Here we report the genome sequence of the honeybee Apis mellifera, a key model for social behaviour and essential to global ecology through pollination. Compared with other sequenced insect genomes, the A. mellifera genome has high A+T and CpG contents, lacks major transposon families, evolves more slowly, and is more similar to vertebrates for circadian rhythm, RNA interference and DNA methylation genes, among others. Furthermore, A. mellifera has fewer genes for innate immunity, detoxification enzymes, cuticle-forming proteins and gustatory receptors, more genes for odorant receptors, and novel genes for nectar and pollen utilization, consistent with its ecology and social organization. Compared to Drosophila, genes in early developmental pathways differ in Apis, whereas similarities exist for functions that differ markedly, such as sex determination, brain function and behaviour. Population genetics suggests a novel African origin for the species A. mellifera and insights into whether Africanized bees spread throughout the New World via hybridization or displacement.

Abstract Programmed death-1 (PD-1) is an immunoinhibitory receptor expressed on exhausted T cells during chronic illness. Interaction of PD-1 with its ligand PD-ligand 1 (PD-L1) delivers inhibitory signals and impairs proliferation, cytokine production, and cytotoxicity of T cells. We reported that the PD-1/PD-L1 pathway is closely associated with T-cell exhaustion and disease progression in bovine chronic infections and canine tumors. Moreover, we found that blocking antibodies targeting PD-1 and PD-L1 restore T-cell functions and may be used in immunotherapy in cattle and dogs. However, the immunological role of the PD-1/PD-L1 pathway remains unclear for chronic equine diseases, including tumors. In this study, we identified nucleotide sequences of equine PD-1 (EqPD-1) and PD-L1 (EqPD-L1) and investigated the role of anti-bovine PD-L1 monoclonal antibodies (mAbs) against EqPD-L1 using in vitro assays. We also evaluated the expression of PD-L1 in tumor tissues of equine malignant melanoma (EMM). The amino acid sequences of EqPD-1 and EqPD-L1 share a high identity and similarity with homologs from other mammalian species. Two clones of the anti-bovine PD-L1 mAbs recognized EqPD-L1 in flow cytometry, and one of these cross-reactive mAbs blocked the binding of equine PD-1/PD-L1. Importantly, PD-L1 expression was confirmed in EMM tumor tissues by immunohistochemistry. A cultivation assay revealed that PD-L1 blockade enhanced the production of Th1 cytokines in equine immune cells. These results suggest that our anti-PD-L1 mAbs may be useful for investigating the expression and role of the equine PD-1/PD-L1 pathway. Further research is required to discover the immunological role of PD-1/PD-L1 in chronic equine diseases and elucidate a future application in immunotherapy for horse.

Abstract Bovine leukemia virus (BLV), a retrovirus, infects into B cells of ruminants and causes aggressive leukemia or lymphoma in cattle, enzootic bovine leukosis (EBL). Clonal expansion of BLV-infected cells is a promising marker for early detection and diagnosis of EBL. Recently, we developed rapid amplification of the integration site without interference by genomic DNA contamination (RAISING) and CLOVA, a software to analyze clonality. RAISING-CLOVA could assess the risk of adult T-cell leukemia/lymphoma development in human T-cell leukemia virus-I-infected individuals through its clonality analysis. Thus, we herein examined the performance of RAISING-CLOVA for the clonality analysis of BLV-infected cells and conducted a comprehensive clonality analysis by RAISING-CLOVA in EBL and non-EBL cattle. RAISING-CLOVA successfully distinguished EBL from non-EBL cattle with high sensitivity and specificity. A longitudinal clonality analysis in BLV-infected sheep, an EBL model, also confirmed the effectiveness of BLV clonality analysis with RAISING-CLOVA for early detection of EBL development. Therefore, our study emphasizes the usefulness of RAISING-CLOVA as a routine clinical test for monitoring virus-related cancers.

Hemophilia B is an inherited hemorrhagic disorder characterized by a deficiency of blood coagulation factor IX (FIX) that results in abnormal blood coagulation. The blood coagulation is already evident in hemophiliacs at the fetal stage, and thus intracranial hemorrhage and other bleeding complications can occur at birth, leading to sequelae. Therefore, it is important to develop effective treatments for hemophiliacs in utero. In this study, in order to transplacentally deliver FIX from pregnant mice to their fetuses, an improved adenovirus (Ad) vector expressing human FIX fused with the IgG Fc domain (FIX Fc fusion protein), which plays a crucial role in neonatal Fc receptor (FcRn)-mediated transcytosis across the placenta, was intravenously administered to E13.5 pregnant mice. Significant levels of FIX Fc fusion protein were detected in 0-day-old newborn mice whose mothers were administered an Ad vector expressing FIX Fc fusion protein. Wild-type FIX overexpressed in the pregnant mice was not delivered to the fetuses. Plasma FIX levels in the newborn mice were relatively well correlated with those in their mothers, although transplacental delivery efficiencies of FIX Fc fusion protein were slightly reduced when the FIX Fc fusion protein was highly expressed in the mother mice. Plasma FIX levels in the newborn mice were about 3.6-6.4% of those in their mothers, Transplacental delivery of FIX Fc fusion protein to their fetuses successfully improved the blood clotting ability in the newborn mice.

Motivation: Fat signal suppression is essential for breast DWI as the very low diffusion coefficient of fat tends to decrease ADC values. STIR is a popular method, but signal suppression/attenuation is not specific to fat. Goal(s): To show how ADC values obtained with STIR DWI may be biased toward tissue components with long T1s. Approach: Results were obtained from simulations and data acquired in a dedicated breast DWI phantom made of vials with water and various concentration of PVP. Results: ADC values obtained with STIR fat suppression may be over/under estimated depending on the T1 and ADC profile within tissues. Impact: Fat suppression is essential for DWI. Among techniques STIR leads to low SNR and ADC misestimation depending on the tissues T1/ADC content, as STIR signal attenuation is not specific to fat. Other methods should be preferred, such as SPAIR.

Poultry red mites (PRMs, Dermanyssus gallinae), tropical fowl mites (TFMs, Ornithonyssus bursa), and northern fowl mites (NFMs, Ornithonyssus sylviarum) are hematophagous mites that are distributed worldwide which pose a serious challenge to the poultry industry and negatively impact poultry production and welfare. Vaccines represent a promising approach for controlling avian mites, and the identification of antigens with broad efficacy against multiple avian mite species is advantageous for vaccine control. This study aimed to identify histamine release factor (HRF), which was previously reported as a candidate vaccine antigen against PRMs, from TFMs and NFMs and to analyze its cross-reactivity and acaricidal effects on different avian mite species. The deduced amino acid sequences of the HRFs identified in the TFMs and NFMs were highly homologous to those of the PRMs. We generated recombinant HRF (rHRF) of TFMs, NFMs, and PRMs, and immune plasma against each rHRF was produced by immunization with each antigen. The immune plasma contained antibodies specific to each antigen and showed cross-reactivity with rHRFs from different avian mites. Moreover, PRM nymphs (protonymphs) artificially fed each immune plasma showed higher mortality rates than those fed the control plasma. These results suggest that HRFs can be used as candidate antigens for a universal vaccine with broad efficacy across avian mites.