ABSTRACT Genome-wide association studies have identified breast cancer risk variants in over 150 genomic regions, but the mechanisms underlying risk remain largely unknown. These regions were explored by combining association analysis with in silico genomic feature annotations. We defined 205 independent risk-associated signals with the set of credible causal variants (CCVs) in each one. In parallel, we used a Bayesian approach (PAINTOR) that combines genetic association, linkage disequilibrium, and enriched genomic features to determine variants with high posterior probabilities (HPPs) of being causal. Potentially causal variants were significantly over-represented in active gene regulatory regions and transcription factor binding sites. We applied our INQUSIT pipeline for prioritizing genes as targets of potentially causal variants, using gene expression (eQTL), chromatin interaction and functional annotations. Known cancer drivers, transcription factors and genes in the developmental, apoptosis, immune system and DNA integrity checkpoint gene ontology pathways, were over-represented among the 178 highest confidence target genes.

Abstract Background Genome-wide association studies (GWAS) have identified multiple common breast cancer susceptibility variants. Many of these variants have differential associations by estrogen receptor (ER), but how these variants relate with other tumor features and intrinsic molecular subtypes is unclear. Methods Among 106,571 invasive breast cancer cases and 95,762 controls of European ancestry with data on 173 breast cancer variants identified in previous GWAS, we used novel two-stage polytomous logistic regression models to evaluate variants in relation to multiple tumor features (ER, progesterone receptor (PR), human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) and grade) adjusting for each other, and to intrinsic-like subtypes. Results Eighty-five of 173 variants were associated with at least one tumor feature (false discovery rate <5%), most commonly ER and grade, followed by PR and HER2. Models for intrinsic-like subtypes found nearly all of these variants (83 of 85) associated at P<0.05 with risk for at least one luminal-like subtype, and approximately half (41 of 85) of the variants were associated with risk of at least one non-luminal subtype, including 32 variants associated with triple-negative (TN) disease. Ten variants were associated with risk of all subtypes in different magnitude. Five variants were associated with risk of luminal A-like and TN subtypes in opposite directions. Conclusion This report demonstrates a high level of complexity in the etiology heterogeneity of breast cancer susceptibility variants and can inform investigations of subtype-specific risk prediction.

Background: This study aims to determine whether employees of an oil and gas company in Shaanxi, China, are associated with a higher prevalence of hypertension compared to the general population's age and geographical region. Methods:Cross-sectional study is used.Participants with hypertension who fulfilled at least one of the criteria: (1) systolic blood pressure ≥140 mm Hg; (2) diastolic blood pressure ≥90 mm Hg; (3) self-reported use of antihypertensive medication in the past two weeks; or (4) self-reported history of hypertension.Result: Compared to the general population, the employees were young, with a higher proportion of men having a higher body mass index and were more likely to be alcoholics and smokers.Before propensity score matching, the prevalence of hypertension was slightly lower in the employees compared to that of the general population.After matching, overall, the employees were more likely to have hypertension compared to the general population.Gender-based subgroup analysis showed that male employees had a higher prevalence of hypertension, while the female employees had a lower prevalence of hypertension compared to the general population. Conclusion:The research results show that compared with the general population, male oilfield employees are more prone to hypertension.This finding potentially has implications for the subsequent designating of preventative modalities.Specifically, policies concerning the prevention, treatment, and control of hypertension, as well as health management in the oil and gas companies should be formulated differently for male and female workers and be more focused on males and front-line workers.