NM
N. McKenzie
Author with expertise in Soil Erosion and Agricultural Sustainability
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(40% Open Access)
Cited by:
2,202
h-index:
31
/
i10-index:
49
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Spatial prediction of soil properties using environmental correlation

N. McKenzie et al.Apr 1, 1999
Conventional survey methods have efficiencies in medium to low intensity survey because they use relationships between soil properties and more readily observable environmental features as a basis for mapping. However, the implicit predictive models are qualitative, complex and rarely communicated in a clear manner. The possibility of developing an explicit analogue of conventional survey practice suited to medium to low intensity surveys is considered. A key feature is the use of quantitative environmental variables from digital terrain analysis and airborne gamma radiometric remote sensing to predict the spatial distribution of soil properties. The use of these technologies for quantitative soil survey is illustrated using an example from the Bago and Maragle State Forests in southeastern Australia. A design-based, stratified, two-stage sampling scheme was adopted for the 50,000 ha area using digital geology, landform and climate as stratifying variables. The landform and climate variables were generated using a high resolution digital elevation model with a grid size of 25 m. Site and soil data were obtained from 165 sites. Regression trees and generalised linear models were then used to generate spatial predictions of soil properties using digital terrain and gamma radiometric survey data as explanatory variables. The resulting environmental correlation models generate spatial predictions with a fine grain unmatched by comparable conventional survey methods. Example models and spatial predictions are presented for soil profile depth, total phosphorus and total carbon. The models account for 42%, 78% and 54% of the variance present in the sample respectively. The role of spatial dependence, issues of scale and landscape complexity are discussed along with the capture of expert knowledge. It is suggested that environmental correlation models may form a useful trend model for various forms of kriging if spatial dependence is evident in the residuals of the model.
0
Paper
Citation647
0
Save
0

Reduced chromatin accessibility underlies gene expression differences in homologous chromosome arms of hexaploid wheat and diploidAegilops tauschii

Fu-Hao Lu et al.Mar 7, 2019
Abstract Polyploidy has been centrally important in driving the evolution of plants, and leads to alterations in gene expression that are thought to underlie the emergence of new traits. Despite the common occurrence of these global patterns of altered gene expression in polyploids, the mechanisms involved are not well understood. Using a precise framework of highly conserved syntenic genes on hexaploid wheat chromosome 3DL and its progenitor 3L chromosome arm of diploid Aegilops tauschii , we show that 70% of these genes exhibited proportionally reduced gene expression, in which expression in the hexaploid context of the 3DL genes was approximately 40% of the levels observed in diploid Ae. tauschii. Many genes showing elevated expression during later stages of grain development in wheat compared to Ae. tauschii. Gene sequence and methylation differences accounted for only a few cases of differences in gene expression. In contrast, large scale patterns of reduced chromatin accessibility of genes in the hexaploid chromosome arm compared to its diploid progenitor were correlated with observed overall reduction in gene expression and differential gene expression. Therefore, that an overall reduction in accessible chromatin underlies the major differences in gene expression that results from polyploidization.
0
Citation4
0
Save