ST
Shih‐Jen Tsai
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
National Yang Ming Chiao Tung University, Taipei Veterans General Hospital, United States Department of Veterans Affairs
+ 15 more
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
5
h-index:
68
/
i10-index:
453
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Multi-ancestry GWAS of major depression aids locus discovery, fine-mapping, gene prioritisation, and causal inference

Xiangrui Meng et al.Oct 24, 2023
+71
O
G
X
Abstract Most genome-wide association studies (GWAS) of major depression (MD) have been conducted in samples of European ancestry. Here we report a multi-ancestry GWAS of MD, adding data from 21 studies with 88,316 MD cases and 902,757 controls to previously reported data from individuals of European ancestry. This includes samples of African (36% of effective sample size), East Asian (26%) and South Asian (6%) ancestry and Hispanic/Latinx participants (32%). The multi-ancestry GWAS identified 190 significantly associated loci, 53 of them novel. For previously reported loci from GWAS in European ancestry the power-adjusted transferability ratio was 0.6 in the Hispanic/Latinx group and 0.3 in each of the other groups. Fine-mapping benefited from additional sample diversity: the number of credible sets with ≤5 variants increased from 3 to 12. A transcriptome-wide association study identified 354 significantly associated genes, 205 of them novel. Mendelian Randomisation showed a bidirectional relationship with BMI exclusively in samples of European ancestry. This first multi-ancestry GWAS of MD demonstrates the importance of large diverse samples for the identification of target genes and putative mechanisms.
0

Thalamocortical functional connectivity and rapid antidepressant and antisuicidal effects of low-dose ketamine infusion among patients with treatment-resistant depression

Pei‐Chi Tu et al.Sep 12, 2024
+5
T
W
P
Abstract Previous studies have shown an association between the thalamocortical dysconnectivity and treatment-resistant depression (TRD). Whether a single subanesthetic dose of ketamine may change thalamocortical connectivity among patients with TRD is unclear. Whether these changes in thalamocortical connectivity is associated with the antidepressant and antisuicidal effects of ketamine treatment is also unclear. Two resting-state functional MRIs were collected in two clinical trials of 48 patients with TRD (clinical trial 1; 32 receiving ketamine, 16 receiving a normal saline placebo) and 48 patients with TRD and strong suicidal ideation (clinical trial 2; 24 receiving ketamine, 24 receiving midazolam), respectively. All participants underwent rs-fMRI before and 3 days after infusion. Seed-based functional connectivity (FC) was analyzed in the left/right thalamus. FCs between the bilateral thalamus and right middle frontal cortex (BA46) and between the left thalamus and left anterior paracingulate gyrus (BA8) increased among patients in the ketamine group in clinical trials 1 and 2, respectively. FCs between the right thalamus and bilateral frontal pole (BA9) and between the right thalamus and left rostral paracingulate gyrus (BA10) decreased among patients in the ketamine group in clinical trials 1 and 2, respectively. However, the associations between those FC changes and clinical symptom changes did not survive statistical significance after multiple comparison corrections. Whether ketamine-related changes in thalamocortical connectivity may be associated with ketamine’s antidepressant and antisuicidal effects would need further investigation. Clinical trials registration: UMIN Clinical Trials Registry (UMIN-CTR): Registration number: UMIN000016985 and UMIN000033916.
0
Citation1
0
Save
0

Risk of dementia in different types of cancer survivors: A nationwide cohort study

Che‐Sheng Chu et al.Sep 12, 2024
+6
Y
S
C
The association between specific types of malignancies and the subsequent risk of dementia remains unknown.
0
Citation1
0
Save