Remdesivir, a nucleotide analogue prodrug that inhibits viral RNA polymerases, has shown in vitro activity against SARS-CoV-2.We provided remdesivir on a compassionate-use basis to patients hospitalized with Covid-19, the illness caused by infection with SARS-CoV-2. Patients were those with confirmed SARS-CoV-2 infection who had an oxygen saturation of 94% or less while they were breathing ambient air or who were receiving oxygen support. Patients received a 10-day course of remdesivir, consisting of 200 mg administered intravenously on day 1, followed by 100 mg daily for the remaining 9 days of treatment. This report is based on data from patients who received remdesivir during the period from January 25, 2020, through March 7, 2020, and have clinical data for at least 1 subsequent day.Of the 61 patients who received at least one dose of remdesivir, data from 8 could not be analyzed (including 7 patients with no post-treatment data and 1 with a dosing error). Of the 53 patients whose data were analyzed, 22 were in the United States, 22 in Europe or Canada, and 9 in Japan. At baseline, 30 patients (57%) were receiving mechanical ventilation and 4 (8%) were receiving extracorporeal membrane oxygenation. During a median follow-up of 18 days, 36 patients (68%) had an improvement in oxygen-support class, including 17 of 30 patients (57%) receiving mechanical ventilation who were extubated. A total of 25 patients (47%) were discharged, and 7 patients (13%) died; mortality was 18% (6 of 34) among patients receiving invasive ventilation and 5% (1 of 19) among those not receiving invasive ventilation.In this cohort of patients hospitalized for severe Covid-19 who were treated with compassionate-use remdesivir, clinical improvement was observed in 36 of 53 patients (68%). Measurement of efficacy will require ongoing randomized, placebo-controlled trials of remdesivir therapy. (Funded by Gilead Sciences.).

Background Current diagnostic techniques are inadequate for rapid microbial diagnosis and optimal management of patients with suspected sepsis. We assessed the clinical impact of three powerful molecular diagnostic methods.Methods With blood samples from 200 consecutive patients with suspected sepsis, we evaluated 1) metagenomic shotgun sequencing together with a Bayesian inference approach for contaminant sequence removal, for detecting bacterial DNA; 2) viral capture sequencing; and 3) transcript-based host response profiling for classifying patients as infected or not, and if infected, with bacteria or viruses. We then evaluated changes in diagnostic decision-making among three expert physicians by unblinding the results of these methods in a staged fashion.Results Metagenomic shotgun sequencing confirmed positive blood culture results in 14 of 26 patients. In 17 of 200 patients, metagenomic sequencing and viral capture sequencing revealed organisms that were 1) not detected by conventional hospital tests within 5 days after presentation, and 2) classified as of probable clinical relevance by physician consensus. Host response profiling led at least two of three physicians to change their diagnostic decisions in 46 of 100 patients. The data suggested possible bacterial DNA translocation in 8 patients who were originally classified by physicians as noninfected and illustrate how host response profiling can guide interpretation of metagenomic shotgun sequencing results.Conclusions The integration of host response profiling, metagenomic shotgun sequencing, and viral capture sequencing enhances the utility of each, and may improve the diagnosis and management of patients with suspected sepsis.

Abstract Background Influenza A results in significant morbidity and mortality. VIR-2482, an engineered human monoclonal antibody with extended half-life, targets a highly conserved epitope on the stem region of influenza A hemagglutinin, and may protect against seasonal and pandemic influenza. Methods This double-blind, randomized, placebo-controlled, phase 2 study examined the safety and efficacy of VIR-2482 for seasonal influenza A illness prevention in unvaccinated healthy adults. Participants (N = 2977) were randomized 1:1:1 to receive VIR-2482 450 mg, VIR-2482 1200 mg, or placebo via intramuscular (IM) injection. Primary and secondary efficacy endpoints were the proportions of participants with reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR)–confirmed influenza A infection and either protocol-defined influenza-like illness (ILI) and Centers for Disease Control and Prevention (CDC)–defined ILI or World Health Organization (WHO)–defined ILI, respectively. Results VIR-2482 450 mg and 1200 mg prophylaxis did not reduce the risk of protocol-defined ILI with RT-PCR–confirmed influenza A versus placebo (relative risk reduction [RRR], 3.8% [95% CI: -67.3, 44.6] and 15.9% [95% CI: -49.3, 52.3], respectively). At the 1200 mg dose, the RRRs in influenza A illness were 57.2% [95% CI: -2.5, 82.2] using CDC-ILI and 44.1% [95% CI: -50.5, 79.3] using WHO-ILI definitions, respectively. Serum VIR-2482 levels were similar regardless of influenza status; variants with reduced VIR-2482 susceptibility were not detected. Local injection-site reactions were mild and similar across groups. Conclusion VIR-2482 1200 mg IM was well tolerated but did not significantly prevent protocol-defined ILI. Secondary endpoint analyses suggest this dose may have reduced influenza A illness.