Abstract SARS-CoV-2 Beta and Omicron variants have multiple mutations in the receptor-binding domain (RBD) allowing antibody evasion. Despite the resistance to circulating antibodies in those who received two doses of mRNA vaccine, the third dose prominently recalls cross-neutralizing antibodies with expanded breadth to these variants. Herein, we longitudinally profiled the cellular composition of persistent memory B-cell subsets and their antibody reactivity against these variants following the second vaccine dose. The vaccination elicited a memory B-cell subset with resting phenotype that dominated the other subsets at 4.9 months. Notably, most of the resting memory subset retained the ability to bind the Beta variant, and the memory-derived antibodies cross-neutralized the Beta and Omicron variants at frequencies of 59% and 29%, respectively. The preservation of cross-neutralizing antibody repertoires in the durable memory B-cell subset likely contributes to the prominent recall of cross-neutralizing antibodies following the third dose of the vaccine. One Sentence Summary Fully vaccinated individuals preserve cross-neutralizing memory B-cells against the SARS-CoV-2 Omicron variant.

Influenza infection and vaccination impart strain-specific immunity that fails to protect against both seasonal antigenic variants and the next pandemic. However, antibodies directed to conserved sites can confer broad protection. We identify and characterize a class of human antibodies that engage a previously undescribed, conserved, epitope on the influenza hemagglutinin protein (HA). Prototype antibody S8V1-157 binds at the normally occluded interface between the HA head and stem. Antibodies to this HA head-stem interface epitope are non-neutralizing in vitro but protect against lethal infection in mice. Their breadth of binding extends across most influenza A serotypes and seasonal human variants. Antibodies to the head-stem interface epitope are present at low frequency in the memory B cell populations of multiple donors. The immunogenicity of the epitope warrants its consideration for inclusion in improved or universal influenza vaccines.

Abstract Accumulated studies have reported that hematopoietic differentiation was primarily regulated by transcription factors. Early B cell factor 1 (EBF1) is an essential transcription factor for B lymphopoiesis. Contrary to the canonical notion, we found that a single miRNA, miRNA-195 (miR-195) transduction let EBF1 deficient hematopoietic progenitor cells (HPCs) express CD19, carry out V(D)J recombination and class switch recombination, which implied that B cell matured without EBF1. A part of the mechanism was caused by FOXO1 accumulation via inhibition of FOXO1 phosphorylation pathways in which targets of miR-195 are enriched. These results suggested that some miRNA transductions could function as alternatives to transcription factors.

Abstract Re-entry of memory B cells to recall germinal centers (GCs) is essential for updating their B-cell antigen receptors (BCRs). Using single B-cell culture and fate-mapping, we have characterized BCR repertoires in recall GCs following boost immunizations at sites local or distal to the priming. Local boosts with homologous antigen recruit to recall GCs progeny of primary GC B cells more efficiently than do distal boosts. Recall GCs following local boosts contain significantly more B cells with elevated levels of Ig mutations and higher avidity BCRs. This local preference is unaffected by blockade of CD40:CD154 interaction that terminate active, primary GC responses. Local boosts with heterologous antigens elicit secondary GCs with B-cell populations enriched for cross-reactivity to the priming and boosting antigens; in contrast, cross-reactive GC B cells are rare following distal boosts. Our findings indicate the importance of locality in humoral immunity and inform serial vaccination strategies for evolving viruses. One Sentence Summary The participation of memory B cells in recall germinal centers depends on whether the boost is local or distal to the priming site.