PK
Patrick Kehoe
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
University of Bristol, Southmead Hospital, Ljubljana University Medical Centre
+ 9 more
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(71% Open Access)
Cited by:
162
h-index:
66
/
i10-index:
204
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
5

Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores

Itziar Rojas et al.Jun 7, 2021
+293
N
S
I
Genetic discoveries of Alzheimer's disease are the drivers of our understanding, and together with polygenetic risk stratification can contribute towards planning of feasible and efficient preventive and curative clinical trials. We first perform a large genetic association study by merging all available case-control datasets and by-proxy study results (discovery n = 409,435 and validation size n = 58,190). Here, we add six variants associated with Alzheimer's disease risk (near APP, CHRNE, PRKD3/NDUFAF7, PLCG2 and two exonic variants in the SHARPIN gene). Assessment of the polygenic risk score and stratifying by APOE reveal a 4 to 5.5 years difference in median age at onset of Alzheimer's disease patients in APOE ɛ4 carriers. Because of this study, the underlying mechanisms of APP can be studied to refine the amyloid cascade and the polygenic risk score provides a tool to select individuals at high risk of Alzheimer's disease.
2

A meta-analysis of genome-wide association studies identifies new genetic loci associated with all-cause and vascular dementia

Bernard Fongang et al.Oct 24, 2023
+41
X
M
B
ABSTRACT Dementia is multifactorial with Alzheimer (AD) and vascular (VaD) pathologies making the largest contributions. Genome-wide association studies (GWAS) have identified over 70 genetic risk loci for AD but the genomic determinants of other dementias, including VaD remain understudied. We hypothesize that common forms of dementia will share genetic risk factors and conducted the largest GWAS to date of “all-cause dementia” (ACD) and examined the genetic overlap with VaD. Our dataset includes 809,299 individuals from European, African, Asian, and Hispanic ancestries with 46,902 and 8,702 cases of ACD and VaD, respectively. We replicated known AD loci at genome-wide significance for both ACD and VaD and conducted bioinformatic analyses to prioritize genes that are likely functionally relevant, and shared with closely related traits and risk factors. For ACD, novel loci identified were associated with energy transport ( SEMA4D ), neuronal excitability ( ANO3 ), amyloid deposition in the brain ( RBFOX1 ), and MRI markers of small vessel disease ( HBEGF ). Novel VaD loci were associated with hypertension, diabetes, and neuron maintenance ( SPRY2, FOXA2, AJAP1 , and PSMA3 ). Our study identified genetic risks underlying all-cause dementia, demonstrating overlap with neurodegenerative processes, vascular risk factors (Type-II diabetes, blood pressure, lipid) and cerebral small vessel disease. These novel insights could lead to new prevention and treatment strategies for all dementias.
0

Decentralized clinical trials for medications to reduce the risk of dementia: Consensus report and guidance

Leanne Howard et al.Sep 6, 2024
+13
E
C
L
Recent growth in the functionality and use of technology has prompted an increased interest in the potential for remote or decentralized clinical trials in dementia. There are many potential benefits associated with decentralized medication trials, but we currently lack specific recommendations for their delivery in the dementia field.
0
Citation1
0
Save
1

Author Correction: Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores

Itziar Rojas et al.Nov 25, 2023
+290
N
S
I
4

Small RNA modifications in Alzheimer’s disease

Xudong Zhang et al.Oct 24, 2023
+5
L
F
X
Abstract Background While significant advances have been made in uncovering the aetiology of Alzheimer’s disease and related dementias at the genetic level, molecular events at the epigenetic level remain largely undefined. Emerging evidence indicates that small non-coding RNAs (sncRNAs) and their associated RNA modifications are important regulators of complex physiological and pathological processes, including aging, stress responses, and epigenetic inheritance. However, whether small RNAs and their modifications are altered in dementia is not known. Methods We performed LC-MS/MS–based, high-throughput assays of small RNA modifications in post-mortem samples of the prefrontal lobe cortices of Alzheimer’s disease (AD) and control individuals. We noted that some of the AD patients has co-occurring vascular cognitive impairment-related pathology (VaD). Findings We report altered small RNA modifications in AD samples compared with normal controls. The 15–25-nucleotide (nt) RNA fraction of these samples was enriched for microRNAs, whereas the 30–40-nt RNA fraction was enriched for tRNA-derived small RNAs (tsRNAs), rRNA-derived small RNAs (rsRNAs), and YRNA-derived small RNAs (ysRNAs). Interestingly, most of these altered RNA modifications were detected both in the AD and AD with co-occurring vascular dementia subjects. In addition, sequencing of small RNA in the 30–40-nt fraction from AD cortices revealed reductions in rsRNA-5S, tsRNA-Tyr, and tsRNA-Arg. Interpretation These data suggest that sncRNAs and their associated modifications are novel signals that may be linked to the pathogenesis and development of Alzheimer’s disease. Funding NIH grants (R01HL122770, R01HL091905, 1P20GM130459, R01HD092431, P50HD098593, GM103440), AHA grant (17IRG33370128), Sigmund Gestetner Foundation Fellowship to P Kehoe. Research in Context Evidence before this study Alzheimer’s disease (AD) and vascular dementia (VaD) are marked by cognitive impairment and neuropathologies caused by significant neuronal death. Associated gene mutations are rare in subjects with dementia, and the aetiology of these diseases is still not completely understood. Recent emerging evidence suggests that epigenetic changes are risk factors for the development of dementia. However, studies assessing small RNA modifications—one of the features of epigenetics—in dementia are lacking. Added value of this study We used high-throughput liquid chromatography-tandem mass spectrometry and small RNA sequencing to profile small RNA modifications and the composition of small RNAs in post-mortem samples of the prefrontal cortex of AD and control subjects. We detected and quantified 16 types of RNA modifications and identified distinct small non-coding RNAs and modification signatures in AD subjects compared with controls. Implications of all the available evidence This study identified novel types and compositions of small RNA modifications in the prefrontal cortex of AD patients compared with control subjects in post-mortem samples. The cellular locations of these RNA modifications and whether they are drivers or outcomes of AD are still not known. However, results from the present study may open new possibilities for dissecting the dementia pathology.
4
0
Save
2

Repurposing antihypertensive drugs for the prevention of Alzheimer’s disease: a Mendelian Randomization study

Venexia Walker et al.May 7, 2020
N
R
P
V
Background Evidence concerning the potential repurposing of antihypertensives for Alzheimer’s disease prevention is inconclusive. We used Mendelian randomization, which can be more robust to confounding by indication and patient characteristics, to investigate the effects of lowering systolic blood pressure (SBP), via different antihypertensive drug classes, on Alzheimer’s disease.Methods We used summary statistics from genome wide association studies of SBP (from UK Biobank) and Alzheimer’s disease (from the International Genomics of Alzheimer’s Project) in a two-sample Mendelian randomization analysis. We identified single nucleotide polymorphisms (SNPs) that mimic the action of antihypertensive targets and estimated the effect of lowering SBP, via antihypertensive drug classes, on Alzheimer’s disease. We also report the effect of lowering SBP on Alzheimer’s disease by combining all drug targets and without consideration of the associated drugs.Results There was limited evidence that lowering SBP, via antihypertensive drug classes, affected Alzheimer’s disease risk. For example, calcium channel blockers had an odds ratio (OR) per 10mmHg lower SBP of 1.53 (95% confidence interval (CI): 0.94 to 2.49; p=0.09; SNPs=17). We also found limited evidence for an effect of lowering SBP on Alzheimer’s disease when combining all drug targets (OR per 10mmHg lower SBP: 1.14; 95%CI: 0.83 to 1.56; p=0.41; SNPs=59) and without consideration of the associated drug targets (OR per 10mmHg lower SBP: 1.04; 95%CI: 0.95 to 1.13; p=0.45; SNPs=153).Conclusions Lowering SBP itself is unlikely to affect risk of developing Alzheimer’s disease. Consequently, if specific antihypertensive drug classes do affect risk of Alzheimer’s disease, they are unlikely to do so via SBP.KEY MESSAGES
0

Comparison of antihypertensive drug classes for dementia prevention

Venexia Walker et al.May 7, 2020
P
R
N
V
Introduction: There is evidence that hypertension in midlife can increase the risk of Alzheimer's disease and vascular dementia in late life. In addition, some treatments for hypertension have been proposed to have cognitive benefits, independent of their effect on hypertension. Consequently, there is potential to repurpose treatments for hypertension for dementia. This study systematically compared seven antihypertensive drug classes for this purpose, using data on over 849,000 patients from the Clinical Practice Research Datalink. Methods: Treatments for hypertension were assessed in an instrumental variable (IV) analysis to address potential confounding and reverse causation. Physicians' prescribing preference was used as a categorical instrument, defined by the physicians' last seven prescriptions. Participants were new antihypertensive users between 1996-2016, aged 40 and over. Findings: We analysed 849,378 patients with total follow up of 5,497,266 patient-years. Beta-adrenoceptor blockers and vasodilator antihypertensives were found to confer small protective effects - for example, vasodilator antihypertensives resulted in 27 (95% CI: 17 to 38; p=4.4e-7) fewer cases of any dementia per 1000 treated compared with diuretics. Interpretation: We found small differences in antihypertensive drug class effects on risk of dementia outcomes. However, we show the magnitude of the differences between drug classes is smaller than previously reported. Future research should look to implement other causal analysis methods to address biases in conventional observational research with the ultimate aim of triangulating the evidence concerning this hypothesis. Funding: This work was supported by the Perros Trust and the Integrative Epidemiology Unit. The Integrative Epidemiology Unit is supported by the Medical Research Council and the University of Bristol [grant number MC_UU_00011/1, MC_UU_00011/3].