Background : Accumulating sufficient moderate to vigorous physical activity is recognized as a key determinant of physical, physiological, developmental, mental, cognitive, and social health among children and youth (aged 5–17 y). The Global Matrix 3.0 of Report Card grades on physical activity was developed to achieve a better understanding of the global variation in child and youth physical activity and associated supports. Methods : Work groups from 49 countries followed harmonized procedures to develop their Report Cards by grading 10 common indicators using the best available data. The participating countries were divided into 3 categories using the United Nations’ human development index (HDI) classification (low or medium, high, and very high HDI). Results : A total of 490 grades, including 369 letter grades and 121 incomplete grades, were assigned by the 49 work groups. Overall, an average grade of “C-,” “D+,” and “C-” was obtained for the low and medium HDI countries, high HDI countries, and very high HDI countries, respectively. Conclusions : The present study provides rich new evidence showing that the situation regarding the physical activity of children and youth is a concern worldwide. Strategic public investments to implement effective interventions to increase physical activity opportunities are needed.

Abstract International travel played a significant role in the early global spread of SARS-CoV-2. Understanding transmission patterns from different regions of the world will further inform global dynamics of the pandemic. Using data from Dubai in the United Arab Emirates (UAE), a major international travel hub in the Middle East, we establish SARS-CoV-2 full genome sequences from the index and early COVID-19 patients in the UAE. The genome sequences are analysed in the context of virus introductions, chain of transmissions, and possible links to earlier strains from other regions of the world. Phylogenetic analysis showed multiple spatiotemporal introductions of SARS-CoV-2 into the UAE from Asia, Europe, and the Middle East during the early phase of the pandemic. We also provide evidence for early community-based transmission and catalogue new mutations in SARS-CoV-2 strains in the UAE. Our findings contribute to the understanding of the global transmission network of SARS-CoV-2.

Abstract Characterizing key molecular and cellular pathways involved in COVID-19 is essential for disease prognosis and management. We perform shotgun transcriptome sequencing of human RNA obtained from nasopharyngeal swabs of patients with COVID-19, and identify a molecular signature associated with disease severity. Specifically, we identify globally dysregulated immune related pathways, such as cytokine-cytokine receptor signaling, complement and coagulation cascades, JAK-STAT, and TGF-β signaling pathways in all, though to a higher extent in patients with severe symptoms. The excessive release of cytokines and chemokines such as CCL2, CCL22, CXCL9 and CXCL12 and certain interferons and interleukins related genes like IFIH1, IFI44, IFIT1 and IL10 were significantly higher in patients with severe clinical presentation compared to mild and moderate presentations. Moreover, early induction of the TGF-β signaling pathway might be the primary cause of pulmonary fibrosis in patients with severe disease. Differential gene expression analysis identified a small set of regulatory genes that might act as strong predictors of patient outcome. Our data suggest that rapid transcriptome analysis of nasopharyngeal swabs can be a powerful approach to quantify host molecular response and may provide valuable insights into COVID-19 pathophysiology.

Abstract Background With the gradual reopening of economies and resumption of social life, robust surveillance mechanisms should be implemented to control the ongoing COVID-19 pandemic. Unlike RT-qPCR, SARS- C oV-2 W hole G enome S equencing (cWGS) has the added advantage of identifying cryptic origins of the virus, and the extent of community-based transmissions versus new viral introductions, which can in turn influence public health policy decisions. However, practical and cost considerations of cWGS should be addressed before it can be widely implemented. Methods We performed shotgun transcriptome sequencing using RNA extracted from nasopharyngeal swabs of patients with COVID-19, and compared it to targeted SARS-CoV-2 full genome amplification and sequencing with respect to virus detection, scalability, and cost-effectiveness. To track virus origin, we used open-source multiple sequence alignment and phylogenetic tools to compare the assembled SARS-CoV-2 genomes to publicly available sequences. Results We show a significant improvement in whole genome sequencing data quality and viral detection using amplicon-based target enrichment of SARS-CoV-2. With enrichment, more than 99% of the sequencing reads mapped to the viral genome compared to an average of 0.63% without enrichment. Consequently, a dramatic increase in genome coverage was obtained using significantly less sequencing data, enabling higher scalability and significant cost reductions. We also demonstrate how SARS-CoV-2 genome sequences can be used to determine their possible origin through phylogenetic analysis including other viral strains. Conclusions SARS-CoV-2 whole genome sequencing is a practical, cost-effective, and powerful approach for population-based surveillance and control of viral transmission in the next phase of the COVID-19 pandemic.

Global surveillance of physical activity (PA) of children and adolescents with questionnaires is limited by the use of instruments developed in high-income countries (HICs) lacking sociocultural adaptation, especially in low- and middle-income countries (LMICs); under-representation of some PA domains; and omission of active play, an important source of PA. Addressing these limitations would help improve international comparisons, and facilitate the cross-fertilisation of ideas to promote PA. We aim to develop and assess the reliability and validity of the app-based Global Adolescent and Child Physical Activity Questionnaire (GAC-PAQ) among 8-17 years old in 14 LMICs and HICs representing all continents; and generate the 'first available data' on active play in most participating countries.

Abstract Background Spinal muscular atrophy (SMA) is a fatal autosomal recessive disorder for which several treatment options, including a gene therapy, have become available. SMA incidence has not been well-characterized in most Arab countries where rates of consanguinity are high. Understanding SMA disease epidemiology has important implications for screening, prevention, and treatment in those populations. Methods We perform SMA diagnostic testing in a clinical multi-national patient cohort ( N = 171) referred for hypotonia and/or muscle weakness. In addition, we carry out genetic newborn screening for SMA on 1502 healthy Emirati newborns to estimate the carrier frequency and incidence of the disease in the United Arab Emirates. Results Patients referred for SMA genetic testing are mostly Arabs (82%) representing 18 countries. The overall diagnostic yield is 33.9%, which is higher (>50%) for certain nationalities. Most patients (71%) has two SMN2 copies and earlier disease onset. For the first time, we estimate SMA carrier frequency (1.3%) and incidence of the disease (1 in 7122 live births) in the United Arab Emirates. Using birth and marriage rates in two Arab populations (United Arab Emirates and Saudi Arabia), as well as disease incidence in both countries, we show that, besides preventing new cases, premarital genetic screening could potentially result in around $8 to $324 million annual cost savings, respectively, relative to postnatal treatment. Conclusions The SMA carrier frequency and incidence we document suggests high potential benefit for universal implementation of premarital genomic screening for a wide range of recessive disorders in Arab populations.