Chlamydomonas reinhardtii is a unicellular green alga whose lineage diverged from land plants over 1 billion years ago. It is a model system for studying chloroplast-based photosynthesis, as well as the structure, assembly, and function of eukaryotic flagella (cilia), which were inherited from the common ancestor of plants and animals, but lost in land plants. We sequenced the ∼120-megabase nuclear genome of Chlamydomonas and performed comparative phylogenomic analyses, identifying genes encoding uncharacterized proteins that are likely associated with the function and biogenesis of chloroplasts or eukaryotic flagella. Analyses of the Chlamydomonas genome advance our understanding of the ancestral eukaryotic cell, reveal previously unknown genes associated with photosynthetic and flagellar functions, and establish links between ciliopathy and the composition and function of flagella.

ADVERTISEMENT RETURN TO ISSUEPREVArticleNEXTAminomethylation of Ferrocene to Form N,N-Dimethylaminomethylferrocene and Its Conversion to the Corresponding Alcohol and Aldehyde1JACQUE K. LINDSAY and CHARLES R. HAUSERCite this: J. Org. Chem. 1957, 22, 4, 355–358Publication Date (Print):April 1, 1957Publication History Published online1 May 2002Published inissue 1 April 1957https://doi.org/10.1021/jo01355a001RIGHTS & PERMISSIONSArticle Views1727Altmetric-Citations194LEARN ABOUT THESE METRICSArticle Views are the COUNTER-compliant sum of full text article downloads since November 2008 (both PDF and HTML) across all institutions and individuals. These metrics are regularly updated to reflect usage leading up to the last few days.Citations are the number of other articles citing this article, calculated by Crossref and updated daily. Find more information about Crossref citation counts.The Altmetric Attention Score is a quantitative measure of the attention that a research article has received online. Clicking on the donut icon will load a page at altmetric.com with additional details about the score and the social media presence for the given article. Find more information on the Altmetric Attention Score and how the score is calculated. Share Add toView InAdd Full Text with ReferenceAdd Description ExportRISCitationCitation and abstractCitation and referencesMore Options Share onFacebookTwitterWechatLinked InReddit PDF (473 KB) Get e-Alerts Get e-Alerts

Bioinformatics, a discipline that combines aspects of biology, statistics, and computer science, is increasingly important for biological research. However, bioinformatics instruction is rarely integrated into life sciences curricula at the undergraduate level. To understand why, the Network for Integrating Bioinformatics into Life Sciences Education (NIBLSE, "nibbles") recently undertook an extensive survey of life sciences faculty in the United States. The survey responses to open-ended questions about barriers to integration were subjected to keyword analysis. The barrier most frequently reported by the ~1,260 respondents was lack of faculty training. Faculty at associate's-granting institutions report the least training in bioinformatics and the least integration of bioinformatics into their teaching. Faculty from underrepresented minority groups (URMs) in STEM reported training barriers at a higher rate than others, although the number of URM respondents was small. Interestingly, the cohort of faculty with the most recently awarded PhD degrees reported the most training but were teaching bioinformatics at a lower rate than faculty who earned their degrees in previous decades. Other barriers reported included lack of student interest in bioinformatics; lack of student preparation in mathematics, statistics, and computer science; already overly full curricula; and limited access to resources, including hardware, software, and vetted teaching materials. The results of the survey, the largest to date on bioinformatics education, will guide efforts to further integrate bioinformatics instruction into undergraduate life sciences education.

Bioinformatics is becoming increasingly central to research in the life sciences. However, despite its importance, bioinformatics skills and knowledge are not well integrated in undergraduate biology education. This curricular gap prevents biology students from harnessing the full potential of their education, limiting their career opportunities and slowing genomic research innovation. To advance the integration of bioinformatics into life sciences education, a framework of core bioinformatics competencies is needed. To that end, we here report the results of a survey of life sciences faculty in the United States about teaching bioinformatics to undergraduate life scientists. Responses were received from 1,260 faculty representing institutions in all fifty states with a combined capacity to educate hundreds of thousands of students every year. Results indicate strong, widespread agreement that bioinformatics knowledge and skills are critical for undergraduate life scientists, as well as considerable agreement about which skills are necessary. Perceptions of the importance of some skills varied with the respondent's degree of training, time since degree earned, and/or the Carnegie classification of the respondent's institution. To assess which skills are currently being taught, we analyzed syllabi of courses with bioinformatics content submitted by survey respondents. Finally, we used the survey results, the analysis of syllabi, and our collective research and teaching expertise to develop a set of bioinformatics core competencies for undergraduate life sciences students. These core competencies are intended to serve as a guide for institutions as they work to integrate bioinformatics into their life sciences curricula.