A new version of ResearchHub is available.Try it now
Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
DU
Daiki Ueno
Author with expertise in Renal Cell Carcinoma
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
14
/
i10-index:
20
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
4

FH variant pathogenicity promotes purine salvage pathway dependence in kidney cancer

Blake Wilde et al.Aug 15, 2022
Abstract The tricarboxylic citric acid cycle enzyme fumarate hydratase (FH) is a tumor suppressor. When lost in cells, its substrate fumarate accumulates to mM levels and drives oncogenic signaling and transformation. Germline alterations lead to an autosomal dominant condition known as hereditary leiomyomatosis and renal cell cancer (HLRCC) where patients are predisposed to various benign tumors and an aggressive form of kidney cancer. FH alterations of unclear significance are frequently observed with germline testing; thus, there is an unmet need to classify FH variants by their cancer-associated risk, allowing for screening, early diagnosis and treatment. Here we quantify catalytic efficiency of 74 FH variants of uncertain significance. Over half were enzymatically inactive which is strong evidence of pathogenicity. We generated a panel of HLRCC cell lines expressing FH variants with a range of catalytic activities, then correlated fumarate levels with metabolic features. We found that fumarate accumulation blocks purine biosynthesis, rendering FH-deficient cells reliant on purine salvage to maintain purine nucleotide pools. Genetic or pharmacologic inhibition of the purine salvage pathway reduced HLRCC tumor growth in vivo . Together, these findings suggest pathogenicity of many patient-associated FH variants and reveal purine salvage as a targetable vulnerability in FH-deficient tumors. Statement of Significance This study functionally characterizes patient-associated FH variants with unknown significance for pathogenicity. This study also reveals nucleotide salvage pathways as a targetable feature of FH-deficient cancers, which are shown to be sensitive to the purine salvage pathway inhibitor 6-mercaptopurine. This presents a new rapidly translatable treatment strategy for FH-deficient cancers.
4
Citation2
0
Save
0

The Optimization of Picking in Logistics Warehouses in the Event of Sudden Picking Order Changes and Picking Route Blockages

Daiki Ueno et al.Aug 21, 2024
(1) Background: This work focuses on improving the efficiency of warehouse operations with the goal of promoting efficiency in the logistics industry and mitigating logistics-related labor shortages. Many factors are involved in warehouse operations, such as the optimal allocation of manpower, the optimal layout design, and the use of automatic guided vehicles, which together affect operational efficiency. (2) Methods: In this work, we developed an optimal method for operating a limited number of workers or picking robots in a specific area, coping with cases of sudden disruptions such as a change in picking order or the blockage of aisles. For this purpose, the number of pickers, the storage capacity, and other constraints such as sudden changes in picking orders during the picking process, as well as blockages in the aisles of a warehouse site, are considered. The total travel distance is minimized using Gurobi, an optimization solver. (3) Results: The picking routes were optimized in three different scenarios using the shortest route between the starting point and the picking points, resulting in up to a 31% efficiency improvement in terms of the total distance traveled. (4) Conclusions: The main contribution of this work is that it focuses on the day-to-day work situations of sudden changes in the picking order and the presence of route blocks in real-world logistics warehouse sites. It demonstrates the feasibility of responding to sudden disruptions and simultaneously optimizing picking routes in real time. This work contributes to the overall efficiency of logistics by providing a simple, yet practical, data-driven solution for the optimization of warehouse operations.
0

Tissue factor pathway inhibitor 2 (TFPI2) is a potential serum biomarker for clear cell renal carcinoma

Hiroki Ito et al.Nov 19, 2024
Renal and ovarian clear cell carcinoma (CCC) are both characterized by a clear cytoplasm and exhibit similar genomic alterations and clinical characteristics. We hypothesized that both CCCs may share clinical biomarker. Tissue factor pathway inhibitor 2 (TFPI2), a serine protease inhibitor, has emerged as a promising serum biomarker for ovarian CCC, and we evaluated the efficacy of TFPI2 as a biomarker for renal cell carcinoma (RCC). Serum samples were collected from patients with RCC and healthy volunteers, and TFPI2 levels were measured. Expression of TFPI2 in each cell type was evaluated using single-cell RNA sequencing. Survival analyses according to TFPI2 expression levels were performed based on publicly available databases. Serum TFPI2 was significantly elevated in patients with RCC compared to healthy volunteers, particularly those with clear cell histology. Metastatic RCC tumors exhibited higher TFPI2 than localized RCCs. Moreover, higher TFPI2 correlated with higher Fuhrman grades in clear cell RCC. Publicly available databases showed an association between TFPI2 expression and overall survival, particularly in clear cell RCC. Single-cell RNA sequencing confirmed TFPI2 expression in clear cell RCC and normal kidney tubular epithelial cells. TFPI2 has emerged as a potential serum biomarker for RCC, offering avenues for improved detection and prognostication.