VS
V. Sood
Author with expertise in Cultivar Evaluation and Mega-Environment Investigation
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(43% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
7
/
i10-index:
7
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Comprehensive Assessment of Genetic Variability and Selection Strategies in Oat Germplasm for Improved Fodder and Seed Yield in N-W Himalayan Mid-hill Environments

Rajni Devi et al.Jul 18, 2024
Background: Oat is an important dual purpose annual cereal crop with high adaptability and enhanced nutritional value. Expanding population and squeezing arable land has led to competition for utilization of land for food grains and fodder which necessitates intensified efforts toward more efficient forage production. Hence studying genetic variability in oats becomes crucial for selection of resilient genotypes with traits tailored for resilience and high yield by ensuring crop productivity in varying environmental conditions. Methods: A total of 121 oat germplasm lines were evaluated for sixteen traits using simple lattice design for three years to study genetic variability, trait inter-relationships and conduct principal component and cluster analyses. Result: Substantial genetic variability was observed for fodder yield and component traits. High coefficients of variation for flag leaf area alongwith its high heritability and genetic advance, underscore its suitability for selection while, moderate GA for tillers per plant and 1000-seed weight, suggested hybridization coupled with selection. Fodder yield displayed significant and positive correlations with multiple traits suggesting effective selection. Path coefficient and principal component analysis identified days to 50% flowering, plant height, leaves per plant, biological and seed yield, dry matter and crude protein yield as optimal selection indices for enhancing fodder yield. Cross-breeding among diverse genotypes from specific clusters within the evaluated panel offers promising avenues for future oat breeding and yield improvement programmes.
0

High accuracy DNA sequencing on a small, scalable platform via electrical detection of single base incorporations

Hesaam Esfandyarpour et al.Apr 16, 2019
High throughput DNA sequencing technologies have undergone tremendous development over the past decade. Although optical detection-based sequencing has constituted the majority of data output, it requires a large capital investment and aggregation of samples to achieve optimal cost per sample. We have developed a novel electronic detection-based platform capable of accurately detecting single base incorporations. The GenapSys technology with its electronic detection modality allows the system to be compact, accessible, and affordable. We demonstrate the performance of the system by sequencing several different microbial genomes with varying GC content. The platform is capable of generating 1.5 Gb of high-quality nucleic acid sequence in a single run. We routinely generate sequence data that exceeds 99% raw accuracy with read lengths of up to 175 bp. The utility of the platform is highlighted by targeted sequencing of the human genome. We show high concordance of SNP detection on the human NA12878 HapMap cell line with data generated on the Illumina sequencing platform. In addition, we sequenced a targeted panel of cancer-associated genes in a well characterized reference standard. With multiple library preparation approaches on this sample, we were able to identify low frequency mutations at expected allele frequencies.