VB
Véronique Becette
Author with expertise in Microarray Data Analysis and Gene Expression Profiling
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(33% Open Access)
Cited by:
1,319
h-index:
24
/
i10-index:
43
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Identification of molecular apocrine breast tumours by microarray analysis

Pierre Farmer et al.May 9, 2005
Previous microarray studies on breast cancer identified multiple tumour classes, of which the most prominent, named luminal and basal, differ in expression of the oestrogen receptor α gene (ER). We report here the identification of a group of breast tumours with increased androgen signalling and a ‘molecular apocrine’ gene expression profile. Tumour samples from 49 patients with large operable or locally advanced breast cancers were tested on Affymetrix U133A gene expression microarrays. Principal components analysis and hierarchical clustering split the tumours into three groups: basal, luminal and a group we call molecular apocrine. All of the molecular apocrine tumours have strong apocrine features on histological examination (P=0.0002). The molecular apocrine group is androgen receptor (AR) positive and contains all of the ER-negative tumours outside the basal group. Kolmogorov–Smirnov testing indicates that oestrogen signalling is most active in the luminal group, and androgen signalling is most active in the molecular apocrine group. ERBB2 amplification is commoner in the molecular apocrine than the other groups. Genes that best split the three groups were identified by Wilcoxon test. Correlation of the average expression profile of these genes in our data with the expression profile of individual tumours in four published breast cancer studies suggest that molecular apocrine tumours represent 8–14% of tumours in these studies. Our data show that it is possible with microarray data to divide mammary tumour cells into three groups based on steroid receptor activity: luminal (ER+ AR+), basal (ER− AR−) and molecular apocrine (ER− AR+).
0
Citation723
0
Save
0

Centrosome amplification favours survival and impairs ovarian cancer progression

Jean‐Philippe Morretton et al.Apr 30, 2019
Centrosome amplification has been described as a common feature of human cancers and it is known to promote tumorigenesis when induced in animals. However, little is known about the real status of centrosome numbers in human cancers and whether numerical alterations are solely associated with poor prognosis. To address this question, we have analyzed a large cohort of human epithelial ovarian cancers (EOCs) from 100 patients using state-of-the-art microscopy to determine the Centrosome-Nucleus Index (CNI) of each tumor. We found that EOCs are highly heterogeneous, with infrequent but strong centrosome amplifications leading to higher CNI than in healthy tissues. Strikingly, while a correlation between CNI and genomic alterations, such as aneuploidy or chromosome rearrangements could not be established, we found that high CNI correlates with increased patient survival and sensitivity to chemotherapy. Using ovarian cancer cellular models to manipulate centrosome numbers and Patient-Derived Xenografts (PDXs), we found that higher CNIs can positively impact the response to chemotherapy and inhibit cell dissemination. Our findings highlight a novel paradigm linking centrosome amplification to the inhibition of tumor progression.