A population-based series of 649 unselected incident cases of ovarian cancer diagnosed in Ontario, Canada, during 1995–96 was screened for germline mutations in BRCA1 and BRCA2. We specifically tested for 11 of the most commonly reported mutations in the two genes. Then, cases were assessed with the protein-truncation test (PTT) for exon 11 of BRCA1, with denaturing gradient gel electrophoresis for the remainder of BRCA1, and with PTT for exons 10 and 11 of BRCA2. No mutations were found in all 134 women with tumors of borderline histology. Among the 515 women with invasive cancers, we identified 60 mutations, 39 in BRCA1 and 21 in BRCA2. The total mutation frequency among women with invasive cancers, 11.7% (95% confidence interval [95%CI] 9.2%–14.8%), is higher than previous estimates. Hereditary ovarian cancers diagnosed at age <50 years were mostly (83%) due to BRCA1, whereas the majority (60%) of those diagnosed at age >60 years were due to BRCA2. Mutations were found in 19% of women reporting first-degree relatives with breast or ovarian cancer and in 6.5% of women with no affected first-degree relatives. Risks of ovarian, breast, and stomach cancers and leukemias/lymphomas were increased nine-, five-, six- and threefold, respectively, among first-degree relatives of cases carrying BRCA1 mutations, compared with relatives of noncarriers, and risk of colorectal cancer was increased threefold for relatives of cases carrying BRCA2 mutations. For carriers of BRCA1 mutations, the estimated penetrance by age 80 years was 36% for ovarian cancer and 68% for breast cancer. In breast-cancer risk for first-degree relatives, there was a strong trend according to mutation location along the coding sequence of BRCA1, with little evidence of increased risk for mutations in the 5′ fifth, but 8.8-fold increased risk for mutations in the 3′ fifth (95%CI 3.6–22.0), corresponding to a carrier penetrance of essentially 100%. Ovarian, colorectal, stomach, pancreatic, and prostate cancer occurred among first-degree relatives of carriers of BRCA2 mutations only when mutations were in the ovarian cancer–cluster region (OCCR) of exon 11, whereas an excess of breast cancer was seen when mutations were outside the OCCR. For cancers of all sites combined, the estimated penetrance of BRCA2 mutations was greater for males than for females, 53% versus 38%. Past studies may have underestimated the contribution of BRCA2 to ovarian cancer, because mutations in this gene cause predominantly late-onset cancer, and previous work has focused more on early-onset disease. If confirmed in future studies, the trend in breast-cancer penetrance, according to mutation location along the BRCA1 coding sequence, may have significant impact on treatment decisions for carriers of BRCA1-mutations. As well, BRCA2 mutations may prove to be a greater cause of cancer in male carriers than previously has been thought. A population-based series of 649 unselected incident cases of ovarian cancer diagnosed in Ontario, Canada, during 1995–96 was screened for germline mutations in BRCA1 and BRCA2. We specifically tested for 11 of the most commonly reported mutations in the two genes. Then, cases were assessed with the protein-truncation test (PTT) for exon 11 of BRCA1, with denaturing gradient gel electrophoresis for the remainder of BRCA1, and with PTT for exons 10 and 11 of BRCA2. No mutations were found in all 134 women with tumors of borderline histology. Among the 515 women with invasive cancers, we identified 60 mutations, 39 in BRCA1 and 21 in BRCA2. The total mutation frequency among women with invasive cancers, 11.7% (95% confidence interval [95%CI] 9.2%–14.8%), is higher than previous estimates. Hereditary ovarian cancers diagnosed at age <50 years were mostly (83%) due to BRCA1, whereas the majority (60%) of those diagnosed at age >60 years were due to BRCA2. Mutations were found in 19% of women reporting first-degree relatives with breast or ovarian cancer and in 6.5% of women with no affected first-degree relatives. Risks of ovarian, breast, and stomach cancers and leukemias/lymphomas were increased nine-, five-, six- and threefold, respectively, among first-degree relatives of cases carrying BRCA1 mutations, compared with relatives of noncarriers, and risk of colorectal cancer was increased threefold for relatives of cases carrying BRCA2 mutations. For carriers of BRCA1 mutations, the estimated penetrance by age 80 years was 36% for ovarian cancer and 68% for breast cancer. In breast-cancer risk for first-degree relatives, there was a strong trend according to mutation location along the coding sequence of BRCA1, with little evidence of increased risk for mutations in the 5′ fifth, but 8.8-fold increased risk for mutations in the 3′ fifth (95%CI 3.6–22.0), corresponding to a carrier penetrance of essentially 100%. Ovarian, colorectal, stomach, pancreatic, and prostate cancer occurred among first-degree relatives of carriers of BRCA2 mutations only when mutations were in the ovarian cancer–cluster region (OCCR) of exon 11, whereas an excess of breast cancer was seen when mutations were outside the OCCR. For cancers of all sites combined, the estimated penetrance of BRCA2 mutations was greater for males than for females, 53% versus 38%. Past studies may have underestimated the contribution of BRCA2 to ovarian cancer, because mutations in this gene cause predominantly late-onset cancer, and previous work has focused more on early-onset disease. If confirmed in future studies, the trend in breast-cancer penetrance, according to mutation location along the BRCA1 coding sequence, may have significant impact on treatment decisions for carriers of BRCA1-mutations. As well, BRCA2 mutations may prove to be a greater cause of cancer in male carriers than previously has been thought.

Background & Aims:Genetic variations in proinflammatory and anti-inflammatory cytokine genes influence individual response to carcinogenic exposures. Polymorphisms in interleukin (IL)-1β and its endogenous receptor antagonist are associated with risk of Helicobacter pylori-related gastric cancer. The aim of this study was to evaluate the role of proinflammatory cytokine gene polymorphisms in gastric and esophageal cancers defined by anatomic subsite.Methods:We assessed polymorphisms of the IL-1 gene cluster and 4 other cytokine genes in a population-based case-control study of upper gastrointestinal cancers, including gastric cardia (n = 126) and noncardia adenocarcinoma (n = 188), esophageal squamous cell carcinoma (n = 53), and adenocarcinoma (n = 108), and frequency-matched controls (n = 212). ORs for the different cancers were computed from logistic regression models adjusted for potential confounding factors.Results:Proinflammatory genotypes of tumor necrosis factor α and IL-10 were each associated with more than doubling of the risk of noncardia gastric cancer. Carriage of multiple proinflammatory polymorphisms of IL-1Bo IL-1 receptor antagonist, tumor necrosis factor A, and IL-10 conferred greater risk, with ORs (and 95% confidence intervals) of 2.8 (1.6–5.1) for one, 5.4 (2.7–10.6) for 2, and 27.3 (7.4–99.8) for 3 or 4 high-risk genotypes. In contrast, these polymorphisms were not consistently related to the risks of esophageal or gastric cardia cancers. Polymorphisms in IL-4 and IL-6 were not associated with any of the cancers studied.Conclusions:A proinflammatory cytokine genetic profile increases the risk of noncardia gastric adenocarcinoma but not other upper gastrointestinal cancers, possibly by inducing a hypochlorhydric and atrophic response to gastric H. pylori infection.

BRCA1 and BRCA2 mutations in general populations and in various types of cancers have not been well characterized. We investigated the presence of these mutations in unselected patients with newly diagnosed incident ovarian cancer in Ontario, Canada, with respect to cancers reported among their relatives.A population series of 1171 unselected patients with incident ovarian cancer diagnosed between January 1, 1995, and December 31, 1999, in Ontario, Canada, was screened for germline mutations throughout the BRCA1 and BRCA2 genes. Screening involved testing for common variants, then protein truncation testing of long exons, and then denaturing gradient gel electrophoresis or denaturing high-performance liquid chromatography for the remainder of BRCA1 and BRCA2, respectively. Cox regression analysis was used to examine cancer outcomes reported by the case probands for their 8680 first-degree relatives. Population allele frequencies and relative risks (RRs) were derived from the regression results by an extension of Saunders-Begg methods. Age-specific Ontario cancer incidence rates were used to estimate cumulative incidence of cancer to age 80 years by mutation status.Among 977 patients with invasive ovarian cancer, 75 had BRCA1 mutations and 54 had BRCA2 mutations, for a total mutation frequency of 13.2% (95% confidence interval [CI] = 11.2% to 15.5%). Higher risks for various cancer types in the general Ontario population were associated with BRCA1 mutation carriage than with noncarriage, including ovarian (RR = 21, 95% CI = 12 to 36), female breast (RR = 11, 95% CI = 7.5 to 15), and testis (RR = 17, 95% CI = 1.3 to 230) cancers. Higher risks were also associated with BRCA2 mutation carriage than with noncarriage, particularly for ovarian (RR = 7.0, 95% CI = 3.1 to 16), female and male breast (RR = 4.6, 95% CI = 2.7 to 7.8, and RR = 102, 95% CI = 9.9 to 1050, respectively), and pancreatic (RR = 6.6, 95% CI = 1.9 to 23) cancers. Cancer risks differed according to the mutation's position in the gene. Estimated cumulative incidence to age 80 years among women carrying BRCA1 mutations was 24% for ovarian cancer and 90% for breast cancer and among women carrying BRCA2 mutations was 8.4% for ovarian cancer and 41% for breast cancer. For the general Ontario population, estimated carrier frequencies of BRCA1 and BRCA2 mutations, respectively, were 0.32% (95% CI = 0.23% to 0.45%) and 0.69% (95% CI = 0.43% to 1.10%).BRCA1 and BRCA2 mutations may be more frequent in general populations than previously thought and may be associated with various types of cancers.

Incidence rates have risen rapidly for esophageal adenocarcinoma and moderately for gastric cardia adenocarcinoma, while rates have remained stable for esophageal squamous cell carcinoma and have declined steadily for noncardia gastric adenocarcinoma. We examined anthropometric risk factors in a population-based case-control study of esophageal and gastric cancers in Connecticut, New Jersey, and western Washington.Healthy control subjects (n = 695) and case patients with esophageal squamous cell carcinoma or noncardia gastric adenocarcinoma (n = 589) were frequency-matched to case patients with adenocarcinomas of esophagus or gastric cardia (n = 554) by 5-year age groups, sex, and race (New Jersey only). Classification of cases by tumor site of origin and histology was determined by review of pathology materials and hospital records. Data were collected using in-person structured interviews. Associations with obesity, measured by body mass index (BMI), were estimated by odds ratios (ORs). All ORs were adjusted for geographic location, age, sex, race, cigarette smoking, and proxy response status.The ORs for esophageal adenocarcinoma rose with increasing adult BMI. The magnitude of association with BMI was greater among the younger age groups and among nonsmokers. The ORs for gastric cardia adenocarcinoma rose moderately with increasing BMI. Adult BMI was not associated with risk of esophageal squamous cell carcinoma or noncardia gastric adenocarcinoma.Increasing prevalence of obesity in the United States population may have contributed to the upward trends in esophageal and gastric cardia adenocarcinomas.

Background: Incidence rates for adenocarcinomas of the esophagus and gastric cardia have risen steeply over the last few decades. To determine risk factors for these tumors, we conducted a multicenter, population-based, case-control study. Methods: The study included 554 subjects newly diagnosed with esophageal or gastric cardia adenocarcinomas, 589 subjects newly diagnosed with esophageal squamous cell carcinoma or other gastric adenocarcinomas, and 695 control subjects. Estimates of risk (odds ratios [ORs] and corresponding 95% confidence intervals [CIs]) were calculated for the four tumor types separately and for esophageal and gastric cardia adenocarcinomas combined. Results: Risk of esophageal and gastric cardia adenocarcinomas combined was increased among current cigarette smokers (OR = 2.4; 95% = 1.7-3.4), with little reduction observed until 30 years after smoking cessation; this risk rose with increasing intensity and duration of smoking. Risk of these tumors was not related to beer (OR = 0.8; 95% CI = 0.6-1.1) or liquor (OR = 1.1; 95% CI = 0.8-1.4) consumption, but it was reduced for drinking wine (OR = 0.6; 95% CI = 0.5-0.8). Similar ORs were obtained for the development of noncardia gastric adenocarcinomas in relation to tobacco and alcohol use, but higher ORs were obtained for the development of esophageal squamous cell carcinomas. For all four tumor types, risks were higher among those with low income or education. Conclusions: Smoking is a major risk factor for esophageal and gastric cardia adenocarcinomas, accounting for approximately 40% of cases. Implications: Because of the long lag time before risk of these tumors is reduced among exsmokers, smoking may affect early stage carcinogenesis. The increase in smoking prevalence during the first two thirds of this century may be reflected in the rising incidence of these tumors in the past few decades among older individuals. The recent decrease in smoking may not yet have had an impact.

We conducted a genome-wide association study of pancreatic cancer in 3,851 affected individuals (cases) and 3,934 unaffected controls drawn from 12 prospective cohort studies and 8 case-control studies. Based on a logistic regression model for genotype trend effect that was adjusted for study, age, sex, self-described ancestry and five principal components, we identified eight SNPs that map to three loci on chromosomes 13q22.1, 1q32.1 and 5p15.33. Two correlated SNPs, rs9543325 (P = 3.27 x 10(-11), per-allele odds ratio (OR) 1.26, 95% CI 1.18-1.35) and rs9564966 (P = 5.86 x 10(-8), per-allele OR 1.21, 95% CI 1.13-1.30), map to a nongenic region on chromosome 13q22.1. Five SNPs on 1q32.1 map to NR5A2, and the strongest signal was at rs3790844 (P = 2.45 x 10(-10), per-allele OR 0.77, 95% CI 0.71-0.84). A single SNP, rs401681 (P = 3.66 x 10(-7), per-allele OR 1.19, 95% CI 1.11-1.27), maps to the CLPTM1L-TERT locus on 5p15.33, which is associated with multiple cancers. Our study has identified common susceptibility loci for pancreatic cancer that warrant follow-up studies.

Abstract

 Completeness of cancer registration has not been consistently ascertained across different registries. This report describes how capture-recapture methods have been used to estimate completeness at the Ontario Cancer Registry. The method was applied in two fashions; first, using three data sources in a modeling approach: and second, using two data sources and standard, simple capture-recapture methods. The modeling approach is more flexible, since several variables that influence cancer registration can be considered and can be used to identify reporting patterns of different data sources. In the present analysis, estimates of completeness of the registry as a whole were remarkably similar using either two or three data sources, and site-specific comparisons differed by at most 7%. Because of the advantages of capture-recapture methods—estimation of level of completeness, possible comparability of estimates across different registries, and versatility to consider other determinants of cancer registration—a plea for greater use of these methods in cancer registration is made.

A case-control study of male-female differences in cigarette smoking and lung cancer was conducted during 1981-1985 in Toronto, St. Catharine's, and Niagara Falls, Ontario, Canada. In total, 442 female and 403 male histologically verified cancer cases were individually matched by age and area of residence to each other and to 410 female and 362 male randomly selected population controls. Subjects were interviewed concerning their exposures to various life-style factors, and in particular, they received detailed questioning regarding their lifelong histories of usage of tobacco products. It was found that, for both sexes, a greatly elevated risk of developing lung cancer was associated with cigarette consumption, increasing with pack-years of cigarettes smoked and declining with duration of time since quitting smoking. Furthermore, the association was significantly (p = 0.010) and appreciably stronger for females than for males. At a history of 40 pack-years relative to lifelong nonsmoking, the odds ratio for women was 27.9 (95% confidence interval (CI) 14.9-52.0) and that for men was 9.60 (95% CI 5.64-16.3). Higher odds ratios for females were also seen within each of the major histologic groupings. Thus, the higher elevated risk of lung cancer currently observed in other studies for female ever smokers compared with male ever smokers, while possibly attributable in part to greater smoking cessation among males, may be due to higher susceptibility among females.

Importance

 The causal direction and magnitude of the association between telomere length and incidence of cancer and non-neoplastic diseases is uncertain owing to the susceptibility of observational studies to confounding and reverse causation. 

Objective

 To conduct a Mendelian randomization study, using germline genetic variants as instrumental variables, to appraise the causal relevance of telomere length for risk of cancer and non-neoplastic diseases. 

Data Sources

 Genomewide association studies (GWAS) published up to January 15, 2015. 

Study Selection

 GWAS of noncommunicable diseases that assayed germline genetic variation and did not select cohort or control participants on the basis of preexisting diseases. Of 163 GWAS of noncommunicable diseases identified, summary data from 103 were available. 

Data Extraction and Synthesis

 Summary association statistics for single nucleotide polymorphisms (SNPs) that are strongly associated with telomere length in the general population. 

Main Outcomes and Measures

 Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) for disease per standard deviation (SD) higher telomere length due to germline genetic variation. 

Results

 Summary data were available for 35 cancers and 48 non-neoplastic diseases, corresponding to 420 081 cases (median cases, 2526 per disease) and 1 093 105 controls (median, 6789 per disease). Increased telomere length due to germline genetic variation was generally associated with increased risk for site-specific cancers. The strongest associations (ORs [95% CIs] per 1-SD change in genetically increased telomere length) were observed for glioma, 5.27 (3.15-8.81); serous low-malignant-potential ovarian cancer, 4.35 (2.39-7.94); lung adenocarcinoma, 3.19 (2.40-4.22); neuroblastoma, 2.98 (1.92-4.62); bladder cancer, 2.19 (1.32-3.66); melanoma, 1.87 (1.55-2.26); testicular cancer, 1.76 (1.02-3.04); kidney cancer, 1.55 (1.08-2.23); and endometrial cancer, 1.31 (1.07-1.61). Associations were stronger for rarer cancers and at tissue sites with lower rates of stem cell division. There was generally little evidence of association between genetically increased telomere length and risk of psychiatric, autoimmune, inflammatory, diabetic, and other non-neoplastic diseases, except for coronary heart disease (OR, 0.78 [95% CI, 0.67-0.90]), abdominal aortic aneurysm (OR, 0.63 [95% CI, 0.49-0.81]), celiac disease (OR, 0.42 [95% CI, 0.28-0.61]) and interstitial lung disease (OR, 0.09 [95% CI, 0.05-0.15]). 

Conclusions and Relevance

 It is likely that longer telomeres increase risk for several cancers but reduce risk for some non-neoplastic diseases, including cardiovascular diseases.

Background The heritable fraction of ovarian cancer exceeds that of any other common adult cancer. Most inherited cases of ovarian cancer are due to a germline mutation in BRCA1 or BRCA2. It is important to have an accurate estimate of the proportion of ovarian cancer patients who carry a mutation and the specific factors which predict the presence of a mutation. Methods We tested a population-based series of 1342 unselected patients diagnosed with invasive ovarian cancer between 1995–1999 and 2002–2004 in Ontario, Canada, for germline mutations in BRCA1 and BRCA2. The two genes were tested in their entirety, using a range of techniques, including multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA). Results Among the 1342 women, 176 women carried a mutation (107 in BRCA1, 67 in BRCA2, and two in both genes) for a combined mutation frequency of 13.3%. Seven deletions were identified using MLPA (3.9% of all detected mutations). The prevalence of mutations was particularly high among women diagnosed in their forties (24.0%), in women with serous ovarian cancer (18.0%) and women of Italian (43.5%), Jewish (30.0%) or Indo-Pakistani origin (29.4%). A mutation was seen in 33.9% of women with a first-degree relative with breast or ovarian cancer and in 7.9% of women with no first-degree relative with breast or ovarian cancer. No mutation was seen in women with mucinous carcinoma. Conclusions BRCA1 and BRCA2 mutations are common in women with invasive ovarian cancer. All women diagnosed with invasive non-mucinous ovarian cancer should be considered to be candidates for genetic testing.