Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
SC
Siyin Chen
Author with expertise in Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
9
h-index:
6
/
i10-index:
4
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Identification of an HLA-A*11:01-restricted neoepitope of mutant PIK3CA and its specific T cell receptors for cancer immunotherapy targeting hotspot driver mutations

Meiying Shen et al.Jun 4, 2024
Abstract Hotspot driver mutations presented by human leukocyte antigens might be recognized by anti-tumor T cells. Based on their advantages of tumor-specificity and immunogenicity, neoantigens derived from hotspot mutations, such as PIK3CA H1047L , may serve as emerging targets for cancer immunotherapies. NetMHCpan V4.1 was utilized for predicting neoepitopes of PIK3CA hotspot mutation. Using in vitro stimulation, antigen-specific T cells targeting the HLA-A*11:01-restricted PIK3CA mutation were isolated from healthy donor-derived peripheral blood mononuclear cells. T cell receptors (TCRs) were cloned using single-cell PCR and sequencing. Their functionality was assessed through T cell activation markers, cytokine production and cytotoxic response to cancer cell lines pulsed with peptides or transduced genes of mutant PIK3CA . Immunogenic mutant antigens from PIK3CA and their corresponding CD8 + T cells were identified. These PIK3CA mutation-specific CD8 + T cells were subsequently enriched, and their TCRs were isolated. The TCR clones exhibited mutation-specific and HLA-restricted reactivity, demonstrating varying degrees of functional avidity. Identified TCR genes were transferred into CD8 + Jurkat cells and primary T cells deficient of endogenous TCRs. TCR-expressing cells demonstrated specific recognition and reactivity against the PIK3CA H1047L peptide presented by HLA-A*11:01-expressing K562 cells. Furthermore, mutation-specific TCR-T cells demonstrated an elevation in cytokine production and profound cytotoxic effects against HLA-A*11:01 + malignant cell lines harboring PIK3CA H1047L . Our data demonstrate the immunogenicity of an HLA-A*11:01-restricted PIK3CA hotspot mutation and its targeting therapeutic potential, together with promising candidates of TCR-T cell therapy.
0
Citation1
0
Save
0

Identification of novel KRASG12D neoantigen specific TCRs and a strategy to eliminate off-target recognition

Xiaojian Han et al.Jan 17, 2025
T cell receptor (TCR)-engineered T cells targeting neoantigens originated from mutations in KRAS gene have demonstrated promising outcomes in clinical trials against solid tumors. However, the challenge lies in developing tumor-specific TCRs that avoid cross-reactivity with self-antigens to minimize the possibility of severe clinical toxicities. Current research efforts have been put towards strategies to eliminate TCR off-target recognition. Naive T cell repertoire was used for screening KRASG12D-reactive TCRs. Specific TCRs were subsequently identified and their functionality was assessed using TCR Jurkat cells and TCR T cells. Peptide specificity was evaluated using the X-scan assay. To enhance TCR specificity for KRASG12D and reduce their reactivity to self-peptide SMC1A29-38, mammalian TCR display libraries were employed for the design of modification in the complementarity-determining region (CDR). HLA-A*11:01-restricted TCRs targeting the KRASG12D epitope were isolated, and TCR1 was characterized with superior functional avidity and specificity. Alongside a robust recognition of endogenous KRASG12D epitope, this TCR displayed cross-reactivity with the SMC1A29-38 epitope. With an approach utilizing structural-guided mutations in the CDR-1A region of TCR1, we obtained an engineered TCR variant (TCR1a7). Functional characterization of TCR1a7 showed that this TCR not only exhibited enhanced specificity towards KRASG12D, but also demonstrated successful elimination of the off-target recognition of SMC1A29-38. TCRs targeting the KRASG12D peptide could be isolated from naive T cell repertoires. Integrating the TCR-peptide-HLA complex structure with a mammalian TCR library system could serve as a functional strategy to reduce potential TCR cross-reactivity with self-antigens, such as SMC1A29-38. Our findings evidenced an operable method to enhance TCR peptide specificity, while maintaining advanced functional avidity and potent anti-tumor activity.