MS
Mia Steinberg
Author with expertise in Genomic Landscape of Cancer and Mutational Signatures
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(25% Open Access)
Cited by:
409
h-index:
7
/
i10-index:
7
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Malleability in communal goals and beliefs influences attraction to stem careers: Evidence for a goal congruity perspective.

Amanda Diekman et al.Jan 1, 2011
The goal congruity perspective posits that 2 distinct social cognitions predict attraction to science, technology, engineering, or mathematics (STEM) fields. First, individuals may particularly value communal goals (e.g., working with or helping others), due to either chronic individual differences or the salience of these goals in particular contexts. Second, individuals hold beliefs about the activities that facilitate or impede these goals, or goal affordance stereotypes. Women's tendency to endorse communal goals more highly than do men, along with consensual stereotypes that STEM careers impede communal goals, intersect to produce disinterest in STEM careers. We provide evidence for the foundational predictions that gender differences emerge primarily on communal rather than agentic goals (Studies 1a and 3) and that goal affordance stereotypes reflect beliefs that STEM careers are relatively dissociated from communal goals (Studies 1b and 1c). Most critically, we provide causal evidence that activated communal goals decrease interest in STEM fields (Study 2) and that the potential for a STEM career to afford communal goals elicits greater positivity (Study 3). These studies thus provide a novel demonstration that understanding communal goals and goal affordance stereotypes can lend insight into attitudes toward STEM pursuits.
2

APOBEC Mutagenesis is Concordant Between Tumor and Viral Genomes in HPV Positive Head and Neck Squamous Cell Carcinoma

Daniel Faden et al.Feb 27, 2021
Abstract APOBEC (apolipoprotein B mRNA-editing enzyme, catalytic polypeptide-like) is a major mutagenic source in human papillomavirus positive oropharyngeal squamous cell carcinoma (HPV+ OPSCC). Why APOBEC mutations predominate in HPV+OPSCC remains an area of active investigation. Prevailing theories focus on APOBECs role as a viral restriction agent. APOBEC-induced mutations have been identified in both human cancers and HPV genomes, but whether they are directly linked in HPV+OPSCCs remains unknown. We performed sequencing of host somatic exomes, transcriptomes and HPV16 genomes from 79 HPV+ OPSCC samples, quantifying APOBEC mutational burden and activity in both the host and virus. APOBEC was the dominant mutational signature in somatic exomes. APOBEC vulnerable PIK3CA hotspot mutations were exclusively present in APOBEC enriched samples. In viral genomes, there was a mean (range) of 5 (0-29) mutations per genome. Mean (range) of APOBEC mutations in the viral genomes was 1 (0-5). Viral APOBEC mutations, compared to non-APOBEC mutations, were more likely to be low-variant allele frequency mutations, suggesting that APOBEC mutagenesis is actively occurring in viral genomes during infection. Paired host and viral analyses revealed that APOBEC-enriched tumor samples had higher viral APOBEC mutation rates ( p =0.028), and APOBEC-associated RNA editing (p=0.008) suggesting that APOBEC mutagenesis in host and viral genomes are directly linked. Using paired sequencing of host somatic exomes, transcriptomes, and viral genomes from HPV+OPSCC samples, here, we show concordance between tumor and viral APOBEC mutagenesis, suggesting that APOBEC-mediated viral restriction results in off-target host-genome mutations. These data provide a missing link connecting APOBEC mutagenesis in host and virus and support a common mechanism driving APOBEC dysregulation.
2
Citation5
0
Save
0

Human papillomavirus 16 positive cervical cancer in Guatemala: The D2 and D3 sublineages differ in integration rate and age of diagnosis

Hong Li et al.Jan 8, 2020
Human papillomavirus (HPV) 16 displays substantial sequence variation; four HPV16 lineages (A, B, C, D) have been described, as well as multiple sub-lineages. To identify molecular events associated with HPV16 carcinogenesis we evaluated viral variation, the integration of HPV16, and somatic mutation in 96 cervical cancer samples from Guatemala. A total of 64% (60/94) of the samples had integrated HPV16 sequences, and integration was associated with an earlier age of diagnosis (P=0.0007) and pre-menopausal disease. HPV16 integration sites were broadly distributed in the genome but in one tumor, HPV16 integrated into the promoter of the interferon regulatory factor 4 (IRF4) gene, which plays an important role in the regulation of the interferon response to viral infection. The HPV16 D2 and D3 sub-lineages were found in 23% and 30% of the tumors, respectively and were significantly associated with adenocarcinoma. D2-positive tumors had a higher rate of integration (P=0.011), earlier age of diagnosis (P=0.012), and a lower rate of somatic mutation (P=0.03). Whereas D3-positive tumors are less likely to integrate, have later age-of-diagnosis, and a higher rate of somatic mutation. In conclusion, Guatemalan cervical tumors have a high frequency of the very high-risk HPV16 D2 and D3 sub-lineages and cervical cancer patients with these variants of HPV16 differ in histology, age-of-diagnosis, integration, and somatic mutation frequency. In summary, related lineages of HPV16 have different features of oncogenicity.