AB
Anushree Balachandran
Author with expertise in Neuroblastoma Research and Treatment
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
8
h-index:
5
/
i10-index:
4
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
6

Single-cell RNA-sequencing of peripheral neuroblastic tumors reveals an aggressive transitional cell state at the junction of an adrenergic-mesenchymal transdifferentiation trajectory

Xiaojun Yuan et al.May 16, 2020
Abstract Peripheral neuroblastic tumors (PNTs) are the most common extracranial solid tumors in early childhood. They represent a spectrum of neural crest derived tumors including neuroblastoma, ganglioneuroblastoma and ganglioneuroma. PNTs exhibit heterogeneity due to interconverting malignant cell states described as adrenergic/nor-adrenergic or mesenchymal/neural crest cell in origin. The factors determining individual patient levels of tumor heterogeneity, their impact on the malignant phenotype, and the presence of other cell states are unknown. Here, single-cell RNA-sequencing analysis of 4267 cells from 7 PNTs demonstrated extensive transcriptomic heterogeneity. Trajectory modelling showed that malignant neuroblasts move between adrenergic and mesenchymal cell states via a novel state that we termed a “transitional” phenotype. Transitional cells are characterized by gene expression programs linked to a sympathoadrenal development, and aggressive tumor phenotypes such as rapid proliferation and tumor dissemination. Among primary bulk tumor patient cohorts, high expression of the transitional gene signature was highly predictive of poor prognosis when compared to adrenergic and mesenchymal expression patterns. High transitional gene expression in neuroblastoma cell lines identified a similar transitional H3K27-acetylation super-enhancer landscape, supporting the concept that PNTs have phenotypic plasticity and transdifferentiation capacity. Additionally, examination of PNT microenvironments, found that neuroblastomas contained low immune cell infiltration, high levels of non-inflammatory macrophages, and low cytotoxic T lymphocyte levels compared with more benign PNT subtypes. Modeling of cell-cell signaling in the tumor microenvironment predicted specific paracrine effects toward the various subtypes of malignant cells, suggesting further cell-extrinsic influences on malignant cell phenotype. Collectively, our study reveals the presence of a previously unrecognized transitional cell state with high malignant potential and an immune cell architecture which serve both as potential biomarkers and therapeutic targets.
6
Citation8
0
Save
0

Combined inhibition of histone methyltransferases EZH2 and DOT1L is an effective therapy for neuroblastoma

Janith Seneviratne et al.Nov 1, 2024
Abstract Background The child cancer, neuroblastoma (NB), is characterised by a low incidence of mutations and strong oncogenic embryonal driver signals. Many new targeted epigenetic modifier drugs have failed in human trials as monotherapy. Methods We performed a high‐throughput, combination chromatin‐modifier drug screen against NB cells. We screened 13 drug candidates in 78 unique combinations. Results We found that the combination of two histone methyltransferase (HMT) inhibitors: GSK343, targeting EZH2, and SGC0946, targeting DOT1L, demonstrated the strongest synergy across 8 NB cell lines, with low normal fibroblast toxicity. High mRNA expression of both EZH2 and DOT1L in NB tumour samples correlated with the poorest patient survival. Combination HMT inhibitor treatment caused activation of ATF4‐mediated endoplasmic reticulum (ER) stress responses. In addition, glutathione and several amino acids were depleted by HMT inhibitor combination on mass spectrometry analysis. The combination of SGC0946 and GSK343 reduced tumour growth in comparison to single agents. Conclusion Our results support further investigation of HMT inhibitor combinations as a therapeutic approach in NB.