Abstract The combined actions of climatic variations and landscape barriers shape the history of natural populations. When organisms follow their shifting niches, obstacles in the landscape can lead to the splitting of populations, on which evolution will then act independently. When two such populations are reunited, secondary contact occurs in a broad range of admixture patterns, from narrow hybrid zones to the complete dissolution of lineages. A previous study suggested that barn owls colonized the Western Palearctic after the last glaciation in a ring-like fashion around the Mediterranean Sea, and conjectured an admixture zone in the Balkans. Here, we take advantage of whole-genome sequences of 94 individuals across the Western Palearctic to reveal the complex history of the species in the region using observational and modeling approaches. Even though our results confirm that two distinct lineages colonized the region, one in Europe and one in the Levant, they suggest that it predates the last glaciation and identify a narrow secondary contact zone between the two in Anatolia. Nonetheless, we also show that barn owls re-colonized Europe after the glaciation from two distinct glacial refugia: a western one in Iberia and an eastern one in Italy. Both glacial lineages now communicate via eastern Europe, in a wide and permeable contact zone. This complex history of populations enlightens the taxonomy of Tyto alba in the region, highlights the key role played by mountain ranges and large water bodies as barriers and illustrates the power of population genomics in uncovering intricate demographic patterns.

ABSTRACT The global breeding population of Eleonora’s falcon is distributed from the Canary Islands in the west, across the Mediterranean Sea, to Cyprus in the east. The remoteness of nesting colonies, which are predominantly located on sea cliffs and islets, renders breeding success estimation a challenging task, requiring a composite approach to assess each of the breeding stages. Early estimates of the breeding success of Eleonora’s falcon suggested that Akrotiri colony in Cyprus had the lowest breeding success among all the colonies throughout the species’ breeding range, at a level seemingly unsustainable, suggesting the colony might have been in danger of gradual extinction. Here we use a diversity of survey methods using boat, ground and aerial surveys, with the incorporation of photography and photogrammetry, to reassess the breeding success and the effect of nest characteristics on the Eleonora’s falcon breeding population in Cyprus. During a six-year study, we found that Cyprus hosts ~138 ± 8 breeding pairs and that breeding success equals 1.54 ± 0.85 fledglings per breeding pair, thus considerably higher than previous estimates. In addition, by analyzing temporal variation in breeding and nest characteristics, we found that early breeding and reuse of nests positively influence breeding success, but physical nest characteristics have a limited effect on colony productivity. The range of survey methods employed, as well as the array of photography techniques utilized, highly enhanced the efficiency and accuracy of this study, allowing us to overcome the challenge of inaccessibility of nesting cliffs.

Abstract The study of insular populations was key in the development of evolutionary theory. The successful colonisation of an island depends on the geographic context, and specific characteristics of the organism and the island, but also on stochastic processes. As a result, apparently identical islands may harbour populations with contrasting histories. Here, we use whole genome sequences of 65 barn owls to investigate the patterns of inbreeding and genetic diversity of insular populations in the eastern Mediterranean Sea. We focus on Crete and Cyprus, islands with similar size, climate and distance to mainland, that provide natural replicates for a comparative analysis of the impacts of microevolutionary processes on isolated populations. We show that barn owl populations from each island have a separate origin, Crete being genetically more similar to other Greek islands and mainland Greece, and Cyprus more similar to the Levant. Further, our data show that their respective demographic histories following colonisation were also distinct. On the one hand, Crete harbours a small population and maintains very low levels of gene flow with neighbouring populations. This has resulted in low genetic diversity, strong genetic drift, increased relatedness in the population and remote inbreeding. Cyprus, on the other hand, appears to maintain enough gene flow with the mainland to avoid such an outcome. Our work provides a comparative population genomic analysis of the effects of neutral processes on a classical island-mainland model system. It provides empirical evidence for the role of stochastic processes in determining the fate of diverging isolated populations.

Abstract Biodiversity monitoring plays an essential role in tracking changes in ecosystems, species distributions and abundances across the globe. Data collected through both structured and unstructured biodiversity recording can inform conservation measures designed to reduce, prevent, and reverse declines in valued biodiversity of many types. However, resources for biodiversity monitoring are limited, it is therefore important that funding bodies prioritise actions relative to the requirements in any given region. We addressed this prioritisation requirement through a three-stage process of expert-elicitation, resulting in a prioritised list of twenty biodiversity monitoring needs for Cyprus. Equal priority was assigned to the twenty monitoring needs within three categories: a top nine, a middle five, and a bottom six. The most highly prioritised biodiversity monitoring needs were those related to the development of robust methodologies, and those ensuring a geographic spread of sufficiently skilled and informed contributors. We suggest ways that the results of our expert-elicitation process could be used to support current and future biodiversity monitoring in Cyprus.