RK
Rüdiger Klapdor
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(100% Open Access)
Cited by:
12
h-index:
19
/
i10-index:
34
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
38

Combining genome-wide studies of breast, prostate, ovarian and endometrial cancers maps cross-cancer susceptibility loci and identifies new genetic associations

Siddhartha Kar et al.Jun 19, 2020
ABSTRACT We report a meta-analysis of breast, prostate, ovarian, and endometrial cancer genome-wide association data (effective sample size: 237,483 cases/317,006 controls). This identified 465 independent lead variants ( P <5×10 −8 ) across 192 genomic regions. Four lead variants were >1Mb from previously identified risk loci for the four cancers and an additional 23 lead variant-cancer associations were novel for one of the cancers. Bayesian models supported pleiotropic effects involving at least two cancers at 222/465 lead variants in 118/192 regions. Gene-level association analysis identified 13 shared susceptibility genes ( P <2.6×10 −6 ) in 13 regions not previously implicated in any of the four cancers and not uncovered by our variant-level meta-analysis. Several lead variants had opposite effects across cancers, including a cluster of such variants in the TP53 pathway. Fifty-four lead variants were associated with blood cell traits and suggested genetic overlaps with clonal hematopoiesis. Our study highlights the remarkable pervasiveness of pleiotropy across hormone-related cancers, further illuminating their shared genetic and mechanistic origins at variant- and gene-level resolution.
38
Citation6
0
Save
0

Pleiotropy-guided transcriptome imputation from normal and tumor tissues identifies new candidate susceptibility genes for breast and ovarian cancer

Siddhartha Kar et al.Apr 24, 2020
Abstract Familial, genome-wide association (GWAS), and sequencing studies and genetic correlation analyses have progressively unraveled the shared or pleiotropic germline genetics of breast and ovarian cancer. In this study, we aimed to leverage this shared germline genetics to improve the power of transcriptome-wide association studies (TWAS) to identify candidate breast cancer and ovarian cancer susceptibility genes. We built gene expression prediction models using the PrediXcan method in 681 breast and 295 ovarian tumors from The Cancer Genome Atlas and 211 breast and 99 ovarian normal tissue samples from the Genotype-Tissue Expression project and integrated these with GWAS meta-analysis data from the Breast Cancer Association Consortium (122,977 cases/105,974 controls) and the Ovarian Cancer Association Consortium (22,406 cases/40,941 controls). The integration was achieved through novel application of a pleiotropy-guided conditional/conjunction false discovery rate approach for the first time in the setting of a TWAS. This identified 14 new candidate breast cancer susceptibility genes spanning 11 genomic regions and 8 new candidate ovarian cancer susceptibility genes spanning 5 genomic regions at conjunction FDR < 0.05 that were > 1 Mb away from known breast and/or ovarian cancer susceptibility loci. We also identified 38 candidate breast cancer susceptibility genes and 17 candidate ovarian cancer susceptibility genes at conjunction FDR < 0.05 at known breast and/or ovarian susceptibility loci. Overlaying candidate causal risk variants identified by GWAS fine mapping onto expression prediction models for genes at known loci suggested that the association for 55% of these genes was driven by the underlying GWAS signal. Significance The 22 new genes identified by our cross-cancer analysis represent promising candidates that further elucidate the role of the transcriptome in mediating germline breast and ovarian cancer risk.
0
Citation5
0
Save
0

Effect of mother’s active pushing at cesarean delivery: a randomized controlled trial

Ahmed Sayed et al.Nov 27, 2024
Abstract Objective This study aimed to evaluate the effect of maternal active pushing during cesarean section (CS) on postoperative pain, intraoperative discomfort, and the mother’s sense of control and participation. Design A prospective, randomized controlled study. Methods Patients were randomly assigned into two groups. In the Conventional group ( n = 45), the CS was performed traditionally without maternal pushing. In the Assisted group ( n = 55), patients were instructed to push during delivery. Outcomes measures included patients’ perceived pressure, pain, and sense of participation. Breastfeeding and postnatal depression were assessed using validated scales, along with maternal and neonatal outcomes, surgeon satisfaction, and operation duration. Results Patients in the Assisted group reported significantly lower fundal pressure intensity (VAS score 3 vs. 5, P < 0.01) compared to the Conventional group. There was no significant difference in postoperative pain. However, women in the Assisted group reported a greater sense of participation (6 vs. 0, P < 0.01) and control (4 vs. 0, P < 0.05) than those in the Conventional group. No significant maternal or neonatal complications were observed. Conclusion Maternal active pushing during CS positively impacted intraoperative experience by reducing perceived pressure and enhancing the sense of control and participation, without adverse effects on maternal or neonatal outcomes. These findings support further research with larger, multi-center studies to validate the potential benefits of this approach. Trial Registration NCT05520580 ( https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT05520580 ).
0

Adhesion Prevention in Gynecologic Surgery: Guidance and Clinical Experience

İbrahim Alkatout et al.Dec 10, 2024
Postoperative adhesions represent a major medical challenge and are associated with serious health and economic consequences. 4DryField® PH (PlantTec Medical GmbH, Lueneburg, Germany) is a starch-based medical device designed both to prevent adhesions and for hemostasis. This paper explores methods to successfully apply it in gynecological surgery, leveraging the authors’ extensive clinical experience. We provide detailed insights into best practices that benefit most patients with conditions such as endometriosis, along with practical tips and guidance on optimizing application and dosage. Our real-world clinical experience across various indications, supported by published data, demonstrates significant patient benefits: reduced adhesion formation, better recovery, less pain, and improved fertility. Patient acceptance and satisfaction are notably high. The device can be applied to surgical wounds as a powder for hemostasis and transformed into a gel in situ or as a premixed gel when adhesion prevention is prioritized. Specific advantages for each method are demonstrated by case studies. When used correctly, 4DryField PH is safe and effective, especially for larger wound areas with a high risk of reoperation and adhesion formation and when pregnancy is desired. It offers great versatility due to its use as either in situ gel or premixed gel with different viscosities. Despite some remaining gaps in clinical evidence and ongoing studies, our personal clinical experience suggests significant benefits with minimal risks. Therefore, we have no concerns regarding the broad use of 4DryField PH in gynecology and other surgical disciplines. Future research should focus on patient-reported outcomes and health economic benefits to support reimbursement efforts.