Zika virus (ZIKV), belongs to the flavivirus genus and Flaviviridae family that associated with serious diseased conditions like microcephaly and other neurological disorders (Guillan–Barré syndrome). As there is no vaccine or therapies available against ZIKV to date. Hence, it is an unmet need to find potential drug candidates and target sites against Zika virus infection. NS2B-NS3 protease making an attractive target for therapeutic intervention in ZIKV infections because of its critical role in hydrolysis of a single polyprotein encoded by Zika virus. Recently, there are some experimental evidence about the flavonoids as Zika virus NS2B-NS3 protease inhibitors. However, molecular interaction between protease complex and inhibitors at atomic levels has not been explored. Here, we have taken the experimentally validated thirty-eight flavonoids inhibitors against NS2B-NS3 protease to examine the molecular interaction using molecular docking and molecular dynamics simulations. We found out few flavonoids such as EGCG and its two derivatives, isoquercetin, rutin and sanggenon O showing interaction with catalytic triad (His51, Asp75, and Ser135) of the active site of NS2B-NS3 protease and found to be stable throughout the simulation. Therefore it is evident that interaction with the catalytic triad playing a vital role in the inhibition of the enzyme activity as a result inhibition of the virus propagation. However these compounds can be explored further for understanding the mechanism of action of these compounds targeting NS2B-NS3 protease for inhibition of Zika virus.

Objective: The purpose of the review is to portray the theoretical concept on neurological disorders from research data. Background: The freak changes in chemical response of nerve impulse causes neurological disorders. The research evidence of the effort done in the older history suggests that the biological drug targets and their effective feature with responsive drugs could be valuable in promoting the future development of health statistics structure for improved treatment for curing the nervous disorders. Methods: In this review, we summarized the most iterative theoretical concept of structure based drug design approaches in various neurological disorders to unfathomable understanding of reported information for future drug design and development. Results: On the premise of reported information we analyzed the model of theoretical drug designing process for understanding the mechanism and pathology of the neurological diseases which covers the development of potentially effective inhibitors against the biological drug targets. Finally, it also suggests the management and implementation of the current treatment in improving the human health system behaviors. Conclusion: With the survey of reported information we concluded the development strategies of diagnosis and treatment against neurological diseases which leads to supportive progress in the drug discovery. Keywords: Neurological disorders, Computational Aided drug design, Structure based drug design, Targets, Drug delivery

The pandemic, caused by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARSCoV- 2), is responsible for multiple worldwide lockdowns, an economic crisis, and a substantial increase in hospitalizations for viral pneumonia along with respiratory failure and multiorgan dysfunctions. Recently, the first few vaccines were approved by World Health Organization (WHO) and can eventually save millions of lives. Even though, few drugs are used in emergency like Remdesivir and several other repurposed drugs, still there is no approved drug for COVID-19. The coronaviral encoded proteins involved in host-cell entry, replication, and host-cell invading mechanism are potential therapeutic targets. This perspective review provides the molecular overview of SARS-CoV-2 life cycle for summarizing potential drug targets, structural insights, active site contour map analyses of those selected SARS-CoV-2 protein targets for drug discovery, immunology, and pathogenesis.

Abstract Background RNA binding proteins (RBPs) are the proteins that bind RNAs and regulate their functioning. RBPs in mosquitoes are gaining attention due to their ability to bind flaviviruses and regulate their replication and transmission. Despite their relevance, RBPs in mosquitoes have not been explored much. In this study, we screened the whole genome of Aedes aegypti, the primary vector of several pathogenic viruses, and identified the proteins containing RNA recognition motif (RRM), the most abundant protein domain in eukaryotes. Results Using several in-silico strategies, a total of 135 RRM containing RBPs were identified in Ae. aegypti . The proteins were characterized based on their available annotations and the sequence similarity with the Drosophila melanogaster . Ae. aegypti RRM containing RBPs included serine/arginine-rich (SR) proteins, polyadenylate binding proteins (PABP), heteronuclear ribonucleoproteins (hnRNP), small nuclear ribonucleoproteins (snRNP), splicing factors, eukaryotic initiation factors, transformers, nucleolysins, etc . Phylogenetic analysis revealed that the proteins and the domain organisation is conserved among Ae. aegypti , Bombyx mori and Drosophila melanogaster . However, the gene length and the intron-exon organisation varied across the insect species. Expression analysis of the genes encoding RBPs using publicly available RNA sequencing data for different developmental time points of the mosquito life cycle starting from the ovary and eggs up to the adults revealed stage-specific expression with several genes preferentially expressed in early embryonic stages and blood-fed female ovary. Conclusions This is the first database for the Ae. aegypti RBPs that can serve as the reference base for future investigations. The stage-specific genes can be further explored to determine their role in mosquito growth and development with a focus to develop novel mosquito control strategies.

Since 2007, repeated outbreaks of Zika virus (ZIKV) has affected millions of people worldwide and created global health concern with major complications like microcephaly and Guillain Barre syndrome. Generally, ZIKV transmits through mosquitoes (Aedes aegypti) like other flaviviruses, but reports show blood transfusion and sexual mode of ZIKV transmission which further makes the situation alarming. Till date, there is not a single Zika specific licensed drug or vaccine present in the market. However, in recent months, several antiviral molecules have been screened against viral and host proteins. Among those, -Epigallocatechin-3-gallate (EGCG), a green tea polyphenol has shown great virucidal potential against flaviviruses including ZIKV. However, the mechanistic understanding of EGCG targeting viral proteins is not yet entirely deciphered except little is known about its interaction with viral envelope protein and viral protease. Since literature has shown significant inhibitory interactions of EGCG against various kinases and bacterial DNA gyrases; we designed our study to find inhibitory actions of EGCG against ZIKV NS3 helicase. NS3 helicase is playing a significant role in viral replication by unwinding RNA after hydrolyzing NTP. We employed molecular docking and simulation approach and found significant interactions at ATPase site and also at RNA binding site. Further, the enzymatic assay has shown significant inhibition of NTPase activity with an IC50 value of 295.7 nM and Ki of 0.387 (error 0.034) micromolar. Our study suggests the possibility that EGCG could be considered as prime backbone molecule for further broad-spectrum and multitargeted inhibitor development against ZIKV and other flaviviruses.