PV
Petia Vlahovska
Author with expertise in Lipid Rafts and Membrane Dynamics
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(83% Open Access)
Cited by:
332
h-index:
38
/
i10-index:
68
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

A new class of synthetic retinoid antibiotics effective against bacterial persisters

Wooseong Kim et al.Mar 27, 2018
A challenge in the treatment of Staphylococcus aureus infections is the high prevalence of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) strains and the formation of non-growing, dormant 'persister' subpopulations that exhibit high levels of tolerance to antibiotics and have a role in chronic or recurrent infections. As conventional antibiotics are not effective in the treatment of infections caused by such bacteria, novel antibacterial therapeutics are urgently required. Here we used a Caenorhabditis elegans-MRSA infection screen to identify two synthetic retinoids, CD437 and CD1530, which kill both growing and persister MRSA cells by disrupting lipid bilayers. CD437 and CD1530 exhibit high killing rates, synergism with gentamicin, and a low probability of resistance selection. All-atom molecular dynamics simulations demonstrated that the ability of retinoids to penetrate and embed in lipid bilayers correlates with their bactericidal ability. An analogue of CD437 was found to retain anti-persister activity and show an improved cytotoxicity profile. Both CD437 and this analogue, alone or in combination with gentamicin, exhibit considerable efficacy in a mouse model of chronic MRSA infection. With further development and optimization, synthetic retinoids have the potential to become a new class of antimicrobials for the treatment of Gram-positive bacterial infections that are currently difficult to cure.
0
Citation328
0
Save
1

A vesicle microrheometer for high-throughput viscosity measurements of lipid and polymer membranes

Hammad Faizi et al.Mar 4, 2021
Viscosity is a key property of cell membranes that controls mobility of embedded proteins and membrane remodeling. Measuring it is challenging because existing approaches involve complex experimental designs and/or models, and the applicability of some is limited to specific systems and membrane compositions. As a result there is scarcity of data and the reported values for membrane viscosity vary by orders of magnitude for the same system. Here, we show how viscosity of bilayer membranes can be obtained from the transient deformation of giant unilamellar vesicles. The approach enables a non-invasive, probe-independent and high-throughput measurement of the viscosity of bilayers made of lipids or polymers with a wide range of compositions and phase state. Pure lipid and single-phase mixed bilayers are found to behave as Newtonian fluids with strain-rate independent viscosity, while phase-separated and diblock-copolymers systems exhibit shear-thinning in the explored range of strain rates 1-2000 s−1. The results also reveal that electrically polarized bilayers can be significantly more viscous than charge-neutral bilayers. These findings suggest that biomembrane viscosity is a dynamic property that can be actively modulated not only by composition but also by membrane polarization, e.g., as in action potentials.
1
Citation3
0
Save
0

Active membrane deformations of a minimal synthetic cell

Alfredo Sciortino et al.Dec 18, 2023
Biological cells exhibit the remarkable ability to adapt their shape in response to their environment, a phenomenon that hinges on the intricate interplay between their deformable membrane and the underlying activity of their cytoskeleton. Yet, the precise physical mechanisms of this coupling remain mostly elusive. Here, we introduce a synthetic cell model, comprised of an active cytoskeletal network of microtubules, crosslinkers and molecular motors encapsulated inside giant vesicles. Remarkably, these active vesicles exhibit large shape fluctuations and life-like morphing abilities. Active forces from the encapsulated cytoskeleton give rise to large-scale traveling membrane deformations. Quantitative analysis of membrane and microtubule fluctuations shows how the intricate coupling of confinement, membrane material properties and cytoskeletal forces yields fluctuation spectra whose characteristic scales in space and time are distinctly different from passive vesicles. We demonstrate how activity leads to uneven probability fluxes between fluctuation modes and hence sets the temporal scale of membrane fluctuations. Using simulations and theoretical modelling, we extend the classical approach to membrane fluctuations to active cytoskeleton-driven vesicles, highlighting the effect of correlated activity on the dynamics of membrane deformations and paving the way for quantitative descriptions of the shape-morphing ability typical of living systems.
0
Citation1
0
Save
0

Electrohydrodynamic flow about a colloidal particle suspended in a non-polar fluid

Zhanwen Wang et al.Nov 25, 2024
Nonlinear electrokinetic phenomena, where electrically driven fluid flows depend nonlinearly on the applied voltage, are commonly encountered in aqueous suspensions of colloidal particles. A prime example is the induced-charge electro-osmosis, driven by an electric field acting on diffuse charge induced near a polarizable surface. Nonlinear electrohydrodynamic flows also occur in non-polar fluids, driven by the electric field acting on space charge induced by conductivity gradients. Here, we analyse the flows about a charge-neutral spherical solid particle in an applied uniform electric field that arise from conductivity dependence on local field intensity. The flow pattern varies with particle conductivity: while the flow about a conducting particle has a quadrupolar pattern similar to induced-charge electro-osmosis, albeit with opposite direction, the flow about an insulating particle has a more complex structure. We find that this flow induces a force on a particle near an electrode that varies non-trivially with particle conductivity: while it is repulsive for perfectly insulating particles and particles more conductive than the suspending medium, there exists a range of particle conductivities where the force is attractive. The force decays as the inverse square of the distance to the electrode and thus can dominate the dielectrophoretic attraction due to the image dipole, which falls off with the fourth power with the distance. This electrohydrodynamic lift opens new possibilities for colloidal manipulation and driven assembly by electric fields.