of other organs. Few studies have investigated the transcriptomic profiles of matched primary tumor and hepatic metastases of patients. Moreover, the read length of 100-200 bases in conventional short-read RNA sequencing is too short, which makes it difficult to directly infer the full-length transcript structure. To help develop effective treatments and improve survival, it is crucial to understand the complex and diverse molecular mechanisms of primary and metastatic liver cancers. Methods Ninety-five primary and secondary liver cancer patients who underwent hepatic resection were included with long-read sequencing isoform-sequencing and short-read RNA sequencing. We compared the transcriptome landscapes of primary and metastatic liver cancers and systematically investigated HCC, paired primary tumors and liver metastases, and matched non-tumor liver tissues. Results We defined the full-length isoform-level transcriptome of human primary and metastatic liver cancers and identified isoform-level diversity in HCC and metastasis-associated transcriptome variations in metastatic liver cancers. Specific RNA transcripts and isoform switching events with clinical implications were profoundly discovered in liver cancer. Metastasis-specific transcripts that can predict the metastatic risk and identify the primary sites of cancers of unknown primary liver metastasis patients were defined. Additionally, we found that adjacent paracancerous liver tissues are abnormal and characterized the premetastatic immunological and metabolic alterations in the liver that favor the spread of cancer metastases. Conclusions Our findings strongly highlight the powerfulness of full-length transcriptome profiling to yield novel biological insights into understanding the molecular basis of tumorigenesis and will further benefit the treatment of primary and metastatic liver cancers.
1
Citation1
0
Save
0

A new insight into the anatomical ablation approach at R-L ILT for VAs with a left ventricular summit origination: electrophysiological characteristics and catheter ablation

Yang Pang et al.Jan 8, 2025
Ventricular arrhythmia (VA) originating from the left ventricular summit (LVS) poses particular challenges, with higher rates of ablation failure. To further evaluate the anatomical ablation approach from the subaortic region for LVS VAs and their electrophysiological characteristics. The study enrolled 27 consecutive patients with sympatomatic VAs originating from LVS and who received an anatomical ablation approach from R-L ILT in our center. Three different mapping results were obtained as the earliest activation sites (EAS) were observed in the RVOT region (group 1), R-L ILT (group 2), and epicardial region (group 3), respectively. A higher percentage of rS/QS patterns in lead I was observed in Groups 1 and 3. A narrower QRS duration was observed in Group (1) A presystolic potential was recorded at R-L ILT for most VAs in group (2) All VAs were successfully ablated at R-L ILT in groups 1 and 2, though poor pace mapping results were observed at R-L ILT. 4/7 VAs in group 3 ultimately failed after an ablation in both the endocardial and epicardial regions. An anatomical ablation approach at R-L ILT was effective for most VAs with an LVS origin. Different ECG and electrophysiological characteristics could be observed in VAs with different EAS. Poor pace mapping results in all regions with an EAS in the epicardial region had predictive value for the failure of the ablation procedure.
0

Simultaneous ST-elevation in lead augmented vector right (aVR) and III in non-ST-elevation acute coronary syndromes

Qingxing Chen et al.Jun 1, 2024
Background: The value of ST-elevation in lead augmented vector right (aVR) remains controversial in clinical practice. This study aimed to investigate the association of simultaneous ST-elevation in lead aVR and III with angiographic findings and clinical outcomes in patients with non-ST-elevation acute coronary syndromes (NSTEACS). Methods: In this observational study, patients who had been diagnosed with NSTEACS and presented with ST-elevation in lead aVR and without ST-elevation in any other two contiguous leads were enrolled from January 2018 to June 2019. Demographic, baseline clinical, angiographic and interventional characteristics as well as clinical outcomes were collected and recorded on standardized case report forms. Results: A total of 157 patients meeting the criteria were finally enrolled in this study and classified into two groups according to the presence of ST-elevation in lead III. Patients in the two groups were similar in average age and previous history of hypertension, diabetes mellitus, hyperlipidemia, chronic kidney disease, stroke, and peripheral vascular diseases (all P>0.05). Patients with ST-elevation in lead III tended to present with myocardial hypertrophy in the echocardiography (P=0.02). The cases with ST-elevation in lead III showed higher high sensitivity troponin T (hs-TnT; P=0.08) and creatinine kinase MB isoenzyme (CK-MB; P<0.01) whereas those without ST-elevation in lead III showed higher N-terminal pro brain natriuretic peptide (NT-proBNP; P=0.02). Of note, patients with ST-elevation in lead III presented with more ST-depression in multiple leads [especially in lead I, augmented vector left (aVL), V3–V6] as well as higher degree of ST-depression (all P<0.05) and were more likely to develop multi-vessel and left main trunk (LM) lesions (P=0.04), with 20% of the cases having a LM lesion and 60% having triple vessel lesions. Patients with ST-elevation in lead III were at increased risk of 3-year major adverse cardiovascular events (MACEs), despite no significant statistical difference between the two groups (hazard ratio =1.29; P=0.26). Conclusions: The NSTEACS cases with simultaneous ST-elevation in lead III and aVR tended to present with more multiple leads with ST-depression, higher degree of ST-depression, and more LM or multi-vessel lesions, suggesting a broader range of severe myocardial ischemia. The concurrent presentation of ST-elevation in lead III and aVR may play a vital role in the diagnosis, risk-stratification, and prediction of poor prognosis during the management of NSTEACS patients.
Load More