Strigolactones (SLs), a group of carotenoid derived terpenoid lactones, are root-to-shoot phytohormones suppressing shoot branching by inhibiting the outgrowth of axillary buds. DWARF 53 (D53), the key repressor of the SL signaling pathway, is speculated to regulate the downstream transcriptional network of the SL response. However, no downstream transcription factor targeted by D53 has yet been reported. Here we report that Ideal Plant Architecture 1 (IPA1), a key regulator of the plant architecture in rice, functions as a direct downstream component of D53 in regulating tiller number and SL-induced gene expression. We showed that D53 interacts with IPA1 in vivo and in vitro and suppresses the transcriptional activation activity of IPA1. We further showed that IPA1 could directly bind to the D53 promoter and plays a critical role in the feedback regulation of SL-induced D53 expression. These findings reveal that IPA1 is likely one of the long-speculated transcription factors that act with D53 to mediate the SL-regulated tiller development in rice.

Abstract Rice bacterial blight, caused by Xanthomonas oryzae pv. Oryzae ( Xoo ), threatens plant growth and yield. However, the molecular mechanisms underlying rice immunity against Xoo remain elusive. Here, we demonstrated down-regulation of a NAC (NAM-ATAF-CUC) transcription factor OsNAC2 enhanced resistance to bacterial blight disease in rice. Consistently, salicylic acid (SA) biosynthesis was greatly attenuated when OsNAC2 overexpressed. Furthermore, study demonstrated that OsNAC2 can down-regulated the expression of SA synthesis genes, thus mediating SA signal transmission. Simultaneously, OsNAC2 interacted with OsEREBP1 (AP2/ERF family) in the nucleus, may be bloking the inhibition of OsNAC2 to OsICS1 , OsPAL3 and so on. Furthermore, OsEREBP1 interacted with OsXb22a in the cytoplasm to exert its positive regulatory effects to bacterial blight. However, OsNAC2 -overexpression kept OsEREBP1 in the nucleus and be rapidly degraded in pathogen infection, which adversely affects the interaction of OsEREBP1-OsXb22a. Our results determined that OsNAC2 inhibits the SA signaling and stably interacts with OsEREBP1 to maintain disease resistance. This OsNAC2-OsEREBP1-based homeostatic mechanism provides new insights into rice disease resistance, and it may be useful for improving the disease resistance of important crops through breeding.

Glioblastoma (GBM) is a frequent malignant tumor in neurosurgery characterized by a high degree of heterogeneity and genetic instability. DNA double-strand breaks generated by homologous recombination deficiency (HRD) are a well-known contributor to genomic instability, which can encourage tumor development. It is unknown, however, whether the molecular characteristics linked with HRD have a predictive role in GBM. The study aims to assess the extent of genomic instability in GBM using HRD score and investigate the prognostic significance of HRD-related molecular features in GBM.

Plant A/T-rich sequence- and zinc-binding protein (PLATZ) is a type of plant-specific zinc-dependent DNA-binding protein that binds to A/T-rich DNA sequences. This family is essential for plant growth, development, and stress response. In this study, 15 OsPLATZs were identified in the rice genome with complete PLATZ-conserved domains by CD-search, similar to those found in angiosperms. Multi-species phylogenetic analysis showed that PLATZs were conserved in photosynthetic organisms, and an evolutionary branch unique to angiosperms was identified among members of the PLATZ family. Fifteen OsPLATZs were represented by five groups, each with distinct characteristics. An analysis of protein structures and sequence motifs showed that OsPLATZs were similar within groups, but varied between them. The expression profile and qRT-PCR results showed that OsPLATZs had distinct expression patterns in different tissues, with some responding to stress induction. Most of the OsPLATZs localized to the nuclei, and were predicted to bind to DNA sequences by AlphaFold3, suggesting that they likely function as conventional transcription factors. We also identified OsPLATZ1, a caryopsis-specific gene that regulates grain filling and caryopsis development in rice. This research lays the foundation for exploring the structural diversity, evolutionary traits, expression profile, and possible roles of PLATZ transcription factors in rice.