XZ
Xiaoqian Zeng
Author with expertise in Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats and CRISPR-associated proteins
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
2
/
i10-index:
1
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
22

Simple cloning of large natural product biosynthetic gene clusters from Streptomyces by an engineered CRISPR/Cas12a system

Mindong Liang et al.Jun 25, 2020
+16
C
L
M
Directly cloning of biosynthetic gene clusters (BGCs) from microbial genomes has been revolutionizing the natural product-based drug discovery. However, it is still very challenging to efficiently clone, for example, large (> 80kb) and GC-rich (> 70%), streptomycete originating BGCs. In this study, we developed a simple, fast yet efficient and low-cost in vitro platform for direct cloning large BGCs from streptomycete genomic DNA, named as CAT-FISHING (CRISPR/Cas12a- and Agarose plug-based sysTem for Fast bIoSyntHetIc geNe cluster cloninG), by combining the advantages of CRISPR/Cas12a cleavage and bacterial artificial chromosome (BAC) library construction. CAT-FISHING was demonstrated by directly cloning large DNA fragments ranging from 47 to 139 kb with GC content of > 70% from the S. albus J1074 genome in a relatively efficient manner. Moreover, surugamides, encoded by a captured 87-kb BGC with GC content of 76%, was heterologously expressed in a Streptomyces chassis. These results indicate that CAT-FISHING is a powerful platform for BGCs batch cloning, which would be greatly beneficial to the natural products-based drug discovery. We believe that this system will lead a renaissance of interest in microorganisms as a source for drug development.
0

Unleashing the potential: type I CRISPR-Cas systems in actinomycetes for genome editing

Shuliu Wang et al.Jan 1, 2024
+5
Y
X
S
This review introduces the potential of type I CRISPR-Cas systems in actinomycetes for genome editing and discusses how to establish and develop genome editing tools based on type I CRISPR-Cas systems in actinomycetes.